Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VVH1

Protein Details
Accession A0A316VVH1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-51ASASANQDKKRRRPPHSHTHKGDKDKDAKBasic
80-99TTTKDGKHRRGEKTSKSKQHBasic
146-180APHTSKSKSKSKPSSKSKSKRDKEKDKDKDRASRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-53KKRRRPPHSHTHKGDKDKDAKGK
151-188KSKSKSKPSSKSKSKRDKEKDKDKDRASRSKAPLQKLK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSASAPAPAPAPAPSVSGSGAAASASANQDKKRRRPPHSHTHKGDKDKDAKGKGASVADKSEMLEAGDRAAASKEEEETTTTKDGKHRRGEKTSKSKQHDSHNKLHLPNSAAQKAESQALSPQLASQAQSTLQPASAPTNPNTQSAPHTSKSKSKSKPSSKSKSKRDKEKDKDKDRASRSKAPLQKLKVIVRRLPPNLPEEIFWNVVRPWVRDLEDVQVINSQTSAEAGQMHTPLQQTIEWKRFVEGKIKESHTLFTSVVKAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.09
9 0.07
10 0.06
11 0.08
12 0.1
13 0.15
14 0.18
15 0.23
16 0.31
17 0.41
18 0.51
19 0.6
20 0.67
21 0.71
22 0.79
23 0.83
24 0.86
25 0.88
26 0.89
27 0.85
28 0.86
29 0.86
30 0.84
31 0.83
32 0.8
33 0.78
34 0.75
35 0.75
36 0.68
37 0.64
38 0.56
39 0.51
40 0.45
41 0.42
42 0.37
43 0.3
44 0.29
45 0.26
46 0.24
47 0.22
48 0.19
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.25
71 0.32
72 0.38
73 0.47
74 0.52
75 0.56
76 0.65
77 0.72
78 0.75
79 0.79
80 0.8
81 0.8
82 0.78
83 0.79
84 0.74
85 0.77
86 0.77
87 0.73
88 0.72
89 0.71
90 0.68
91 0.62
92 0.59
93 0.52
94 0.44
95 0.42
96 0.38
97 0.33
98 0.28
99 0.27
100 0.25
101 0.23
102 0.22
103 0.17
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.2
127 0.21
128 0.22
129 0.22
130 0.2
131 0.21
132 0.25
133 0.28
134 0.24
135 0.27
136 0.28
137 0.35
138 0.4
139 0.46
140 0.47
141 0.53
142 0.61
143 0.67
144 0.75
145 0.79
146 0.83
147 0.85
148 0.88
149 0.89
150 0.9
151 0.88
152 0.89
153 0.89
154 0.89
155 0.89
156 0.9
157 0.9
158 0.88
159 0.89
160 0.84
161 0.83
162 0.79
163 0.78
164 0.75
165 0.73
166 0.7
167 0.7
168 0.69
169 0.68
170 0.68
171 0.63
172 0.62
173 0.59
174 0.62
175 0.6
176 0.59
177 0.57
178 0.57
179 0.61
180 0.57
181 0.55
182 0.5
183 0.46
184 0.44
185 0.39
186 0.32
187 0.27
188 0.27
189 0.25
190 0.22
191 0.21
192 0.17
193 0.21
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.22
198 0.25
199 0.24
200 0.26
201 0.26
202 0.29
203 0.27
204 0.25
205 0.24
206 0.22
207 0.2
208 0.18
209 0.13
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.19
225 0.28
226 0.33
227 0.34
228 0.33
229 0.36
230 0.39
231 0.4
232 0.43
233 0.4
234 0.4
235 0.45
236 0.49
237 0.51
238 0.47
239 0.49
240 0.41
241 0.4
242 0.34
243 0.29