FuNGI

A0A316VQ13

Protein Details

Accession

A0A316VQ13

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
642-663	YITVGAREARRKKKHEAEENLV	Hydrophilic
741-769	AEEKKARKAAAKEFKQNRKAEKANRKAAY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
650-655	ARRKKK
743-768	EKKARKAAAKEFKQNRKAEKANRKAA

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGSKFRGPSSQKFQLVHRSQRDPLINDEEAGTHVWSSISSSKGPRSGKTRADLELELDEKSKRLRGNVGEAAKYGVYFDDTEYDYMQHLRSIGGDYNAKRGGKDEEEDVDVVLLPAPKSKQQQQQSAAANATNAKAKGKAIGMGIELREDVEARRREEEDDGRLKLSKDMLPPEHLPNRDWSAGFNVAQDLKGLQPDMDPHLRQVLEALDDDAFLLRTAGRKSIADATELGTPGTSVHQDRSFEDEQGEEEDLDEFFADIIEGGELSSKDEVPEWRALPPEGDEAIREDPAARAARELLDLKATGQGPDALSLESRVALFKAAQKSASEDRGQNRHLAGLRPGGVGPDTIGSDEEEERSSVIAPSQSSTLVRANKARRAPSSVGSQSIFGEKGASRKSRNPGAKARLAASYYAPSAMGGATAFSMSSSAMERNQGLTDLDMQFDKLEALYEQNSDDEEEDEDDDDEQRSATDVDSSVPKDLSREDFDQVIDEFLSTQEVYGGKLKERLGGLDLGPVEKLGLFRKELGRPLISRREELEGEESESESEDEPPMPRSAADDRDKWDVETVLSTRTNLENHPRLINAATSVAGSSFSHRPQTIASSGIGSRPSRLSGSSAADASVDRIPKIKIDPRTGMPSISRYITVGAREARRKKKHEAEENLVQGSTSSVSPPSSSGVAARSNQSMTMDRRGNATTCLPEGSWASVDEEEEEEEEQKEGYESDATETGARVTITRDRNESAEEKKARKAAAKEFKQNRKAEKANRKAAYVSERKAQSKSANGRIDGGGAADVGRNGVGSAGSVVRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.68
3	0.69
4	0.68
5	0.65
6	0.62
7	0.68
8	0.69
9	0.61
10	0.59
11	0.56
12	0.48
13	0.42
14	0.4
15	0.32
16	0.26
17	0.25
18	0.19
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.13
24	0.16
25	0.17
26	0.21
27	0.25
28	0.3
29	0.38
30	0.41
31	0.43
32	0.46
33	0.52
34	0.55
35	0.57
36	0.56
37	0.52
38	0.54
39	0.49
40	0.45
41	0.41
42	0.35
43	0.29
44	0.27
45	0.24
46	0.21
47	0.23
48	0.25
49	0.22
50	0.25
51	0.32
52	0.36
53	0.44
54	0.51
55	0.53
56	0.49
57	0.47
58	0.45
59	0.37
60	0.31
61	0.23
62	0.15
63	0.12
64	0.11
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.15
69	0.16
70	0.16
71	0.15
72	0.17
73	0.16
74	0.14
75	0.13
76	0.12
77	0.12
78	0.15
79	0.16
80	0.18
81	0.24
82	0.24
83	0.3
84	0.35
85	0.35
86	0.31
87	0.31
88	0.33
89	0.31
90	0.33
91	0.29
92	0.27
93	0.29
94	0.29
95	0.27
96	0.21
97	0.16
98	0.14
99	0.13
100	0.11
101	0.09
102	0.13
103	0.14
104	0.2
105	0.26
106	0.35
107	0.42
108	0.49
109	0.58
110	0.59
111	0.65
112	0.65
113	0.62
114	0.55
115	0.46
116	0.39
117	0.31
118	0.28
119	0.24
120	0.2
121	0.18
122	0.18
123	0.18
124	0.21
125	0.2
126	0.22
127	0.19
128	0.19
129	0.2
130	0.21
131	0.2
132	0.17
133	0.15
134	0.13
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.17
139	0.21
140	0.23
141	0.27
142	0.28
143	0.3
144	0.36
145	0.39
146	0.39
147	0.4
148	0.39
149	0.37
150	0.38
151	0.37
152	0.33
153	0.32
154	0.28
155	0.27
156	0.32
157	0.33
158	0.36
159	0.39
160	0.44
161	0.46
162	0.44
163	0.4
164	0.38
165	0.4
166	0.38
167	0.35
168	0.28
169	0.27
170	0.29
171	0.28
172	0.24
173	0.21
174	0.19
175	0.19
176	0.18
177	0.13
178	0.1
179	0.11
180	0.11
181	0.09
182	0.09
183	0.11
184	0.16
185	0.21
186	0.2
187	0.2
188	0.25
189	0.24
190	0.23
191	0.22
192	0.18
193	0.14
194	0.14
195	0.14
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.08
201	0.06
202	0.06
203	0.05
204	0.09
205	0.1
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.16
210	0.23
211	0.23
212	0.21
213	0.2
214	0.2
215	0.21
216	0.21
217	0.18
218	0.11
219	0.1
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.09
224	0.13
225	0.16
226	0.18
227	0.19
228	0.26
229	0.26
230	0.24
231	0.24
232	0.2
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.07
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.11
259	0.13
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.19
264	0.19
265	0.18
266	0.18
267	0.17
268	0.14
269	0.13
270	0.12
271	0.13
272	0.14
273	0.14
274	0.12
275	0.1
276	0.09
277	0.14
278	0.15
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.15
284	0.16
285	0.12
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.15
290	0.14
291	0.12
292	0.11
293	0.13
294	0.11
295	0.13
296	0.13
297	0.09
298	0.08
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.12
308	0.16
309	0.16
310	0.17
311	0.17
312	0.21
313	0.24
314	0.27
315	0.24
316	0.24
317	0.28
318	0.33
319	0.34
320	0.31
321	0.28
322	0.28
323	0.27
324	0.25
325	0.22
326	0.19
327	0.2
328	0.18
329	0.18
330	0.14
331	0.13
332	0.11
333	0.09
334	0.07
335	0.06
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.08
355	0.1
356	0.14
357	0.15
358	0.17
359	0.23
360	0.27
361	0.32
362	0.36
363	0.38
364	0.35
365	0.39
366	0.39
367	0.35
368	0.39
369	0.34
370	0.32
371	0.28
372	0.27
373	0.21
374	0.2
375	0.17
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.12
380	0.16
381	0.19
382	0.21
383	0.26
384	0.31
385	0.38
386	0.42
387	0.44
388	0.48
389	0.5
390	0.52
391	0.47
392	0.44
393	0.37
394	0.33
395	0.28
396	0.2
397	0.16
398	0.12
399	0.11
400	0.09
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.11
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.1
462	0.1
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.15
469	0.17
470	0.18
471	0.18
472	0.19
473	0.19
474	0.19
475	0.18
476	0.14
477	0.1
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.07
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.07
486	0.08
487	0.12
488	0.13
489	0.13
490	0.18
491	0.18
492	0.19
493	0.2
494	0.19
495	0.16
496	0.17
497	0.16
498	0.15
499	0.15
500	0.12
501	0.11
502	0.1
503	0.09
504	0.07
505	0.09
506	0.09
507	0.11
508	0.11
509	0.14
510	0.19
511	0.22
512	0.25
513	0.28
514	0.28
515	0.28
516	0.34
517	0.4
518	0.37
519	0.35
520	0.34
521	0.34
522	0.32
523	0.32
524	0.29
525	0.2
526	0.21
527	0.2
528	0.18
529	0.14
530	0.14
531	0.12
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.1
537	0.12
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.13
542	0.17
543	0.24
544	0.27
545	0.28
546	0.3
547	0.36
548	0.36
549	0.33
550	0.31
551	0.23
552	0.19
553	0.19
554	0.17
555	0.16
556	0.16
557	0.15
558	0.16
559	0.17
560	0.18
561	0.18
562	0.26
563	0.28
564	0.3
565	0.31
566	0.29
567	0.28
568	0.28
569	0.25
570	0.18
571	0.13
572	0.11
573	0.09
574	0.09
575	0.08
576	0.08
577	0.08
578	0.11
579	0.13
580	0.15
581	0.19
582	0.19
583	0.2
584	0.2
585	0.24
586	0.22
587	0.2
588	0.19
589	0.17
590	0.17
591	0.19
592	0.21
593	0.17
594	0.18
595	0.18
596	0.19
597	0.18
598	0.18
599	0.19
600	0.19
601	0.23
602	0.22
603	0.21
604	0.19
605	0.18
606	0.17
607	0.17
608	0.16
609	0.13
610	0.12
611	0.14
612	0.14
613	0.17
614	0.23
615	0.28
616	0.32
617	0.38
618	0.42
619	0.44
620	0.51
621	0.49
622	0.45
623	0.4
624	0.36
625	0.32
626	0.28
627	0.25
628	0.18
629	0.2
630	0.2
631	0.19
632	0.2
633	0.23
634	0.28
635	0.37
636	0.46
637	0.54
638	0.61
639	0.66
640	0.72
641	0.76
642	0.8
643	0.82
644	0.81
645	0.79
646	0.78
647	0.75
648	0.66
649	0.56
650	0.45
651	0.34
652	0.26
653	0.19
654	0.11
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.11
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.13
664	0.15
665	0.18
666	0.2
667	0.21
668	0.21
669	0.21
670	0.22
671	0.23
672	0.26
673	0.26
674	0.32
675	0.34
676	0.32
677	0.35
678	0.36
679	0.35
680	0.32
681	0.32
682	0.26
683	0.23
684	0.25
685	0.21
686	0.21
687	0.21
688	0.2
689	0.17
690	0.15
691	0.16
692	0.15
693	0.16
694	0.15
695	0.15
696	0.13
697	0.13
698	0.13
699	0.12
700	0.12
701	0.12
702	0.1
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.1
708	0.1
709	0.12
710	0.14
711	0.14
712	0.14
713	0.14
714	0.14
715	0.14
716	0.13
717	0.11
718	0.13
719	0.21
720	0.26
721	0.3
722	0.33
723	0.34
724	0.35
725	0.4
726	0.41
727	0.39
728	0.43
729	0.47
730	0.46
731	0.5
732	0.53
733	0.51
734	0.53
735	0.55
736	0.56
737	0.6
738	0.65
739	0.7
740	0.75
741	0.82
742	0.84
743	0.84
744	0.81
745	0.81
746	0.81
747	0.81
748	0.82
749	0.82
750	0.83
751	0.79
752	0.73
753	0.65
754	0.62
755	0.61
756	0.59
757	0.52
758	0.51
759	0.54
760	0.55
761	0.55
762	0.55
763	0.51
764	0.53
765	0.58
766	0.6
767	0.6
768	0.57
769	0.58
770	0.53
771	0.47
772	0.37
773	0.29
774	0.19
775	0.12
776	0.12
777	0.09
778	0.09
779	0.08
780	0.07
781	0.06
782	0.06
783	0.07
784	0.06
785	0.06
786	0.08
787	0.08

A0A316VQ13

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer