FuNGI

A0A316VSX3

Protein Details

Accession

A0A316VSX3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
350-370	EERAKRLAKKREEKAKREKAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
206-242	RGRGRGGTGYASGRGVGGGGGGGAGGGRGRGRGGPGG
342-369	ALPRMKEKEERAKRLAKKREEKAKREKA

Subcellular Location(s)

mito 19, cyto_nucl 5.5, cyto 4.5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPPPPRRSRRAVPAPAAASQDAPPPPPPPPPPSSSSQAQVDQLISSSAAPASTPAININIHADSDARTASPAFSSPHPASASASASASASASAISLSNPRAASSSTTTALAPNASASSGATIAPSPSPAPSQSRSTTASMVPLPRNFGGAPSSSSSGGGARPTPSGQKMIFKPVMPVRRKPAPEPVVKQEASSSGSGTGGPPFGRGRGRGGTGYASGRGVGGGGGGGAGGGRGRGRGGPGGGAPRFVPPEMVATGPFALGTGAIGRSSSNRRPVSSGYSFGAGAGSSGTAPGQGLKSEGSQRYRDPDQLKDREEYSDAEDGGVEIIDMDEVHSLDSSAPRALPRMKEKEERAKRLAKKREEKAKREKADESKTSDGMGSKNVKGAAGAGGDEGMGSGTSTPASGVSLGIKPDPADEEAEAAKAAAEDSARVEEEEEEDETAAANALDLSASEDEETPDDLLDDFLPLDDMNQGDGPENRLYLFQFPTLLPAFVPASGAGAGADEETSGATTHGPLSANASNASKTKRAVSFADGGDKEIKKEKGGGSSTSNGLNGDSEEAKGRRVNGVGNGRGMVEGQAGKLDVYKDGRVMFRYGKVVMEVTGGSQSTFLQHVMVLDAAKESAVTLGELHRKFVVTPELESMLKDVSLAEEEDRRAKEEQELEDRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.73
3	0.67
4	0.62
5	0.51
6	0.42
7	0.34
8	0.34
9	0.27
10	0.27
11	0.26
12	0.25
13	0.28
14	0.34
15	0.39
16	0.39
17	0.43
18	0.46
19	0.48
20	0.51
21	0.54
22	0.5
23	0.49
24	0.47
25	0.45
26	0.41
27	0.39
28	0.34
29	0.28
30	0.24
31	0.2
32	0.15
33	0.12
34	0.11
35	0.09
36	0.08
37	0.08
38	0.08
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.11
43	0.14
44	0.14
45	0.15
46	0.18
47	0.16
48	0.15
49	0.15
50	0.14
51	0.13
52	0.15
53	0.15
54	0.11
55	0.11
56	0.12
57	0.12
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.16
62	0.24
63	0.24
64	0.28
65	0.28
66	0.28
67	0.28
68	0.28
69	0.29
70	0.22
71	0.21
72	0.16
73	0.15
74	0.15
75	0.12
76	0.09
77	0.07
78	0.06
79	0.05
80	0.05
81	0.05
82	0.06
83	0.09
84	0.1
85	0.15
86	0.15
87	0.15
88	0.16
89	0.17
90	0.21
91	0.22
92	0.25
93	0.22
94	0.23
95	0.23
96	0.22
97	0.22
98	0.18
99	0.13
100	0.1
101	0.09
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.09
112	0.1
113	0.09
114	0.1
115	0.12
116	0.14
117	0.2
118	0.22
119	0.28
120	0.29
121	0.32
122	0.35
123	0.35
124	0.35
125	0.3
126	0.3
127	0.28
128	0.31
129	0.31
130	0.29
131	0.31
132	0.28
133	0.3
134	0.26
135	0.24
136	0.21
137	0.17
138	0.19
139	0.17
140	0.19
141	0.17
142	0.17
143	0.16
144	0.15
145	0.15
146	0.14
147	0.13
148	0.12
149	0.14
150	0.15
151	0.19
152	0.2
153	0.23
154	0.23
155	0.29
156	0.29
157	0.36
158	0.38
159	0.34
160	0.38
161	0.41
162	0.49
163	0.46
164	0.49
165	0.47
166	0.53
167	0.56
168	0.53
169	0.57
170	0.55
171	0.58
172	0.58
173	0.58
174	0.58
175	0.55
176	0.51
177	0.42
178	0.36
179	0.31
180	0.25
181	0.19
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.11
191	0.14
192	0.16
193	0.17
194	0.2
195	0.21
196	0.24
197	0.22
198	0.23
199	0.21
200	0.21
201	0.21
202	0.17
203	0.14
204	0.12
205	0.11
206	0.1
207	0.08
208	0.06
209	0.04
210	0.03
211	0.03
212	0.02
213	0.02
214	0.02
215	0.02
216	0.02
217	0.02
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.05
223	0.07
224	0.08
225	0.09
226	0.09
227	0.11
228	0.17
229	0.16
230	0.16
231	0.15
232	0.16
233	0.17
234	0.16
235	0.15
236	0.09
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.06
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.08
255	0.14
256	0.18
257	0.26
258	0.28
259	0.29
260	0.32
261	0.34
262	0.38
263	0.35
264	0.33
265	0.25
266	0.24
267	0.23
268	0.2
269	0.18
270	0.1
271	0.08
272	0.05
273	0.05
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.08
285	0.13
286	0.17
287	0.2
288	0.21
289	0.22
290	0.27
291	0.28
292	0.33
293	0.3
294	0.35
295	0.4
296	0.44
297	0.45
298	0.41
299	0.4
300	0.35
301	0.34
302	0.27
303	0.21
304	0.18
305	0.15
306	0.14
307	0.12
308	0.11
309	0.09
310	0.08
311	0.04
312	0.02
313	0.02
314	0.02
315	0.02
316	0.02
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.09
329	0.12
330	0.16
331	0.23
332	0.29
333	0.33
334	0.39
335	0.44
336	0.53
337	0.59
338	0.61
339	0.59
340	0.61
341	0.64
342	0.67
343	0.72
344	0.7
345	0.71
346	0.73
347	0.78
348	0.79
349	0.8
350	0.81
351	0.82
352	0.77
353	0.72
354	0.7
355	0.68
356	0.66
357	0.62
358	0.57
359	0.49
360	0.45
361	0.41
362	0.35
363	0.28
364	0.21
365	0.22
366	0.19
367	0.16
368	0.18
369	0.18
370	0.17
371	0.15
372	0.15
373	0.11
374	0.08
375	0.08
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.03
382	0.03
383	0.02
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.06
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.05
411	0.05
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.07
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.06
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.07
449	0.06
450	0.06
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.12
467	0.13
468	0.14
469	0.15
470	0.16
471	0.13
472	0.14
473	0.14
474	0.18
475	0.18
476	0.17
477	0.13
478	0.14
479	0.14
480	0.12
481	0.13
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.08
501	0.09
502	0.09
503	0.14
504	0.16
505	0.17
506	0.18
507	0.19
508	0.18
509	0.21
510	0.25
511	0.22
512	0.22
513	0.27
514	0.29
515	0.31
516	0.32
517	0.33
518	0.36
519	0.34
520	0.41
521	0.34
522	0.34
523	0.37
524	0.35
525	0.32
526	0.34
527	0.34
528	0.27
529	0.32
530	0.32
531	0.34
532	0.36
533	0.37
534	0.35
535	0.37
536	0.37
537	0.33
538	0.31
539	0.23
540	0.2
541	0.18
542	0.13
543	0.13
544	0.12
545	0.11
546	0.17
547	0.17
548	0.19
549	0.21
550	0.22
551	0.22
552	0.23
553	0.25
554	0.28
555	0.36
556	0.35
557	0.35
558	0.34
559	0.31
560	0.29
561	0.27
562	0.19
563	0.13
564	0.11
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.1
569	0.12
570	0.12
571	0.14
572	0.17
573	0.18
574	0.19
575	0.22
576	0.25
577	0.25
578	0.29
579	0.28
580	0.29
581	0.31
582	0.3
583	0.28
584	0.26
585	0.25
586	0.21
587	0.19
588	0.15
589	0.13
590	0.14
591	0.13
592	0.11
593	0.11
594	0.11
595	0.11
596	0.12
597	0.11
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.11
602	0.12
603	0.1
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.08
608	0.08
609	0.06
610	0.06
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.13
615	0.22
616	0.22
617	0.25
618	0.25
619	0.25
620	0.25
621	0.29
622	0.32
623	0.25
624	0.28
625	0.29
626	0.31
627	0.31
628	0.31
629	0.28
630	0.2
631	0.17
632	0.15
633	0.11
634	0.1
635	0.11
636	0.12
637	0.13
638	0.17
639	0.2
640	0.26
641	0.27
642	0.29
643	0.29
644	0.29
645	0.34
646	0.36
647	0.41

A0A316VSX3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer