Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316WBH6

Protein Details
Accession A0A316WBH6    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-171AEARKLRKANRDPKAPKRPPBasic
284-312GEQISSKKRSKEEKQAKKEARKQSKMHKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-170GHGGRRPLSKEEKAEARKLRKANRDPKAPKRP
290-312KKRSKEEKQAKKEARKQSKMHKV
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MEGYNNWALGVAPPPPHHSSHHQHHQGHPHAQHPQHGGHQNYALDAGQQEIAQARSAMIESVAHISSSLRAAATQCDSFVKIVAKHHPTSAAAAIANMGNEFLALASSAGAGALAAQTGLNASGVSGQSAAPPTTPGPGHGGRRPLSKEEKAEARKLRKANRDPKAPKRPPSAYLLFQNEVRDDMRKRHPELTYAEILSKISEAWKALTDNQRQVYHDKTVEAMARWGVEKKAHAGDTSGAPESFGAEYGTGENGYGGDDAAQAASQAVGGMDWSSVPTSALSGEQISSKKRSKEEKQAKKEARKQSKMHKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.31
4 0.35
5 0.41
6 0.46
7 0.52
8 0.61
9 0.65
10 0.66
11 0.7
12 0.75
13 0.75
14 0.74
15 0.66
16 0.62
17 0.61
18 0.59
19 0.58
20 0.52
21 0.47
22 0.47
23 0.52
24 0.48
25 0.42
26 0.44
27 0.38
28 0.34
29 0.32
30 0.24
31 0.17
32 0.15
33 0.13
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.12
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.2
70 0.28
71 0.32
72 0.32
73 0.33
74 0.32
75 0.3
76 0.3
77 0.27
78 0.2
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.07
85 0.06
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.14
125 0.17
126 0.2
127 0.22
128 0.27
129 0.26
130 0.31
131 0.32
132 0.32
133 0.35
134 0.35
135 0.35
136 0.34
137 0.41
138 0.39
139 0.44
140 0.46
141 0.45
142 0.47
143 0.5
144 0.55
145 0.56
146 0.63
147 0.65
148 0.66
149 0.71
150 0.73
151 0.78
152 0.82
153 0.79
154 0.76
155 0.74
156 0.7
157 0.61
158 0.61
159 0.54
160 0.45
161 0.44
162 0.42
163 0.35
164 0.33
165 0.31
166 0.25
167 0.22
168 0.2
169 0.18
170 0.16
171 0.21
172 0.29
173 0.33
174 0.37
175 0.42
176 0.42
177 0.42
178 0.44
179 0.43
180 0.37
181 0.32
182 0.29
183 0.23
184 0.22
185 0.17
186 0.14
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.12
194 0.17
195 0.25
196 0.29
197 0.33
198 0.38
199 0.39
200 0.39
201 0.4
202 0.38
203 0.35
204 0.32
205 0.27
206 0.23
207 0.23
208 0.24
209 0.21
210 0.18
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.18
219 0.22
220 0.22
221 0.21
222 0.2
223 0.21
224 0.21
225 0.23
226 0.21
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.15
231 0.13
232 0.11
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.14
273 0.17
274 0.21
275 0.28
276 0.34
277 0.39
278 0.46
279 0.55
280 0.6
281 0.69
282 0.76
283 0.8
284 0.83
285 0.88
286 0.9
287 0.91
288 0.91
289 0.91
290 0.91
291 0.89
292 0.87