Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316W5C9

Protein Details
Accession A0A316W5C9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-95EDSPASNKRKDPPGKRKRLMDSFAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-89KRKDPPGKRKR
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_nucl 6, nucl 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSTGGGLGAKSASKTSNAPRAPAFSSAKLATATAPLRPSGAGIGAGFGSATPSKSAVLPAGRVGAFGTEEEEDSPASNKRKDPPGKRKRLMDSFAGELARDQAERESRLKERIGAEGTSVSSLLAAESAPKGGSRPDTSDMTTTNVCVTNLPAEVPEAALGRFFSRWGDVGTAKIMYPREREANRQGLVGFVSYMKRSDAEYALREADGILWTGAGSFSGGPILRTGWGKAMPLPPTACFLQPSSAKIASSTARGASPTSTTVRARQRSPGSGPVPHRKPRPTASGSMPDLIKQVEEAVGAPGMELIRDVAKRVVDHGDGYYLKAMRDNGTTDVKDKFAFMWDENLPAYHYYRTLVDPDHLPIIDAPPFADDGYLSLYSSDSEEGSEVERQRKLQKTDTLGPIARRRLEAMLRSITSRRERIARVMCFALERGAAADQISEVLVASLLQPGTPLARKLARLHAVSDILHNSAVPLPNAWKYRAALEARLDAAFVHLGQTARVLGGRIRQEGFKEQVRSVLMLWEEWLVFPPDVCKRFRVKLDGNEEAHKEEHTPAKESAPDEDMRQGSSEGASTRIRPAAHSGHVPLLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.29
3 0.37
4 0.38
5 0.41
6 0.42
7 0.45
8 0.45
9 0.47
10 0.44
11 0.36
12 0.4
13 0.37
14 0.36
15 0.32
16 0.29
17 0.23
18 0.24
19 0.23
20 0.21
21 0.22
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.15
27 0.15
28 0.13
29 0.11
30 0.12
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.07
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.17
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.23
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.16
52 0.14
53 0.13
54 0.14
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.13
62 0.17
63 0.22
64 0.26
65 0.3
66 0.37
67 0.47
68 0.56
69 0.65
70 0.7
71 0.76
72 0.83
73 0.86
74 0.87
75 0.86
76 0.86
77 0.79
78 0.74
79 0.66
80 0.58
81 0.54
82 0.45
83 0.36
84 0.27
85 0.25
86 0.19
87 0.15
88 0.13
89 0.15
90 0.19
91 0.23
92 0.25
93 0.28
94 0.31
95 0.36
96 0.36
97 0.37
98 0.34
99 0.36
100 0.36
101 0.31
102 0.29
103 0.25
104 0.24
105 0.2
106 0.17
107 0.11
108 0.08
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.15
121 0.17
122 0.21
123 0.24
124 0.27
125 0.29
126 0.3
127 0.28
128 0.27
129 0.24
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.15
162 0.17
163 0.17
164 0.19
165 0.21
166 0.28
167 0.29
168 0.36
169 0.4
170 0.45
171 0.43
172 0.41
173 0.37
174 0.3
175 0.29
176 0.22
177 0.15
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.13
195 0.1
196 0.08
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.15
218 0.18
219 0.18
220 0.2
221 0.21
222 0.19
223 0.21
224 0.22
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.18
235 0.2
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.15
248 0.15
249 0.22
250 0.29
251 0.32
252 0.33
253 0.38
254 0.39
255 0.4
256 0.42
257 0.43
258 0.38
259 0.4
260 0.44
261 0.46
262 0.49
263 0.51
264 0.54
265 0.49
266 0.52
267 0.5
268 0.53
269 0.47
270 0.45
271 0.43
272 0.45
273 0.42
274 0.4
275 0.35
276 0.27
277 0.24
278 0.2
279 0.15
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.13
302 0.11
303 0.12
304 0.11
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.12
310 0.11
311 0.13
312 0.13
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.16
324 0.13
325 0.12
326 0.14
327 0.12
328 0.15
329 0.15
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.13
348 0.13
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.12
374 0.14
375 0.18
376 0.19
377 0.22
378 0.29
379 0.36
380 0.39
381 0.42
382 0.46
383 0.49
384 0.55
385 0.57
386 0.54
387 0.5
388 0.5
389 0.49
390 0.47
391 0.42
392 0.35
393 0.33
394 0.31
395 0.33
396 0.31
397 0.3
398 0.3
399 0.29
400 0.3
401 0.3
402 0.33
403 0.34
404 0.33
405 0.31
406 0.33
407 0.34
408 0.41
409 0.47
410 0.43
411 0.41
412 0.39
413 0.37
414 0.32
415 0.3
416 0.22
417 0.13
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.1
439 0.12
440 0.12
441 0.14
442 0.18
443 0.21
444 0.25
445 0.33
446 0.36
447 0.35
448 0.36
449 0.36
450 0.35
451 0.32
452 0.31
453 0.24
454 0.19
455 0.17
456 0.15
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.21
464 0.24
465 0.25
466 0.25
467 0.25
468 0.27
469 0.33
470 0.32
471 0.31
472 0.31
473 0.32
474 0.3
475 0.29
476 0.26
477 0.19
478 0.18
479 0.14
480 0.11
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.16
492 0.21
493 0.23
494 0.24
495 0.26
496 0.29
497 0.35
498 0.38
499 0.39
500 0.38
501 0.35
502 0.38
503 0.38
504 0.35
505 0.29
506 0.28
507 0.22
508 0.18
509 0.19
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.14
514 0.13
515 0.12
516 0.12
517 0.17
518 0.24
519 0.28
520 0.29
521 0.33
522 0.37
523 0.45
524 0.51
525 0.55
526 0.55
527 0.61
528 0.67
529 0.7
530 0.67
531 0.65
532 0.6
533 0.54
534 0.46
535 0.37
536 0.31
537 0.28
538 0.32
539 0.3
540 0.32
541 0.31
542 0.34
543 0.38
544 0.37
545 0.36
546 0.32
547 0.31
548 0.29
549 0.34
550 0.31
551 0.27
552 0.28
553 0.24
554 0.21
555 0.2
556 0.2
557 0.14
558 0.17
559 0.19
560 0.19
561 0.23
562 0.26
563 0.26
564 0.25
565 0.32
566 0.34
567 0.36
568 0.39
569 0.37