FuNGI

A0A316VSN4

Protein Details

Accession

A0A316VSN4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
454-479	AELSKKARKKAAKKARKKAEKADPSL	Basic
499-522	AHLPHPPPERPQKRQKRRETMLYM	Hydrophilic
1128-1152	LREADENEKKKERRREERCKVLYLG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
458-516	KKARKKAAKKARKKAEKADPSLKQKRRIKPGQAIPHPSASWAHLPHPPPERPQKRQKRR
722-726	KQKKR
1137-1140	KKER

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.166, nucl 10, cyto 10, cyto_mito 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR019039 T4-Rnl1-like_N IPR015966 tRNA_lig_kin_fungi IPR015965 tRNA_lig_PDEase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003972 F:RNA ligase (ATP) activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF09511 RNA_lig_T4_1 PF08302 tRNA_lig_CPD PF08303 tRNA_lig_kinase

Amino Acid Sequences

MSKHASTSAAASFDHSSVASSATATQLVEALQKHASKTAKPLVHGSAYSIPLQHNRPHPDSNTKASTPRTSECILTSWKVSEFAYRKVEVVSLEEDADIPTLARGLFTAAADMESEGKGETKRERIVARGYDKFFNVDEMRWTKRPSLEAHSTAPYLLTFKENGCIILISALTPDQLVVCSKHSVGDRDNVELSHAKAGEAWVDRHLERVGRKRQELAKELWDRRCTAVAELCDDSFEEHVLAYAPSRTGLHLHGLNHNTVHFSTEPMDVVASFAQAWGFIPPRWKTFHSLKTLFAFTDQVSETGSWEGEAIEGFVVRTSMPLATHRSITTTTTTTTTPPSALPTILSKPPYNPGQAWFFKIKFEEPYLMYRDWRELTRTMIRSQKKWAQENKFDLDDALSGKWKDLHVEAAEDASEILEEVGPKQQDEVDDAEQPQDVAGEEELEEATSTSDAELSKKARKKAAKKARKKAEKADPSLKQKRRIKPGQAIPHPSASWAHLPHPPPERPQKRQKRRETMLYMDWVWEKLYGKEDGSALPDRGVFEGYAENRGIVASREAFLRYLNSEEGKKRLGELDPGSERKTLERGKRSMDERPFTHTVVVPVAVPGCGKTILSIALADLLSQTVADSQTDDMSSSTKGAALDTPLRVSHVQADNMTTKKTGPAFLQAVTVELNEGKNVVIADRNNHLLKHRRELVDEVRKWEEKVHKTSLDKARGQAQKQKKRGSAAPLAAKNDVLRDEIAAPRVRLVALPWDLDDLALNAVHRLCSDRITQRGDNHQSLRADPQGASGSSDHEGVLWRFLDDWQSFQAGPLDDTVADEADLAFDESIRMGVDAEEEGNLKQAFEAISQILEVRFGDAQLGPEGKSRRIHDALKRAKEYKVDVLKPARAIHSQVARSQAPSKAPRYYGISVELNSFTALKQRLARHASTSALHAEALDMLEKLHRDNRIVKTPHITLVHSSDLHKNQGAEESAKSEAARRKWKRYEELCSGGGSGGGTGSSAGVAADAPDSQRIRKSPPPPDFDIVLDRLAWQSGRAMAFGVCKAGKGRLFSADMPDFEEVQCGLRIASSVMMPEERRGDKEEDGAGRASSKSTTTTTIMQDWTPHVTVGTANESIRPFEAHAVLREADENEKKKERRREERCKVLYLGGEESIRIRGRLQGMNR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.16
3	0.14
4	0.13
5	0.15
6	0.12
7	0.1
8	0.11
9	0.12
10	0.13
11	0.11
12	0.11
13	0.1
14	0.11
15	0.14
16	0.14
17	0.15
18	0.19
19	0.21
20	0.22
21	0.28
22	0.31
23	0.29
24	0.37
25	0.44
26	0.42
27	0.43
28	0.47
29	0.46
30	0.47
31	0.44
32	0.41
33	0.37
34	0.36
35	0.34
36	0.31
37	0.29
38	0.31
39	0.35
40	0.37
41	0.4
42	0.46
43	0.5
44	0.55
45	0.58
46	0.62
47	0.63
48	0.65
49	0.63
50	0.58
51	0.58
52	0.57
53	0.59
54	0.54
55	0.51
56	0.48
57	0.43
58	0.42
59	0.38
60	0.37
61	0.34
62	0.31
63	0.3
64	0.27
65	0.27
66	0.26
67	0.25
68	0.3
69	0.29
70	0.34
71	0.38
72	0.36
73	0.36
74	0.35
75	0.36
76	0.27
77	0.27
78	0.22
79	0.18
80	0.17
81	0.16
82	0.16
83	0.14
84	0.14
85	0.1
86	0.08
87	0.06
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.08
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.09
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.1
101	0.08
102	0.09
103	0.08
104	0.1
105	0.11
106	0.15
107	0.2
108	0.26
109	0.29
110	0.35
111	0.37
112	0.39
113	0.46
114	0.51
115	0.53
116	0.54
117	0.53
118	0.51
119	0.5
120	0.48
121	0.4
122	0.38
123	0.32
124	0.26
125	0.3
126	0.32
127	0.37
128	0.39
129	0.42
130	0.41
131	0.43
132	0.46
133	0.43
134	0.46
135	0.48
136	0.48
137	0.49
138	0.47
139	0.43
140	0.39
141	0.34
142	0.26
143	0.19
144	0.16
145	0.14
146	0.13
147	0.13
148	0.17
149	0.17
150	0.17
151	0.16
152	0.15
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.08
157	0.09
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.07
164	0.09
165	0.1
166	0.12
167	0.14
168	0.14
169	0.18
170	0.21
171	0.24
172	0.25
173	0.31
174	0.3
175	0.32
176	0.33
177	0.28
178	0.29
179	0.27
180	0.25
181	0.23
182	0.21
183	0.17
184	0.17
185	0.18
186	0.2
187	0.2
188	0.2
189	0.17
190	0.21
191	0.21
192	0.23
193	0.24
194	0.23
195	0.28
196	0.36
197	0.44
198	0.48
199	0.5
200	0.55
201	0.61
202	0.64
203	0.63
204	0.58
205	0.58
206	0.6
207	0.64
208	0.65
209	0.61
210	0.54
211	0.51
212	0.51
213	0.42
214	0.36
215	0.34
216	0.28
217	0.29
218	0.28
219	0.26
220	0.22
221	0.21
222	0.18
223	0.13
224	0.12
225	0.08
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.1
236	0.11
237	0.12
238	0.16
239	0.18
240	0.2
241	0.26
242	0.28
243	0.28
244	0.27
245	0.26
246	0.23
247	0.19
248	0.21
249	0.14
250	0.14
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.13
255	0.13
256	0.1
257	0.11
258	0.09
259	0.08
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.06
265	0.08
266	0.1
267	0.1
268	0.18
269	0.2
270	0.24
271	0.28
272	0.3
273	0.34
274	0.41
275	0.48
276	0.5
277	0.5
278	0.5
279	0.49
280	0.48
281	0.42
282	0.34
283	0.28
284	0.19
285	0.2
286	0.17
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.07
309	0.1
310	0.16
311	0.17
312	0.19
313	0.19
314	0.2
315	0.21
316	0.22
317	0.22
318	0.18
319	0.18
320	0.17
321	0.18
322	0.17
323	0.19
324	0.18
325	0.16
326	0.15
327	0.17
328	0.16
329	0.16
330	0.15
331	0.16
332	0.19
333	0.22
334	0.24
335	0.22
336	0.22
337	0.27
338	0.29
339	0.29
340	0.27
341	0.26
342	0.31
343	0.32
344	0.35
345	0.34
346	0.31
347	0.3
348	0.31
349	0.29
350	0.25
351	0.25
352	0.25
353	0.21
354	0.25
355	0.27
356	0.27
357	0.26
358	0.24
359	0.25
360	0.23
361	0.23
362	0.22
363	0.19
364	0.24
365	0.3
366	0.32
367	0.33
368	0.39
369	0.42
370	0.41
371	0.48
372	0.49
373	0.48
374	0.54
375	0.6
376	0.6
377	0.64
378	0.68
379	0.64
380	0.58
381	0.51
382	0.42
383	0.33
384	0.26
385	0.19
386	0.13
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.13
391	0.13
392	0.13
393	0.13
394	0.16
395	0.14
396	0.15
397	0.15
398	0.13
399	0.13
400	0.11
401	0.1
402	0.06
403	0.05
404	0.03
405	0.03
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.12
416	0.15
417	0.14
418	0.15
419	0.16
420	0.16
421	0.15
422	0.14
423	0.11
424	0.08
425	0.06
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.07
442	0.1
443	0.13
444	0.21
445	0.26
446	0.3
447	0.36
448	0.44
449	0.52
450	0.6
451	0.68
452	0.71
453	0.77
454	0.84
455	0.87
456	0.89
457	0.85
458	0.83
459	0.83
460	0.81
461	0.77
462	0.76
463	0.72
464	0.72
465	0.77
466	0.73
467	0.73
468	0.72
469	0.73
470	0.75
471	0.76
472	0.74
473	0.73
474	0.76
475	0.76
476	0.74
477	0.72
478	0.64
479	0.58
480	0.5
481	0.41
482	0.33
483	0.24
484	0.22
485	0.17
486	0.18
487	0.19
488	0.21
489	0.26
490	0.31
491	0.31
492	0.33
493	0.43
494	0.49
495	0.52
496	0.61
497	0.68
498	0.72
499	0.81
500	0.86
501	0.85
502	0.83
503	0.84
504	0.79
505	0.72
506	0.65
507	0.57
508	0.47
509	0.37
510	0.32
511	0.23
512	0.18
513	0.14
514	0.12
515	0.1
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.13
520	0.13
521	0.12
522	0.14
523	0.15
524	0.12
525	0.12
526	0.12
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.08
531	0.07
532	0.1
533	0.1
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.09
540	0.06
541	0.07
542	0.06
543	0.06
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.1
552	0.11
553	0.13
554	0.15
555	0.17
556	0.17
557	0.16
558	0.15
559	0.16
560	0.16
561	0.17
562	0.17
563	0.2
564	0.22
565	0.23
566	0.24
567	0.23
568	0.22
569	0.19
570	0.24
571	0.25
572	0.28
573	0.34
574	0.35
575	0.38
576	0.43
577	0.44
578	0.46
579	0.46
580	0.43
581	0.37
582	0.42
583	0.4
584	0.36
585	0.34
586	0.27
587	0.22
588	0.18
589	0.17
590	0.1
591	0.08
592	0.08
593	0.07
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.05
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.03
614	0.04
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.09
631	0.11
632	0.11
633	0.12
634	0.11
635	0.13
636	0.13
637	0.13
638	0.17
639	0.17
640	0.18
641	0.17
642	0.2
643	0.21
644	0.22
645	0.22
646	0.16
647	0.13
648	0.15
649	0.16
650	0.15
651	0.13
652	0.18
653	0.18
654	0.18
655	0.2
656	0.16
657	0.16
658	0.14
659	0.13
660	0.08
661	0.07
662	0.07
663	0.05
664	0.06
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.08
670	0.08
671	0.11
672	0.12
673	0.16
674	0.16
675	0.17
676	0.21
677	0.28
678	0.3
679	0.35
680	0.4
681	0.38
682	0.39
683	0.43
684	0.48
685	0.49
686	0.47
687	0.44
688	0.42
689	0.41
690	0.4
691	0.41
692	0.4
693	0.36
694	0.4
695	0.42
696	0.42
697	0.43
698	0.52
699	0.54
700	0.53
701	0.48
702	0.44
703	0.48
704	0.49
705	0.5
706	0.51
707	0.53
708	0.55
709	0.62
710	0.67
711	0.62
712	0.61
713	0.63
714	0.6
715	0.57
716	0.53
717	0.53
718	0.49
719	0.47
720	0.43
721	0.39
722	0.32
723	0.26
724	0.2
725	0.14
726	0.11
727	0.1
728	0.11
729	0.12
730	0.16
731	0.16
732	0.15
733	0.15
734	0.15
735	0.14
736	0.12
737	0.12
738	0.14
739	0.14
740	0.14
741	0.13
742	0.14
743	0.14
744	0.14
745	0.13
746	0.07
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.09
755	0.09
756	0.11
757	0.17
758	0.21
759	0.26
760	0.32
761	0.35
762	0.36
763	0.45
764	0.49
765	0.49
766	0.46
767	0.46
768	0.41
769	0.39
770	0.38
771	0.31
772	0.26
773	0.21
774	0.22
775	0.19
776	0.18
777	0.19
778	0.15
779	0.15
780	0.14
781	0.15
782	0.12
783	0.1
784	0.12
785	0.1
786	0.12
787	0.1
788	0.09
789	0.1
790	0.1
791	0.16
792	0.14
793	0.15
794	0.14
795	0.16
796	0.16
797	0.16
798	0.19
799	0.13
800	0.13
801	0.12
802	0.12
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.07
807	0.06
808	0.06
809	0.05
810	0.04
811	0.05
812	0.05
813	0.04
814	0.04
815	0.04
816	0.04
817	0.05
818	0.04
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.05
823	0.05
824	0.06
825	0.06
826	0.07
827	0.07
828	0.1
829	0.1
830	0.09
831	0.08
832	0.09
833	0.09
834	0.09
835	0.11
836	0.08
837	0.08
838	0.08
839	0.09
840	0.08
841	0.08
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.09
847	0.08
848	0.1
849	0.11
850	0.12
851	0.11
852	0.16
853	0.18
854	0.21
855	0.26
856	0.27
857	0.32
858	0.37
859	0.43
860	0.46
861	0.54
862	0.6
863	0.63
864	0.66
865	0.61
866	0.59
867	0.56
868	0.53
869	0.51
870	0.51
871	0.45
872	0.47
873	0.49
874	0.49
875	0.48
876	0.46
877	0.4
878	0.33
879	0.34
880	0.33
881	0.35
882	0.34
883	0.33
884	0.36
885	0.34
886	0.35
887	0.35
888	0.33
889	0.33
890	0.37
891	0.39
892	0.39
893	0.4
894	0.4
895	0.43
896	0.42
897	0.37
898	0.36
899	0.33
900	0.29
901	0.3
902	0.27
903	0.21
904	0.19
905	0.17
906	0.12
907	0.16
908	0.17
909	0.18
910	0.23
911	0.27
912	0.35
913	0.39
914	0.41
915	0.39
916	0.39
917	0.39
918	0.33
919	0.32
920	0.26
921	0.21
922	0.2
923	0.15
924	0.13
925	0.11
926	0.1
927	0.09
928	0.07
929	0.06
930	0.08
931	0.09
932	0.11
933	0.15
934	0.17
935	0.2
936	0.28
937	0.35
938	0.43
939	0.46
940	0.46
941	0.48
942	0.48
943	0.51
944	0.45
945	0.39
946	0.32
947	0.33
948	0.34
949	0.29
950	0.3
951	0.31
952	0.32
953	0.34
954	0.33
955	0.29
956	0.26
957	0.29
958	0.29
959	0.24
960	0.22
961	0.21
962	0.2
963	0.21
964	0.2
965	0.22
966	0.26
967	0.33
968	0.43
969	0.47
970	0.57
971	0.65
972	0.73
973	0.77
974	0.78
975	0.79
976	0.76
977	0.75
978	0.65
979	0.57
980	0.49
981	0.39
982	0.31
983	0.22
984	0.13
985	0.07
986	0.06
987	0.05
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.04
992	0.03
993	0.03
994	0.04
995	0.04
996	0.05
997	0.05
998	0.06
999	0.12
1000	0.14
1001	0.16
1002	0.21
1003	0.24
1004	0.3
1005	0.39
1006	0.47
1007	0.52
1008	0.59
1009	0.64
1010	0.65
1011	0.67
1012	0.62
1013	0.55
1014	0.51
1015	0.43
1016	0.35
1017	0.28
1018	0.22
1019	0.19
1020	0.18
1021	0.15
1022	0.11
1023	0.11
1024	0.14
1025	0.15
1026	0.14
1027	0.15
1028	0.15
1029	0.17
1030	0.17
1031	0.2
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.18
1035	0.23
1036	0.24
1037	0.25
1038	0.27
1039	0.28
1040	0.32
1041	0.32
1042	0.38
1043	0.36
1044	0.33
1045	0.32
1046	0.32
1047	0.28
1048	0.24
1049	0.24
1050	0.17
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.12
1054	0.1
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.09
1061	0.11
1062	0.14
1063	0.15
1064	0.18
1065	0.24
1066	0.25
1067	0.27
1068	0.31
1069	0.33
1070	0.32
1071	0.36
1072	0.38
1073	0.34
1074	0.34
1075	0.32
1076	0.28
1077	0.26
1078	0.24
1079	0.21
1080	0.16
1081	0.15
1082	0.16
1083	0.17
1084	0.21
1085	0.22
1086	0.27
1087	0.29
1088	0.32
1089	0.32
1090	0.3
1091	0.3
1092	0.29
1093	0.31
1094	0.27
1095	0.24
1096	0.2
1097	0.18
1098	0.19
1099	0.19
1100	0.21
1101	0.18
1102	0.18
1103	0.22
1104	0.23
1105	0.24
1106	0.24
1107	0.22
1108	0.19
1109	0.2
1110	0.25
1111	0.24
1112	0.26
1113	0.28
1114	0.27
1115	0.26
1116	0.27
1117	0.25
1118	0.28
1119	0.34
1120	0.36
1121	0.39
1122	0.49
1123	0.54
1124	0.61
1125	0.7
1126	0.73
1127	0.76
1128	0.83
1129	0.87
1130	0.88
1131	0.93
1132	0.89
1133	0.84
1134	0.76
1135	0.69
1136	0.63
1137	0.55
1138	0.47
1139	0.39
1140	0.34
1141	0.28
1142	0.26
1143	0.28
1144	0.25
1145	0.22
1146	0.2
1147	0.23
1148	0.29

A0A316VSN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer