FuNGI

A0A316VVI6

Protein Details

Accession

A0A316VVI6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
576-601	FAPAKGKAFTKAKNKMKRGNYRAGGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
381-404	KKKSVAKALLEKKLESAKANAKKA
581-593	GKAFTKAKNKMKR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11.5, cyto 11, nucl 10, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MVKRAAALAPGGGHAPTTTAPGAGTGKGKRKAVSDQAESDVVVPSSPATTESSSNGFKIALSYVHSFLSVHFPGSAAALATESKSGSGSTNGSDGRPTKRARKSADMVQEVLSGLEEVEMDMEVGAVPQEPTVASKVEQGTRQVAKSDDKDGDSDSDSSDESDSSSSSDSSSSSSSNSSSSSSSASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSEDSSQPTPSSAGRKAAQPVVTTATSPTITSDDASDPGISSPAKADAEKKQASESKQASESGSDSDTSSSSSSSSSDTESESSSSSSLTSESDSDSDSDSDSDSDSESDSDTDAQEKEAQANAALVKIKQEPGVSPAVAAARAAAVTPVRVVKASERTNEKTGPAETATQPAVAKKKSVAKALLEKKLESAKANAKKAKADSASESDSASSSSDSSSSSESNSSDSSSSSSSSESESGSDSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSSSSASVAKPAAAILAVEPKTSTPVVATSTAATASLPSLSASPSVDTSTGKVKRQTGVPFSRIKADAVEYAHDGMRDMSYRALAGTSGYGAKAAADFAPAKGKAFTKAKNKMKRGNYRAGGEAIDMGSKSFKFTYDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.09
4	0.13
5	0.12
6	0.11
7	0.12
8	0.14
9	0.17
10	0.17
11	0.23
12	0.26
13	0.35
14	0.41
15	0.45
16	0.44
17	0.47
18	0.52
19	0.56
20	0.58
21	0.55
22	0.53
23	0.53
24	0.51
25	0.47
26	0.39
27	0.31
28	0.23
29	0.16
30	0.12
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.1
35	0.11
36	0.13
37	0.15
38	0.18
39	0.22
40	0.23
41	0.23
42	0.23
43	0.19
44	0.17
45	0.17
46	0.16
47	0.13
48	0.15
49	0.18
50	0.18
51	0.19
52	0.19
53	0.17
54	0.17
55	0.23
56	0.19
57	0.17
58	0.16
59	0.16
60	0.16
61	0.17
62	0.16
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.12
75	0.13
76	0.13
77	0.17
78	0.18
79	0.18
80	0.22
81	0.24
82	0.27
83	0.33
84	0.37
85	0.43
86	0.51
87	0.59
88	0.61
89	0.66
90	0.66
91	0.68
92	0.72
93	0.66
94	0.58
95	0.51
96	0.45
97	0.36
98	0.3
99	0.22
100	0.12
101	0.08
102	0.07
103	0.05
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.04
113	0.04
114	0.04
115	0.04
116	0.05
117	0.05
118	0.07
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.14
123	0.18
124	0.22
125	0.24
126	0.25
127	0.3
128	0.32
129	0.32
130	0.3
131	0.29
132	0.31
133	0.31
134	0.34
135	0.3
136	0.28
137	0.28
138	0.28
139	0.27
140	0.24
141	0.22
142	0.17
143	0.15
144	0.14
145	0.14
146	0.13
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.08
152	0.09
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.08
157	0.1
158	0.11
159	0.1
160	0.11
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.13
166	0.13
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.13
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.12
178	0.11
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.13
191	0.13
192	0.14
193	0.14
194	0.15
195	0.16
196	0.18
197	0.18
198	0.19
199	0.18
200	0.17
201	0.17
202	0.17
203	0.21
204	0.2
205	0.23
206	0.23
207	0.25
208	0.28
209	0.31
210	0.3
211	0.25
212	0.25
213	0.24
214	0.23
215	0.2
216	0.17
217	0.15
218	0.13
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.1
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.14
239	0.18
240	0.27
241	0.28
242	0.28
243	0.3
244	0.33
245	0.35
246	0.4
247	0.36
248	0.31
249	0.31
250	0.32
251	0.28
252	0.24
253	0.22
254	0.15
255	0.14
256	0.11
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.08
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.13
326	0.16
327	0.14
328	0.12
329	0.12
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.07
334	0.04
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.1
346	0.18
347	0.21
348	0.25
349	0.31
350	0.35
351	0.38
352	0.39
353	0.36
354	0.31
355	0.28
356	0.25
357	0.2
358	0.19
359	0.16
360	0.18
361	0.17
362	0.16
363	0.15
364	0.17
365	0.2
366	0.18
367	0.18
368	0.19
369	0.27
370	0.3
371	0.34
372	0.34
373	0.33
374	0.43
375	0.49
376	0.52
377	0.45
378	0.42
379	0.4
380	0.41
381	0.38
382	0.3
383	0.27
384	0.3
385	0.36
386	0.43
387	0.44
388	0.42
389	0.44
390	0.45
391	0.47
392	0.4
393	0.35
394	0.32
395	0.33
396	0.34
397	0.3
398	0.28
399	0.21
400	0.19
401	0.17
402	0.14
403	0.09
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.14
415	0.14
416	0.14
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.13
426	0.13
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.13
468	0.12
469	0.13
470	0.15
471	0.14
472	0.16
473	0.15
474	0.14
475	0.13
476	0.12
477	0.11
478	0.08
479	0.08
480	0.06
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.17
487	0.17
488	0.16
489	0.09
490	0.11
491	0.13
492	0.15
493	0.15
494	0.13
495	0.14
496	0.13
497	0.12
498	0.11
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.11
510	0.12
511	0.13
512	0.13
513	0.14
514	0.23
515	0.27
516	0.3
517	0.35
518	0.38
519	0.41
520	0.47
521	0.53
522	0.53
523	0.56
524	0.57
525	0.57
526	0.55
527	0.57
528	0.52
529	0.45
530	0.38
531	0.32
532	0.31
533	0.26
534	0.27
535	0.22
536	0.23
537	0.23
538	0.2
539	0.18
540	0.15
541	0.15
542	0.14
543	0.14
544	0.13
545	0.13
546	0.13
547	0.13
548	0.12
549	0.1
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.1
554	0.1
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.1
562	0.11
563	0.12
564	0.2
565	0.2
566	0.21
567	0.23
568	0.25
569	0.3
570	0.37
571	0.44
572	0.47
573	0.57
574	0.66
575	0.73
576	0.81
577	0.82
578	0.85
579	0.88
580	0.86
581	0.86
582	0.83
583	0.76
584	0.71
585	0.64
586	0.54
587	0.43
588	0.37
589	0.27
590	0.21
591	0.17
592	0.14
593	0.15
594	0.14
595	0.16
596	0.15
597	0.16

A0A316VVI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer