FuNGI

A0A316W3D0

Protein Details

Accession

A0A316W3D0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1014-1042	QSCVRRVSQFPHHRSPRHRPRLPGRLELM	Hydrophilic
1050-1080	SLVGGMRRRSNKARVRRAKHRGARHRAAMLH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1055-1076	MRRRSNKARVRRAKHRGARHRA

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

AISTVLNNPHKPSRPIDPSSSRYPPVASTRTDLPKIRRADFDTYLNSVQPAWQKLERSKRLGRSGKARLDAQEGEEAEGEGEAGEEPRTPKQQHGGARQSIEEARSLATGSQRLPPLSAVPQVFFSEEFNLGNPYTFDLVTERYKASSDLQGSSNFGGAAHGDEAPDGGVYDVALNQMLQEKLSWYSDVVEQHLILEISARSSSFFAALGNLQDLEAEAASCLKRTEVLQAELKRRDESEAKAGLRIIREQAARRSISERMAAVGVVQDLVHRRDLAKLLVHSGQFEEALDVTCSLMDLLEGRVSLNEWGAGDALPPHLDLELEAIPALAGLLPQLRDMNQTVAGQLESEALSVLGSDLNQRARTHEQQVATTASAASALEGSDQVREDVRAEAVAGPAERAAAAKKRASVILDPSALPDTDLVLRDRISPLLTGLVRTGNVDSFVGAYRLVALRSLRGGLRQYLVFKRGEGEEDLDALPALLDDDDLASGRSDARAVPGGAAAAAKLRSLDHVRFLELCDALFKGFLGMLHTMAAHNRVIVHILSAHAPSAKQNSTPSAPRVEIQDDDRSSRQADASGSSTFNTRMPESVSASLPMTLAAILQEATSLSHVLGSRLLSLRSATHVALDLGSFLEIFHASWSFVLKSETLAGRMIVGLRGAILNQAKAWLAAFHRERIEGAAKMVEEEMWVQAEVAINDQEEVARIVESATADPKAFILPAPAKDALSDSPIDPSTSLKTLSIEEKQYFVVGASTHVLRLLAEYLRVVINLPLLTTEAMGRVVEFLKQFNSRTCQVVLGAGAMRSAGLKNITAKHLALASQSLSIVITLIPYVRETVRRHLSQTQAVMLIEFDKLRRDYQEHQNEIFAKLVAIMSDRLSVHCRGLSAIEWNAPLPSSPPEPSTSVQDLSKETATLHKVLSKYLQPTSVEIVMGQVLLAIDKRVAEELAQVEISGSEGRERMREDVALLQRKLGNLKGVTWSNEVRSSDTFCFEKKEDHADHFSSLRGFNRILVQSCVRRVSQFPHHRSPRHRPRLPGRLELMRTSLASTSLVGGMRRRSNKARVRRAKHRGARHRAAMLHHA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.6
3	0.64
4	0.64
5	0.63
6	0.68
7	0.69
8	0.61
9	0.54
10	0.5
11	0.46
12	0.46
13	0.45
14	0.39
15	0.37
16	0.43
17	0.49
18	0.54
19	0.55
20	0.53
21	0.56
22	0.6
23	0.6
24	0.58
25	0.56
26	0.58
27	0.55
28	0.55
29	0.51
30	0.5
31	0.47
32	0.41
33	0.36
34	0.28
35	0.28
36	0.28
37	0.27
38	0.28
39	0.31
40	0.37
41	0.45
42	0.56
43	0.6
44	0.62
45	0.67
46	0.7
47	0.76
48	0.79
49	0.78
50	0.77
51	0.78
52	0.78
53	0.75
54	0.69
55	0.62
56	0.59
57	0.54
58	0.46
59	0.42
60	0.35
61	0.31
62	0.28
63	0.25
64	0.18
65	0.16
66	0.13
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.06
71	0.06
72	0.08
73	0.11
74	0.17
75	0.24
76	0.25
77	0.3
78	0.37
79	0.43
80	0.5
81	0.57
82	0.61
83	0.59
84	0.6
85	0.56
86	0.52
87	0.48
88	0.4
89	0.31
90	0.23
91	0.19
92	0.17
93	0.17
94	0.15
95	0.16
96	0.18
97	0.18
98	0.23
99	0.26
100	0.26
101	0.26
102	0.25
103	0.25
104	0.26
105	0.3
106	0.26
107	0.23
108	0.25
109	0.25
110	0.25
111	0.22
112	0.2
113	0.17
114	0.17
115	0.16
116	0.15
117	0.17
118	0.16
119	0.16
120	0.14
121	0.14
122	0.14
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.17
127	0.19
128	0.22
129	0.2
130	0.19
131	0.2
132	0.21
133	0.22
134	0.25
135	0.25
136	0.25
137	0.27
138	0.27
139	0.29
140	0.28
141	0.25
142	0.18
143	0.15
144	0.12
145	0.1
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.06
155	0.05
156	0.04
157	0.04
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.06
162	0.05
163	0.06
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.14
170	0.15
171	0.15
172	0.12
173	0.14
174	0.17
175	0.18
176	0.19
177	0.18
178	0.16
179	0.16
180	0.17
181	0.15
182	0.11
183	0.12
184	0.09
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.05
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.1
213	0.18
214	0.2
215	0.25
216	0.32
217	0.38
218	0.46
219	0.49
220	0.51
221	0.44
222	0.4
223	0.41
224	0.38
225	0.36
226	0.36
227	0.37
228	0.36
229	0.36
230	0.37
231	0.34
232	0.31
233	0.29
234	0.24
235	0.22
236	0.25
237	0.27
238	0.32
239	0.36
240	0.35
241	0.35
242	0.36
243	0.34
244	0.33
245	0.32
246	0.26
247	0.21
248	0.2
249	0.18
250	0.15
251	0.13
252	0.1
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.16
262	0.18
263	0.19
264	0.2
265	0.2
266	0.22
267	0.25
268	0.24
269	0.22
270	0.21
271	0.19
272	0.15
273	0.14
274	0.11
275	0.08
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.03
317	0.02
318	0.03
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.1
325	0.11
326	0.13
327	0.14
328	0.14
329	0.13
330	0.13
331	0.13
332	0.1
333	0.09
334	0.09
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.08
346	0.11
347	0.14
348	0.14
349	0.19
350	0.25
351	0.29
352	0.33
353	0.35
354	0.33
355	0.32
356	0.34
357	0.31
358	0.25
359	0.21
360	0.16
361	0.11
362	0.1
363	0.08
364	0.06
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.07
390	0.11
391	0.14
392	0.16
393	0.18
394	0.19
395	0.2
396	0.22
397	0.22
398	0.22
399	0.23
400	0.22
401	0.21
402	0.2
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.11
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.11
417	0.09
418	0.09
419	0.12
420	0.12
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.11
426	0.11
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.09
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.14
449	0.14
450	0.17
451	0.19
452	0.21
453	0.19
454	0.18
455	0.18
456	0.17
457	0.17
458	0.14
459	0.14
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.1
464	0.1
465	0.08
466	0.07
467	0.04
468	0.04
469	0.03
470	0.02
471	0.02
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.04
476	0.03
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.08
497	0.11
498	0.12
499	0.15
500	0.16
501	0.17
502	0.17
503	0.18
504	0.17
505	0.14
506	0.13
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.07
511	0.06
512	0.04
513	0.04
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.11
539	0.11
540	0.12
541	0.13
542	0.15
543	0.18
544	0.2
545	0.21
546	0.19
547	0.19
548	0.19
549	0.21
550	0.19
551	0.18
552	0.19
553	0.22
554	0.2
555	0.23
556	0.22
557	0.21
558	0.2
559	0.19
560	0.16
561	0.12
562	0.12
563	0.11
564	0.13
565	0.13
566	0.12
567	0.12
568	0.13
569	0.12
570	0.13
571	0.13
572	0.11
573	0.11
574	0.12
575	0.14
576	0.16
577	0.17
578	0.15
579	0.15
580	0.14
581	0.14
582	0.12
583	0.1
584	0.07
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.06
598	0.06
599	0.07
600	0.08
601	0.08
602	0.1
603	0.1
604	0.11
605	0.09
606	0.09
607	0.1
608	0.11
609	0.12
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.07
617	0.05
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.07
629	0.06
630	0.07
631	0.08
632	0.07
633	0.08
634	0.11
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.1
639	0.09
640	0.1
641	0.09
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.04
646	0.05
647	0.04
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.07
657	0.07
658	0.15
659	0.16
660	0.18
661	0.19
662	0.2
663	0.2
664	0.21
665	0.23
666	0.16
667	0.15
668	0.14
669	0.13
670	0.13
671	0.13
672	0.1
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.06
677	0.06
678	0.05
679	0.06
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.06
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.06
695	0.07
696	0.07
697	0.08
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.09
702	0.08
703	0.08
704	0.07
705	0.11
706	0.13
707	0.15
708	0.19
709	0.19
710	0.19
711	0.19
712	0.21
713	0.16
714	0.15
715	0.14
716	0.1
717	0.13
718	0.13
719	0.13
720	0.12
721	0.13
722	0.13
723	0.14
724	0.14
725	0.12
726	0.13
727	0.14
728	0.18
729	0.2
730	0.22
731	0.21
732	0.22
733	0.21
734	0.2
735	0.18
736	0.14
737	0.12
738	0.08
739	0.08
740	0.09
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.09
745	0.07
746	0.08
747	0.09
748	0.08
749	0.08
750	0.08
751	0.09
752	0.09
753	0.09
754	0.09
755	0.07
756	0.09
757	0.08
758	0.08
759	0.07
760	0.08
761	0.08
762	0.08
763	0.08
764	0.06
765	0.07
766	0.07
767	0.06
768	0.07
769	0.07
770	0.09
771	0.1
772	0.1
773	0.13
774	0.16
775	0.18
776	0.21
777	0.25
778	0.25
779	0.28
780	0.27
781	0.25
782	0.22
783	0.22
784	0.18
785	0.15
786	0.14
787	0.1
788	0.09
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.09
796	0.13
797	0.16
798	0.18
799	0.2
800	0.2
801	0.19
802	0.19
803	0.18
804	0.15
805	0.13
806	0.12
807	0.11
808	0.11
809	0.1
810	0.08
811	0.08
812	0.07
813	0.05
814	0.05
815	0.04
816	0.05
817	0.05
818	0.06
819	0.08
820	0.09
821	0.16
822	0.19
823	0.28
824	0.35
825	0.37
826	0.41
827	0.45
828	0.49
829	0.47
830	0.46
831	0.39
832	0.33
833	0.31
834	0.27
835	0.21
836	0.16
837	0.12
838	0.11
839	0.09
840	0.12
841	0.14
842	0.16
843	0.2
844	0.24
845	0.3
846	0.4
847	0.5
848	0.5
849	0.5
850	0.53
851	0.5
852	0.47
853	0.41
854	0.3
855	0.19
856	0.15
857	0.14
858	0.1
859	0.09
860	0.09
861	0.09
862	0.12
863	0.12
864	0.13
865	0.16
866	0.18
867	0.18
868	0.18
869	0.18
870	0.15
871	0.17
872	0.16
873	0.17
874	0.18
875	0.18
876	0.17
877	0.17
878	0.17
879	0.15
880	0.14
881	0.12
882	0.13
883	0.15
884	0.16
885	0.18
886	0.21
887	0.25
888	0.26
889	0.31
890	0.31
891	0.29
892	0.29
893	0.29
894	0.28
895	0.28
896	0.27
897	0.21
898	0.18
899	0.22
900	0.23
901	0.23
902	0.22
903	0.23
904	0.23
905	0.24
906	0.29
907	0.28
908	0.3
909	0.31
910	0.34
911	0.31
912	0.33
913	0.35
914	0.32
915	0.26
916	0.21
917	0.19
918	0.15
919	0.13
920	0.1
921	0.07
922	0.05
923	0.06
924	0.06
925	0.06
926	0.06
927	0.06
928	0.08
929	0.08
930	0.09
931	0.08
932	0.12
933	0.13
934	0.14
935	0.14
936	0.13
937	0.12
938	0.11
939	0.12
940	0.1
941	0.09
942	0.09
943	0.11
944	0.12
945	0.15
946	0.18
947	0.19
948	0.21
949	0.21
950	0.21
951	0.27
952	0.35
953	0.4
954	0.38
955	0.39
956	0.39
957	0.4
958	0.41
959	0.35
960	0.33
961	0.26
962	0.28
963	0.31
964	0.33
965	0.35
966	0.36
967	0.36
968	0.33
969	0.38
970	0.37
971	0.33
972	0.32
973	0.35
974	0.32
975	0.34
976	0.32
977	0.28
978	0.32
979	0.3
980	0.34
981	0.31
982	0.39
983	0.38
984	0.43
985	0.48
986	0.44
987	0.45
988	0.41
989	0.39
990	0.32
991	0.31
992	0.28
993	0.25
994	0.24
995	0.23
996	0.3
997	0.32
998	0.32
999	0.34
1000	0.38
1001	0.4
1002	0.45
1003	0.46
1004	0.4
1005	0.38
1006	0.39
1007	0.42
1008	0.46
1009	0.51
1010	0.54
1011	0.61
1012	0.69
1013	0.75
1014	0.81
1015	0.85
1016	0.85
1017	0.86
1018	0.84
1019	0.84
1020	0.85
1021	0.87
1022	0.84
1023	0.81
1024	0.76
1025	0.74
1026	0.71
1027	0.64
1028	0.57
1029	0.48
1030	0.42
1031	0.35
1032	0.29
1033	0.21
1034	0.18
1035	0.16
1036	0.14
1037	0.15
1038	0.16
1039	0.17
1040	0.2
1041	0.26
1042	0.34
1043	0.4
1044	0.45
1045	0.5
1046	0.59
1047	0.67
1048	0.74
1049	0.78
1050	0.8
1051	0.84
1052	0.88
1053	0.9
1054	0.91
1055	0.91
1056	0.91
1057	0.9
1058	0.9
1059	0.9
1060	0.86
1061	0.82
1062	0.75

A0A316W3D0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer