Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VWE4

Protein Details
Accession A0A316VWE4    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-53DITPPSSKVKTPRDSKRRATHSQIERRRREKINECLITHydrophilic
107-136AMGSGEKAKRKRVRKRKEGKKNDDNKEEELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-35SKRRAT
40-43ERRR
112-127EKAKRKRVRKRKEGKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, extr 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
Amino Acid Sequences MQAMQAFPSTASSSIDITPPSSKVKTPRDSKRRATHSQIERRRREKINECLITLCQVIPACVREVQGRRRAAAAAASASHDGDDDDDDGHNALHRGVAGAGADGAGAMGSGEKAKRKRVRKRKEGKKNDDNKEEELGLHKLEVLTHAIDYIYELQARIAELERRMMTSHPYPSPSPYPSASPAFTHFTATPSLMSASSTVLTSPIMSLSAESPILRRGSSSGSGSGSGSGSGNGLAAYSVSGSSAHSAAYKHDARRPSTSHVNINGATPVWPMLPSSVLPLPPPAAAAAAAHSTSAYRRHDDGRTNRETIKTSPFINASTTSSATSRSTSISASASASAPASATSSPNFEAVGSRKRSSTHFQPLSFNDGSRDVKSRPSSSSSQQDAAAAVSDSRSRAASSAAMQVPAPALKQTQATPRTLLRGLAPLPLAQRTSRAEDAELLLSFSTSPDALRPVQSSATDVSSLGNRLGGSSGSSTSACASGPGAQSSRRLSTTTTSTSSSNEGFLHPSDATTATATATSPEALRPVSNVRQPPHSPALPPPRVSAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.18
4 0.19
5 0.21
6 0.22
7 0.26
8 0.27
9 0.3
10 0.38
11 0.47
12 0.54
13 0.61
14 0.69
15 0.74
16 0.81
17 0.87
18 0.88
19 0.86
20 0.85
21 0.84
22 0.83
23 0.83
24 0.85
25 0.85
26 0.85
27 0.86
28 0.84
29 0.84
30 0.82
31 0.81
32 0.8
33 0.8
34 0.8
35 0.74
36 0.69
37 0.63
38 0.56
39 0.48
40 0.39
41 0.29
42 0.21
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.17
48 0.18
49 0.19
50 0.24
51 0.32
52 0.39
53 0.45
54 0.47
55 0.45
56 0.45
57 0.45
58 0.38
59 0.34
60 0.27
61 0.2
62 0.18
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.15
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.02
94 0.02
95 0.02
96 0.03
97 0.05
98 0.08
99 0.15
100 0.19
101 0.29
102 0.38
103 0.48
104 0.59
105 0.69
106 0.78
107 0.83
108 0.9
109 0.91
110 0.94
111 0.95
112 0.95
113 0.94
114 0.94
115 0.92
116 0.9
117 0.82
118 0.74
119 0.66
120 0.56
121 0.45
122 0.38
123 0.3
124 0.22
125 0.18
126 0.15
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.12
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.2
154 0.21
155 0.26
156 0.24
157 0.27
158 0.27
159 0.31
160 0.35
161 0.33
162 0.31
163 0.27
164 0.28
165 0.28
166 0.3
167 0.27
168 0.23
169 0.25
170 0.26
171 0.25
172 0.24
173 0.21
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.15
178 0.12
179 0.12
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.13
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.14
237 0.18
238 0.19
239 0.23
240 0.28
241 0.3
242 0.34
243 0.36
244 0.35
245 0.4
246 0.41
247 0.41
248 0.39
249 0.38
250 0.34
251 0.31
252 0.26
253 0.18
254 0.15
255 0.1
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.16
286 0.2
287 0.25
288 0.33
289 0.4
290 0.43
291 0.45
292 0.46
293 0.46
294 0.44
295 0.43
296 0.37
297 0.36
298 0.29
299 0.26
300 0.26
301 0.25
302 0.23
303 0.22
304 0.21
305 0.17
306 0.16
307 0.16
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.12
338 0.15
339 0.22
340 0.25
341 0.25
342 0.26
343 0.28
344 0.32
345 0.35
346 0.4
347 0.43
348 0.44
349 0.45
350 0.49
351 0.49
352 0.52
353 0.46
354 0.38
355 0.29
356 0.27
357 0.28
358 0.25
359 0.27
360 0.21
361 0.27
362 0.31
363 0.32
364 0.31
365 0.34
366 0.36
367 0.38
368 0.45
369 0.42
370 0.39
371 0.37
372 0.34
373 0.29
374 0.25
375 0.2
376 0.12
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.19
389 0.19
390 0.19
391 0.18
392 0.18
393 0.18
394 0.16
395 0.15
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.12
400 0.14
401 0.22
402 0.25
403 0.27
404 0.29
405 0.3
406 0.33
407 0.32
408 0.3
409 0.23
410 0.24
411 0.23
412 0.23
413 0.22
414 0.19
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.16
419 0.2
420 0.21
421 0.26
422 0.27
423 0.27
424 0.25
425 0.26
426 0.27
427 0.25
428 0.22
429 0.16
430 0.13
431 0.12
432 0.11
433 0.1
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.11
439 0.13
440 0.16
441 0.17
442 0.18
443 0.21
444 0.21
445 0.21
446 0.2
447 0.2
448 0.18
449 0.16
450 0.15
451 0.15
452 0.16
453 0.14
454 0.13
455 0.11
456 0.11
457 0.12
458 0.11
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.13
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.14
471 0.16
472 0.18
473 0.19
474 0.21
475 0.26
476 0.3
477 0.33
478 0.29
479 0.28
480 0.27
481 0.31
482 0.35
483 0.36
484 0.34
485 0.33
486 0.32
487 0.33
488 0.34
489 0.3
490 0.26
491 0.21
492 0.2
493 0.2
494 0.2
495 0.22
496 0.18
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.17
501 0.15
502 0.14
503 0.11
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.11
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.16
515 0.23
516 0.29
517 0.36
518 0.42
519 0.43
520 0.5
521 0.53
522 0.58
523 0.58
524 0.54
525 0.5
526 0.53
527 0.6
528 0.59
529 0.58