Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DVM4

Protein Details
Accession A0A0D1DVM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-237SATTSTSKPRRGRPRSRSPSTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-229PRRGRPR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG uma:UMAG_10352  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MSRRSSRLSGNLDASFSSNPLTQRTTLSTEAGPSKLPSRCDTETSLPYFEEWSTEDLQAEVKRYGFKVSRKRTTLIDQLKAVYEALHQSNAKFELPATTLHSDNEVTPAETLKVPRMMRKLVLPDRAITAGAAAVNGERKGKGRKSDPFVLDASSESDASGSSRTIIEAATTEASAGAEEEAGEITVQLEAEALSATDGSLSPSPSLGSNASCLSATTSTSKPRRGRPRSRSPSTSSSSDIPLALAVSESTEVAVEPTPALAETMTRAIRGNSAVWERILRYEPISFDELVSIATQNGLEMDMGKRKEELKTWLDRQCICFFSNDLTGPRSRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.23
4 0.2
5 0.17
6 0.17
7 0.2
8 0.23
9 0.22
10 0.25
11 0.29
12 0.31
13 0.3
14 0.31
15 0.28
16 0.3
17 0.31
18 0.29
19 0.26
20 0.23
21 0.28
22 0.29
23 0.31
24 0.3
25 0.34
26 0.36
27 0.39
28 0.43
29 0.43
30 0.45
31 0.45
32 0.44
33 0.36
34 0.34
35 0.31
36 0.25
37 0.2
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.19
45 0.18
46 0.2
47 0.18
48 0.17
49 0.19
50 0.19
51 0.26
52 0.28
53 0.35
54 0.43
55 0.52
56 0.6
57 0.61
58 0.63
59 0.61
60 0.62
61 0.63
62 0.61
63 0.55
64 0.47
65 0.45
66 0.43
67 0.39
68 0.32
69 0.22
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.17
74 0.16
75 0.16
76 0.19
77 0.21
78 0.2
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.18
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.2
89 0.17
90 0.16
91 0.17
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.18
101 0.19
102 0.24
103 0.27
104 0.28
105 0.28
106 0.31
107 0.37
108 0.36
109 0.41
110 0.37
111 0.34
112 0.34
113 0.33
114 0.29
115 0.2
116 0.14
117 0.09
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.1
127 0.17
128 0.21
129 0.27
130 0.32
131 0.39
132 0.45
133 0.53
134 0.51
135 0.48
136 0.44
137 0.39
138 0.32
139 0.25
140 0.2
141 0.13
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.15
206 0.23
207 0.27
208 0.36
209 0.39
210 0.48
211 0.58
212 0.65
213 0.74
214 0.76
215 0.83
216 0.84
217 0.87
218 0.83
219 0.79
220 0.75
221 0.69
222 0.62
223 0.53
224 0.45
225 0.39
226 0.34
227 0.28
228 0.2
229 0.15
230 0.12
231 0.09
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.15
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.2
261 0.21
262 0.21
263 0.23
264 0.22
265 0.24
266 0.26
267 0.22
268 0.21
269 0.22
270 0.22
271 0.24
272 0.26
273 0.22
274 0.2
275 0.19
276 0.16
277 0.14
278 0.14
279 0.1
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.11
289 0.17
290 0.18
291 0.19
292 0.21
293 0.23
294 0.27
295 0.31
296 0.35
297 0.36
298 0.44
299 0.51
300 0.55
301 0.58
302 0.58
303 0.59
304 0.57
305 0.52
306 0.44
307 0.39
308 0.34
309 0.32
310 0.33
311 0.31
312 0.28
313 0.29