Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VSP1

Protein Details
Accession A0A316VSP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-162TITAKRGGKDKRKREEKKGGKIRESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-185KRGGKDKRKREEKKGGKIRESAESKAKKQKKGDDEKERAASARK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 11, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035503  IOC4-like_PWWP  
IPR000313  PWWP_dom  
IPR017923  TFIIS_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF00855  PWWP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50812  PWWP  
CDD cd05840  PWWP_ScIOC4-like  
Amino Acid Sequences MPSSKPREDKTFNAGDVVMAKVKGYPPWPGIVVDEKNVPTSVNKQRPGKGVYTVRFFPQADYNWFKGYEMNHLTPKEIKAFLDEPSRAKADLRQAFLIAQDPSDWNDEQNVIVKNAEEAALEFAEGQDELAEDEDDDTITAKRGGKDKRKREEKKGGKIRESAESKAKKQKKGDDEKERAASARKSAAGDEESVAQDPETKMVYGWRHALQRGFLPKDGIIKEDETPNFDKTFKSVESYTDITEEQLRETKIGKVMKRIALLTDIPKNDEFNFAGRAQALCQKWGDVMAGGGGGAPRVSNGSAGGAAAAKDEPTNDSEDPAAETKQDEAAAEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.35
3 0.31
4 0.28
5 0.22
6 0.15
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.2
11 0.2
12 0.23
13 0.23
14 0.26
15 0.28
16 0.26
17 0.28
18 0.31
19 0.31
20 0.28
21 0.3
22 0.28
23 0.28
24 0.28
25 0.25
26 0.2
27 0.27
28 0.36
29 0.4
30 0.47
31 0.51
32 0.57
33 0.63
34 0.65
35 0.59
36 0.57
37 0.57
38 0.55
39 0.54
40 0.5
41 0.46
42 0.46
43 0.43
44 0.37
45 0.34
46 0.33
47 0.35
48 0.39
49 0.39
50 0.36
51 0.36
52 0.33
53 0.3
54 0.27
55 0.29
56 0.29
57 0.3
58 0.33
59 0.34
60 0.36
61 0.36
62 0.37
63 0.32
64 0.28
65 0.24
66 0.24
67 0.25
68 0.26
69 0.3
70 0.29
71 0.27
72 0.29
73 0.3
74 0.25
75 0.25
76 0.26
77 0.29
78 0.32
79 0.34
80 0.31
81 0.3
82 0.3
83 0.3
84 0.29
85 0.19
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.15
91 0.14
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.16
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.08
128 0.1
129 0.12
130 0.19
131 0.28
132 0.37
133 0.47
134 0.57
135 0.65
136 0.74
137 0.79
138 0.82
139 0.85
140 0.84
141 0.85
142 0.85
143 0.8
144 0.73
145 0.71
146 0.63
147 0.6
148 0.53
149 0.45
150 0.43
151 0.41
152 0.41
153 0.47
154 0.51
155 0.49
156 0.51
157 0.57
158 0.58
159 0.65
160 0.71
161 0.72
162 0.71
163 0.7
164 0.66
165 0.58
166 0.49
167 0.42
168 0.33
169 0.25
170 0.22
171 0.19
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.15
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.17
193 0.19
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.21
198 0.25
199 0.3
200 0.29
201 0.27
202 0.26
203 0.25
204 0.3
205 0.29
206 0.25
207 0.19
208 0.18
209 0.19
210 0.23
211 0.23
212 0.21
213 0.23
214 0.24
215 0.24
216 0.23
217 0.22
218 0.18
219 0.22
220 0.18
221 0.2
222 0.18
223 0.19
224 0.23
225 0.25
226 0.23
227 0.2
228 0.2
229 0.17
230 0.2
231 0.18
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.2
238 0.23
239 0.29
240 0.29
241 0.33
242 0.4
243 0.42
244 0.43
245 0.41
246 0.36
247 0.33
248 0.34
249 0.31
250 0.31
251 0.27
252 0.28
253 0.28
254 0.29
255 0.26
256 0.28
257 0.24
258 0.2
259 0.23
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.17
265 0.23
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.18
273 0.11
274 0.11
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.11
300 0.12
301 0.17
302 0.16
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.16
310 0.17
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.14