Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VZU9

Protein Details
Accession A0A316VZU9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-92GRRTNTREVRYRKKLDQERVDLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR015096  FUBP_C  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09005  DUF1897  
PF00013  KH_1  
PF16275  SF1-HH  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd02395  KH-I_BBP  
Amino Acid Sequences RKRRSRWGAAPADAPAGVATALGANLSAAELDRYAINVRIAEIQQKLVTGNVVPPERERSPSPPPTYDGAGRRTNTREVRYRKKLDQERVDLIDRAVKLDPNYKPPADYHVAKRNMRPQEKVWLPIKEFPEINFFGLLVGPRGNTLKGMERESGAKISIRGRGSVKEGKGRPGEEEDEEMHCIVQADDLEKIKVCIKAIQRVIEVAASTPEAQNDHKRNQLRELAALNGTLRDDEGQICQNCGQKGHRRYACPEERNVTAHIICHRCGGQGHLARDCTQMPGPRGFGGGPPGPGGPGGPNGQGGQMDSEYASLMAELGEGGAGGGRPGGPQAGGMPGQKYDANGKKIPPWRDPEMWNPPGVGGRMGGPGGPGYGGRPMGQGGQQGGYGNYQQQYPAQAGQDGQPDYSAAWAEYYAQQAAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.24
3 0.16
4 0.12
5 0.08
6 0.07
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.04
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.04
16 0.05
17 0.05
18 0.06
19 0.07
20 0.08
21 0.1
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.19
27 0.2
28 0.24
29 0.24
30 0.24
31 0.23
32 0.23
33 0.22
34 0.18
35 0.18
36 0.14
37 0.15
38 0.19
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.29
43 0.3
44 0.33
45 0.34
46 0.34
47 0.42
48 0.5
49 0.54
50 0.5
51 0.51
52 0.5
53 0.51
54 0.51
55 0.46
56 0.43
57 0.44
58 0.42
59 0.44
60 0.45
61 0.49
62 0.49
63 0.51
64 0.55
65 0.57
66 0.67
67 0.72
68 0.76
69 0.74
70 0.78
71 0.8
72 0.81
73 0.81
74 0.77
75 0.73
76 0.7
77 0.65
78 0.55
79 0.46
80 0.41
81 0.31
82 0.27
83 0.22
84 0.19
85 0.19
86 0.26
87 0.28
88 0.31
89 0.36
90 0.34
91 0.34
92 0.33
93 0.38
94 0.36
95 0.37
96 0.38
97 0.42
98 0.5
99 0.51
100 0.55
101 0.57
102 0.61
103 0.61
104 0.58
105 0.51
106 0.54
107 0.54
108 0.56
109 0.53
110 0.48
111 0.46
112 0.48
113 0.47
114 0.4
115 0.38
116 0.32
117 0.33
118 0.28
119 0.26
120 0.2
121 0.18
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.16
134 0.19
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.17
142 0.15
143 0.14
144 0.16
145 0.21
146 0.2
147 0.21
148 0.22
149 0.23
150 0.28
151 0.32
152 0.31
153 0.34
154 0.35
155 0.38
156 0.4
157 0.39
158 0.35
159 0.32
160 0.32
161 0.25
162 0.26
163 0.21
164 0.19
165 0.19
166 0.17
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.16
183 0.18
184 0.25
185 0.27
186 0.28
187 0.26
188 0.25
189 0.24
190 0.19
191 0.17
192 0.1
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.17
201 0.21
202 0.23
203 0.29
204 0.32
205 0.34
206 0.37
207 0.41
208 0.34
209 0.33
210 0.31
211 0.26
212 0.23
213 0.21
214 0.17
215 0.11
216 0.1
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.08
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.25
231 0.29
232 0.34
233 0.42
234 0.44
235 0.44
236 0.48
237 0.56
238 0.6
239 0.54
240 0.53
241 0.47
242 0.44
243 0.43
244 0.4
245 0.32
246 0.23
247 0.22
248 0.25
249 0.24
250 0.22
251 0.22
252 0.2
253 0.19
254 0.19
255 0.2
256 0.22
257 0.25
258 0.27
259 0.28
260 0.28
261 0.28
262 0.3
263 0.28
264 0.22
265 0.2
266 0.22
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.23
272 0.2
273 0.18
274 0.19
275 0.17
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.09
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.15
325 0.15
326 0.16
327 0.22
328 0.28
329 0.33
330 0.35
331 0.37
332 0.43
333 0.51
334 0.55
335 0.53
336 0.53
337 0.54
338 0.56
339 0.59
340 0.6
341 0.62
342 0.58
343 0.52
344 0.45
345 0.39
346 0.36
347 0.33
348 0.24
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.16
366 0.18
367 0.2
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.17
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.2
381 0.21
382 0.23
383 0.21
384 0.21
385 0.22
386 0.24
387 0.29
388 0.27
389 0.25
390 0.21
391 0.2
392 0.19
393 0.19
394 0.16
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.12
399 0.14
400 0.17