FuNGI

A0A316VUB5

Protein Details

Accession

A0A316VUB5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
346-369	EPDTSQMRPIKKRPKGNNGMRITP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
355-369	IKKRPKGNNGMRITP
371-371	K

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MKDWKRSPEPPSMMGPQPPVQSATPPTESQSSHSSLDEVLPGAYIAPFLGNEGSSKMASMAAAAEEETHERQARQDARVSKMMSLKSMAMTVICRNIHMVEDIGAMPYSLAGPVLRHCSASQLMVIEGNSPQIMSETEDLWRRLAHADLASVRRKDAEGLYDREPPASWRRLYLRELGAEKEAKEAASARLRERLAAATAERDSRGIVVDDAIAKSHLKKRRGLSTAKAGVTSAGQRSKGQTLMSKARAATHLTRQLTQPRSTARSEIGNNESTSSRIMRPPSMPRAGLTIRAGASAATISSLLSPSNTYTPNDFGSSSNGVKMIFGKTTPIASVDRATVAAQQAEPDTSQMRPIKKRPKGNNGMRITPVKRARHAAASLQEAPGLSNGSSNARHSKSMISIKSSSPPDTSRRAGSSSCPANDRSWSDYQCPSHSAAHPPRRSTETRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.51
3	0.46
4	0.43
5	0.4
6	0.37
7	0.32
8	0.33
9	0.33
10	0.34
11	0.33
12	0.31
13	0.33
14	0.34
15	0.34
16	0.34
17	0.35
18	0.32
19	0.3
20	0.3
21	0.27
22	0.23
23	0.24
24	0.21
25	0.16
26	0.12
27	0.1
28	0.1
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.05
33	0.05
34	0.05
35	0.06
36	0.07
37	0.07
38	0.08
39	0.09
40	0.12
41	0.11
42	0.11
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.11
54	0.12
55	0.15
56	0.16
57	0.16
58	0.18
59	0.27
60	0.31
61	0.32
62	0.37
63	0.4
64	0.43
65	0.49
66	0.48
67	0.44
68	0.44
69	0.42
70	0.36
71	0.33
72	0.28
73	0.23
74	0.22
75	0.18
76	0.13
77	0.14
78	0.14
79	0.19
80	0.17
81	0.17
82	0.18
83	0.18
84	0.18
85	0.17
86	0.15
87	0.1
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.1
92	0.09
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.04
97	0.05
98	0.04
99	0.05
100	0.08
101	0.14
102	0.14
103	0.15
104	0.15
105	0.19
106	0.2
107	0.2
108	0.18
109	0.13
110	0.13
111	0.13
112	0.13
113	0.1
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.06
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.09
124	0.12
125	0.16
126	0.17
127	0.17
128	0.16
129	0.15
130	0.15
131	0.15
132	0.15
133	0.12
134	0.13
135	0.17
136	0.22
137	0.26
138	0.25
139	0.24
140	0.23
141	0.22
142	0.22
143	0.19
144	0.21
145	0.21
146	0.25
147	0.28
148	0.32
149	0.32
150	0.31
151	0.29
152	0.26
153	0.28
154	0.29
155	0.26
156	0.25
157	0.3
158	0.34
159	0.36
160	0.38
161	0.34
162	0.33
163	0.34
164	0.31
165	0.3
166	0.27
167	0.24
168	0.21
169	0.18
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.14
174	0.18
175	0.2
176	0.19
177	0.24
178	0.24
179	0.24
180	0.24
181	0.21
182	0.16
183	0.16
184	0.15
185	0.11
186	0.12
187	0.13
188	0.12
189	0.11
190	0.1
191	0.09
192	0.09
193	0.07
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.1
203	0.16
204	0.22
205	0.25
206	0.3
207	0.34
208	0.43
209	0.47
210	0.48
211	0.45
212	0.48
213	0.51
214	0.46
215	0.41
216	0.32
217	0.28
218	0.25
219	0.23
220	0.17
221	0.13
222	0.14
223	0.14
224	0.16
225	0.18
226	0.18
227	0.18
228	0.18
229	0.21
230	0.27
231	0.28
232	0.28
233	0.27
234	0.27
235	0.27
236	0.28
237	0.25
238	0.25
239	0.3
240	0.29
241	0.3
242	0.31
243	0.38
244	0.39
245	0.37
246	0.34
247	0.31
248	0.34
249	0.34
250	0.33
251	0.27
252	0.27
253	0.27
254	0.28
255	0.28
256	0.26
257	0.25
258	0.25
259	0.24
260	0.19
261	0.19
262	0.17
263	0.15
264	0.16
265	0.18
266	0.2
267	0.24
268	0.3
269	0.36
270	0.37
271	0.36
272	0.33
273	0.36
274	0.34
275	0.33
276	0.27
277	0.22
278	0.19
279	0.18
280	0.18
281	0.12
282	0.11
283	0.08
284	0.07
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.11
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.17
299	0.19
300	0.19
301	0.19
302	0.16
303	0.19
304	0.22
305	0.2
306	0.19
307	0.18
308	0.16
309	0.16
310	0.17
311	0.15
312	0.12
313	0.11
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.14
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.15
322	0.14
323	0.13
324	0.13
325	0.13
326	0.14
327	0.13
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.12
334	0.11
335	0.12
336	0.11
337	0.18
338	0.22
339	0.29
340	0.35
341	0.45
342	0.55
343	0.62
344	0.72
345	0.75
346	0.81
347	0.84
348	0.87
349	0.87
350	0.82
351	0.78
352	0.73
353	0.7
354	0.61
355	0.6
356	0.58
357	0.54
358	0.53
359	0.54
360	0.53
361	0.52
362	0.52
363	0.49
364	0.45
365	0.46
366	0.43
367	0.38
368	0.35
369	0.28
370	0.26
371	0.2
372	0.17
373	0.11
374	0.1
375	0.11
376	0.14
377	0.16
378	0.2
379	0.27
380	0.27
381	0.29
382	0.29
383	0.32
384	0.36
385	0.43
386	0.43
387	0.41
388	0.42
389	0.43
390	0.49
391	0.48
392	0.43
393	0.38
394	0.4
395	0.39
396	0.43
397	0.45
398	0.43
399	0.42
400	0.43
401	0.41
402	0.41
403	0.45
404	0.45
405	0.45
406	0.42
407	0.42
408	0.41
409	0.45
410	0.45
411	0.41
412	0.42
413	0.42
414	0.44
415	0.49
416	0.51
417	0.48
418	0.47
419	0.44
420	0.43
421	0.43
422	0.48
423	0.51
424	0.58
425	0.61
426	0.62
427	0.64
428	0.65

A0A316VUB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer