Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VQX3

Protein Details
Accession A0A316VQX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-44ANLTMKRKTPERQSPIPRQLFCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-81GRKKR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
Amino Acid Sequences MTLRMVLQITETWMWMWMKGKRANLTMKRKTPERQSPIPRQLFCELWRLADEILETLSVLNALRPTAANDPPAKAMGRKKRRFSSVSMSPSLTPAPAQSPPPVSRASQHSHDKSDNRGGAFGATLDAAPSGSASTSSAAASSAVRSSESSSNLVSGSTSALGSAARDAHNTSISSANVSATPSASKSRQTPRGYVDPAKARREVLHAQLPLAKGRRVAFRQPTKSRSERGPTNGKGSGVQGGAGAGKGGTGGGGGGGSSSNNNNNNQTEEEGETWILAVVMECINNDRNRYVVQDAEDRNSPTVNTTLKAIVPLPESVATLPPQDYAVGQWVMGMYPDTSCFYRAKVLGGGPGLTGRQNPAKLKSRTQELLAKPYQLEFEDDNNRMHEVSAGYVVERP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.24
4 0.24
5 0.32
6 0.37
7 0.44
8 0.45
9 0.52
10 0.6
11 0.64
12 0.71
13 0.72
14 0.76
15 0.76
16 0.77
17 0.77
18 0.78
19 0.78
20 0.76
21 0.76
22 0.77
23 0.81
24 0.85
25 0.86
26 0.77
27 0.71
28 0.67
29 0.61
30 0.53
31 0.5
32 0.4
33 0.33
34 0.33
35 0.29
36 0.25
37 0.22
38 0.2
39 0.12
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.12
53 0.17
54 0.19
55 0.23
56 0.25
57 0.27
58 0.28
59 0.29
60 0.27
61 0.27
62 0.35
63 0.4
64 0.49
65 0.56
66 0.63
67 0.69
68 0.76
69 0.74
70 0.71
71 0.7
72 0.68
73 0.66
74 0.6
75 0.54
76 0.46
77 0.44
78 0.38
79 0.29
80 0.19
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.24
87 0.25
88 0.28
89 0.28
90 0.26
91 0.27
92 0.32
93 0.34
94 0.35
95 0.43
96 0.44
97 0.47
98 0.52
99 0.51
100 0.5
101 0.53
102 0.49
103 0.4
104 0.37
105 0.32
106 0.26
107 0.23
108 0.18
109 0.1
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.14
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.11
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.19
174 0.26
175 0.35
176 0.37
177 0.39
178 0.41
179 0.46
180 0.48
181 0.45
182 0.42
183 0.42
184 0.44
185 0.44
186 0.4
187 0.34
188 0.31
189 0.33
190 0.31
191 0.27
192 0.28
193 0.25
194 0.25
195 0.27
196 0.26
197 0.24
198 0.24
199 0.2
200 0.16
201 0.18
202 0.24
203 0.25
204 0.32
205 0.38
206 0.45
207 0.53
208 0.57
209 0.6
210 0.6
211 0.61
212 0.57
213 0.54
214 0.52
215 0.48
216 0.48
217 0.53
218 0.48
219 0.49
220 0.47
221 0.41
222 0.36
223 0.31
224 0.27
225 0.18
226 0.16
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.06
247 0.11
248 0.14
249 0.16
250 0.2
251 0.21
252 0.23
253 0.23
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.16
259 0.15
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.08
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.08
271 0.12
272 0.14
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.2
278 0.2
279 0.18
280 0.2
281 0.26
282 0.27
283 0.29
284 0.31
285 0.29
286 0.28
287 0.26
288 0.23
289 0.17
290 0.2
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.17
295 0.17
296 0.19
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.21
331 0.21
332 0.22
333 0.23
334 0.23
335 0.25
336 0.26
337 0.25
338 0.19
339 0.19
340 0.17
341 0.15
342 0.15
343 0.16
344 0.21
345 0.26
346 0.31
347 0.38
348 0.47
349 0.51
350 0.58
351 0.61
352 0.63
353 0.61
354 0.61
355 0.62
356 0.57
357 0.62
358 0.56
359 0.52
360 0.44
361 0.42
362 0.4
363 0.32
364 0.31
365 0.24
366 0.29
367 0.33
368 0.35
369 0.35
370 0.34
371 0.34
372 0.3
373 0.28
374 0.23
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.16