FuNGI

A0A316VVC1

Protein Details

Accession

A0A316VVC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
350-376	SGAASRPAAKKKRKRSQKKKDEDDAES	Basic
429-452	AKASTSKSKKKISKKQREKQDAEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
354-369	SRPAAKKKRKRSQKKK
391-447	EKAKKLTKKERTKLKEEQERAEQEEKERLEKEAAAAAAAKASTSKSKKKISKKQREK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 5.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSGTGCVYNRVRATRQLLKRYRTPPFSPSLRLHIWVGGFRFDGGSGTFTLQSPLKTIITYIVAGRIPPDLLDVIHSCGVRFYEGALIVEVHDHRPVLARKAEPIDVPKYGFQDPYAAESTSASATAGSSGASADPGSSSAGRTSMPTTGATVEIYRLVLWPNDETLWVDLRLMDTREGKEWSDEDALLVEAKILNLTSPLLCLEPDFQATRIANFMMNATANPASELNLAPSGTFGGPIDIDPNTGMARLPAAGSKRNSSQADKDEEDRIRRSKIMKLMSQGDDDQQDRAMAMLSGTSNATFAPSFSRMNFISDWRAKRMADEMAKNGRAPPNGASANGGGNNENGEGSSGAASRPAAKKKRKRSQKKKDEDDAESDKDVPLAASLSAAPEKAKKLTKKERTKLKEEQERAEQEEKERLEKEAAAAAAAKASTSKSKKKISKKQREKQDAEAAAQAAAAPGAGSVESTPVKTEASGSGKKASSSSATKKSKKPQTPSTPAAASGSQPIQTPVVPSSSVVASPSIGNLPGTPHSGNSAQMSAPGQSNMAPGQPHMLTPQQQHAHAQAQRMMSSIMAQQQQTGSPHQLGAMVGMGQQGGVPGAMAPQQSQAGHQPQPPGQGQSPTLQQQQINRLVQQQMQNIAGPNVNLNQLPPQHRQMLVVQAMRQLGALLPQQNNSSGNQATPQQQAIQAQQQQQQQQQQPQQSQQQQPPQAQIPHQLQMALQGYAQNSMGNPMGSGNVAFPMQQQQQMNPTASQAAALAAIFQQQQQQQQQQNSMLPQQQLQQAAMMPAFQAMMAQNHGQNSANGMMQSSSPQAQHQQTGQQNQSNFNANTGGFNTSFLGNGGQWGSSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.62
3	0.67
4	0.71
5	0.71
6	0.77
7	0.78
8	0.79
9	0.77
10	0.73
11	0.68
12	0.68
13	0.67
14	0.65
15	0.6
16	0.58
17	0.53
18	0.51
19	0.47
20	0.42
21	0.38
22	0.35
23	0.32
24	0.27
25	0.24
26	0.22
27	0.21
28	0.17
29	0.16
30	0.13
31	0.13
32	0.12
33	0.13
34	0.14
35	0.14
36	0.17
37	0.18
38	0.17
39	0.18
40	0.21
41	0.19
42	0.18
43	0.19
44	0.19
45	0.19
46	0.2
47	0.17
48	0.18
49	0.18
50	0.18
51	0.18
52	0.16
53	0.14
54	0.13
55	0.14
56	0.1
57	0.1
58	0.14
59	0.15
60	0.16
61	0.2
62	0.2
63	0.17
64	0.18
65	0.19
66	0.17
67	0.15
68	0.13
69	0.14
70	0.15
71	0.16
72	0.15
73	0.14
74	0.13
75	0.17
76	0.17
77	0.14
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.2
82	0.24
83	0.27
84	0.32
85	0.32
86	0.36
87	0.4
88	0.42
89	0.38
90	0.4
91	0.38
92	0.34
93	0.36
94	0.33
95	0.32
96	0.32
97	0.29
98	0.24
99	0.25
100	0.23
101	0.26
102	0.26
103	0.22
104	0.2
105	0.2
106	0.21
107	0.16
108	0.15
109	0.1
110	0.08
111	0.07
112	0.08
113	0.07
114	0.06
115	0.05
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.05
121	0.06
122	0.06
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.1
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.14
131	0.14
132	0.15
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.16
137	0.15
138	0.13
139	0.12
140	0.11
141	0.11
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.14
152	0.14
153	0.16
154	0.14
155	0.13
156	0.12
157	0.13
158	0.15
159	0.15
160	0.17
161	0.19
162	0.2
163	0.23
164	0.25
165	0.24
166	0.24
167	0.23
168	0.24
169	0.22
170	0.2
171	0.17
172	0.16
173	0.15
174	0.13
175	0.12
176	0.08
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.07
184	0.06
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.1
191	0.1
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.18
196	0.19
197	0.18
198	0.18
199	0.17
200	0.15
201	0.14
202	0.14
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.11
213	0.12
214	0.1
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.1
219	0.11
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.09
227	0.07
228	0.08
229	0.07
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.09
239	0.11
240	0.17
241	0.19
242	0.22
243	0.24
244	0.31
245	0.34
246	0.35
247	0.38
248	0.39
249	0.43
250	0.42
251	0.41
252	0.41
253	0.42
254	0.43
255	0.41
256	0.39
257	0.35
258	0.36
259	0.36
260	0.35
261	0.39
262	0.41
263	0.39
264	0.41
265	0.44
266	0.43
267	0.42
268	0.37
269	0.32
270	0.29
271	0.26
272	0.21
273	0.15
274	0.13
275	0.11
276	0.1
277	0.09
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.09
291	0.11
292	0.12
293	0.13
294	0.17
295	0.16
296	0.19
297	0.19
298	0.18
299	0.23
300	0.28
301	0.31
302	0.31
303	0.33
304	0.3
305	0.3
306	0.31
307	0.3
308	0.28
309	0.28
310	0.3
311	0.33
312	0.34
313	0.33
314	0.34
315	0.31
316	0.26
317	0.25
318	0.22
319	0.22
320	0.22
321	0.22
322	0.2
323	0.17
324	0.18
325	0.17
326	0.16
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.09
331	0.08
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.1
342	0.15
343	0.23
344	0.31
345	0.41
346	0.51
347	0.61
348	0.71
349	0.78
350	0.85
351	0.88
352	0.91
353	0.92
354	0.94
355	0.92
356	0.9
357	0.85
358	0.77
359	0.72
360	0.66
361	0.57
362	0.46
363	0.38
364	0.28
365	0.22
366	0.19
367	0.12
368	0.07
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.08
378	0.09
379	0.13
380	0.19
381	0.23
382	0.33
383	0.43
384	0.53
385	0.62
386	0.68
387	0.75
388	0.75
389	0.78
390	0.77
391	0.76
392	0.75
393	0.67
394	0.63
395	0.59
396	0.56
397	0.52
398	0.48
399	0.39
400	0.31
401	0.33
402	0.3
403	0.26
404	0.24
405	0.21
406	0.18
407	0.17
408	0.16
409	0.13
410	0.12
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.04
418	0.05
419	0.11
420	0.16
421	0.23
422	0.29
423	0.38
424	0.47
425	0.57
426	0.67
427	0.72
428	0.79
429	0.84
430	0.85
431	0.87
432	0.89
433	0.83
434	0.79
435	0.76
436	0.66
437	0.56
438	0.49
439	0.39
440	0.28
441	0.24
442	0.17
443	0.08
444	0.06
445	0.04
446	0.02
447	0.02
448	0.02
449	0.02
450	0.02
451	0.02
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.08
460	0.1
461	0.15
462	0.18
463	0.18
464	0.22
465	0.23
466	0.23
467	0.22
468	0.2
469	0.18
470	0.22
471	0.27
472	0.33
473	0.41
474	0.47
475	0.53
476	0.62
477	0.68
478	0.7
479	0.71
480	0.72
481	0.74
482	0.76
483	0.72
484	0.67
485	0.58
486	0.5
487	0.44
488	0.34
489	0.24
490	0.18
491	0.15
492	0.12
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.11
497	0.12
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.09
502	0.1
503	0.1
504	0.09
505	0.09
506	0.08
507	0.07
508	0.07
509	0.08
510	0.07
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.08
515	0.09
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.14
523	0.14
524	0.11
525	0.12
526	0.13
527	0.12
528	0.11
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.09
534	0.1
535	0.09
536	0.08
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.12
541	0.15
542	0.17
543	0.18
544	0.26
545	0.25
546	0.26
547	0.27
548	0.28
549	0.32
550	0.31
551	0.32
552	0.28
553	0.27
554	0.26
555	0.25
556	0.22
557	0.15
558	0.14
559	0.13
560	0.14
561	0.15
562	0.15
563	0.15
564	0.16
565	0.18
566	0.19
567	0.2
568	0.17
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.15
573	0.13
574	0.11
575	0.09
576	0.07
577	0.06
578	0.07
579	0.06
580	0.05
581	0.05
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.08
592	0.1
593	0.1
594	0.12
595	0.17
596	0.21
597	0.24
598	0.26
599	0.29
600	0.29
601	0.34
602	0.35
603	0.33
604	0.3
605	0.3
606	0.29
607	0.27
608	0.3
609	0.29
610	0.31
611	0.29
612	0.3
613	0.31
614	0.38
615	0.43
616	0.4
617	0.38
618	0.38
619	0.37
620	0.4
621	0.4
622	0.35
623	0.3
624	0.29
625	0.29
626	0.26
627	0.25
628	0.21
629	0.16
630	0.14
631	0.13
632	0.13
633	0.12
634	0.12
635	0.15
636	0.2
637	0.25
638	0.28
639	0.31
640	0.34
641	0.34
642	0.36
643	0.34
644	0.36
645	0.36
646	0.34
647	0.3
648	0.29
649	0.29
650	0.26
651	0.24
652	0.16
653	0.11
654	0.12
655	0.14
656	0.16
657	0.18
658	0.19
659	0.2
660	0.22
661	0.23
662	0.21
663	0.22
664	0.18
665	0.17
666	0.17
667	0.2
668	0.23
669	0.24
670	0.24
671	0.21
672	0.23
673	0.25
674	0.27
675	0.31
676	0.32
677	0.35
678	0.4
679	0.43
680	0.46
681	0.5
682	0.55
683	0.53
684	0.56
685	0.58
686	0.59
687	0.6
688	0.61
689	0.64
690	0.64
691	0.66
692	0.65
693	0.67
694	0.66
695	0.64
696	0.63
697	0.6
698	0.55
699	0.49
700	0.49
701	0.45
702	0.42
703	0.39
704	0.34
705	0.28
706	0.31
707	0.3
708	0.22
709	0.18
710	0.17
711	0.17
712	0.18
713	0.19
714	0.13
715	0.1
716	0.12
717	0.13
718	0.11
719	0.1
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.1
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.09
729	0.16
730	0.18
731	0.23
732	0.24
733	0.25
734	0.31
735	0.36
736	0.37
737	0.3
738	0.29
739	0.25
740	0.23
741	0.21
742	0.15
743	0.11
744	0.09
745	0.08
746	0.08
747	0.06
748	0.09
749	0.09
750	0.09
751	0.15
752	0.17
753	0.25
754	0.31
755	0.4
756	0.45
757	0.49
758	0.54
759	0.53
760	0.54
761	0.5
762	0.49
763	0.45
764	0.4
765	0.37
766	0.36
767	0.37
768	0.35
769	0.32
770	0.27
771	0.23
772	0.24
773	0.22
774	0.17
775	0.12
776	0.1
777	0.1
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.1
782	0.12
783	0.15
784	0.17
785	0.18
786	0.2
787	0.2
788	0.18
789	0.2
790	0.19
791	0.18
792	0.16
793	0.16
794	0.15
795	0.14
796	0.16
797	0.16
798	0.17
799	0.16
800	0.19
801	0.26
802	0.29
803	0.34
804	0.34
805	0.4
806	0.45
807	0.53
808	0.56
809	0.54
810	0.53
811	0.53
812	0.53
813	0.53
814	0.46
815	0.39
816	0.35
817	0.3
818	0.3
819	0.28
820	0.28
821	0.19
822	0.2
823	0.2
824	0.17
825	0.17
826	0.15
827	0.15
828	0.12
829	0.14
830	0.14

A0A316VVC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer