Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VYM0

Protein Details
Accession A0A316VYM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-319DDGYRRREDERDRDRRDRDRERDRGSDRDRERERRERRGGADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-317ERDRDRRDRDRERDRGSDRDRERERRERRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, nucl 13.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRKAEVQRALLEKLMGPEAMGTANATLHFTDDKVCKNFLCGICPNDLFSNTKVDLGPCPRSHTAKLKDDYDAALSKGDRYAQFEVEHENSIRTFMADIDRKIAANKRRIDISPEETAKFTNLMRDIQDLEAAHDAATKEVERLGEAGEIEASLAELNKAEALKQEKSDRERDLQVLSDSAGASGHQKLRVCDVCGAYLSILDSDRRLADHFGGRMHLGYLKLREVIQGFDDRRARGEDPRTFLAQRGPGPLKGINGTSNGTSSGPAPPTGPGGQGADDGYRRREDERDRDRRDRDRERDRGSDRDRERERRERRGGADYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.19
4 0.15
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.1
9 0.08
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.08
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.16
19 0.19
20 0.26
21 0.28
22 0.3
23 0.28
24 0.3
25 0.38
26 0.34
27 0.36
28 0.34
29 0.33
30 0.37
31 0.37
32 0.36
33 0.31
34 0.31
35 0.28
36 0.24
37 0.28
38 0.23
39 0.25
40 0.23
41 0.22
42 0.26
43 0.29
44 0.36
45 0.31
46 0.37
47 0.39
48 0.43
49 0.47
50 0.51
51 0.53
52 0.55
53 0.58
54 0.53
55 0.51
56 0.48
57 0.44
58 0.37
59 0.3
60 0.22
61 0.2
62 0.18
63 0.16
64 0.16
65 0.19
66 0.16
67 0.2
68 0.22
69 0.22
70 0.23
71 0.22
72 0.26
73 0.24
74 0.26
75 0.21
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.11
81 0.09
82 0.08
83 0.15
84 0.18
85 0.18
86 0.2
87 0.21
88 0.2
89 0.23
90 0.29
91 0.29
92 0.33
93 0.37
94 0.36
95 0.39
96 0.4
97 0.43
98 0.41
99 0.39
100 0.38
101 0.36
102 0.35
103 0.32
104 0.31
105 0.26
106 0.22
107 0.17
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.15
115 0.17
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.08
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.07
149 0.11
150 0.13
151 0.15
152 0.2
153 0.23
154 0.27
155 0.32
156 0.32
157 0.32
158 0.32
159 0.31
160 0.28
161 0.25
162 0.22
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.11
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.24
180 0.23
181 0.21
182 0.2
183 0.2
184 0.14
185 0.12
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.15
198 0.16
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.2
216 0.2
217 0.25
218 0.28
219 0.27
220 0.28
221 0.3
222 0.3
223 0.3
224 0.38
225 0.37
226 0.39
227 0.42
228 0.44
229 0.41
230 0.4
231 0.39
232 0.35
233 0.31
234 0.34
235 0.33
236 0.3
237 0.33
238 0.33
239 0.3
240 0.27
241 0.26
242 0.21
243 0.2
244 0.21
245 0.18
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.17
266 0.19
267 0.2
268 0.22
269 0.23
270 0.25
271 0.31
272 0.38
273 0.45
274 0.54
275 0.62
276 0.68
277 0.76
278 0.81
279 0.83
280 0.85
281 0.85
282 0.84
283 0.84
284 0.85
285 0.83
286 0.84
287 0.8
288 0.8
289 0.75
290 0.75
291 0.7
292 0.71
293 0.73
294 0.73
295 0.77
296 0.77
297 0.8
298 0.81
299 0.85
300 0.82
301 0.79