FuNGI

A0A316VTH9

Protein Details

Accession

A0A316VTH9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
772-797	GATERKATKTPRKRSVRKPTHGEGSD	Basic
862-889	RTFELRRTYRKMIKDKKKELPERRMLAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
467-476	PKRPRGRPKK
502-510	RRPRGRPKK
536-547	PAKRPRGRPRKA
653-663	KSKRRAKLKLP
776-813	RKATKTPRKRSVRKPTHGEGSDSEAGSTKRRRGGGKRK
867-914	RRTYRKMIKDKKKELPERRMLAARKDKGSLRAEELEEEERRKRSSKSL

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2 PS00354 HMGI_Y
CDD	cd00084 HMG-box_SF

Amino Acid Sequences

MSRVEKGGTRFKPQIRPRAGIRSTQPGPSAPASSLESAQAGSLSESVGPQAQPQAQAQAEAQAQAQPQSQSQSKEPHSIGGAPGASRYLFAAEEGDEEEDRLPTTASSSKSQLPPIIASKSGQNVSASATKRASKAILTPTAPSPSPSPPPQARSALASAQSGQSQSNGGTGALPPQPPAAEAAAIGESRDGRHGQRDEEVGAALDKSGGAKSNGDDLSSKDRGAVGSSAGDAASRPSLSATSPPSTSGASSPSITRAPMPPPPAPASRTSSNNQNNVAHTQSFVRAPRTIGLMPIKPLVSRASSASLRAPSLSPAPGLRADRSSATPAPSAAASARLRGMSATPMPESLSRRENVAPPEISSARKAREASVLSEAGMRGATPARVQAPTSPVVARGDGAATVERGALSDIEPAQSATSTKARAPWEVASVETSAGEQIEVGSAPWDALVRGEAATGVPQNEQAAPPKRPRGRPKKSTAAVDAAANGDSDRQAEIGSEVPQRRPRGRPKKLNSAAAASVDTEVGSNAGPASQGEAPAKRPRGRPRKAGAATAAVSAPQHQEQETSADGSRKSRSRAEIVSPLRGESTSQAHLDGDAEEQAEEASDDSAEEYFPSVTARRGRGRGGGRTSGGADTRQSTEDASASAHPVPESGKSKRRAKLKLPDDAPKRPANAYMRFSAQQRALHWADQNGASFGEVAQKIAERWAEVSAAEKGERAQRAKQELEAWRINMAQWKRDNPEWAEKLDARKRKKGTLTDGETADEGATTDASAGATERKATKTPRKRSVRKPTHGEGSDSEAGSTKRRRGGGKRKDVGISDDESAYAAELAAVGGNERLLEVSQGTRMAELSQPEVRMGRAGARTFELRRTYRKMIKDKKKELPERRMLAARKDKGSLRAEELEEEERRKRSSKSLPAARKEVQQAQNEDEVEEEEVFDVDSDGEPIAPSSPAGSASPTPSGFSNNSSAHALKNNKNSVQVRMSNGRLVLDESTLQVDRAAEYEGEDRIVIEENEKDKFINSASFSDRRGHQRWDKEQTLAFYAVSISFSTRRDCPLCCFLIACCSLVILYRLYRNGARTLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.72
3	0.73
4	0.72
5	0.74
6	0.69
7	0.66
8	0.63
9	0.62
10	0.57
11	0.56
12	0.51
13	0.42
14	0.44
15	0.39
16	0.36
17	0.27
18	0.28
19	0.27
20	0.27
21	0.26
22	0.22
23	0.19
24	0.17
25	0.16
26	0.13
27	0.11
28	0.09
29	0.09
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.09
34	0.12
35	0.11
36	0.12
37	0.17
38	0.2
39	0.22
40	0.23
41	0.28
42	0.26
43	0.27
44	0.26
45	0.25
46	0.24
47	0.22
48	0.21
49	0.18
50	0.19
51	0.19
52	0.23
53	0.19
54	0.2
55	0.25
56	0.29
57	0.3
58	0.35
59	0.42
60	0.42
61	0.49
62	0.47
63	0.45
64	0.43
65	0.4
66	0.36
67	0.32
68	0.29
69	0.21
70	0.21
71	0.19
72	0.16
73	0.14
74	0.14
75	0.11
76	0.09
77	0.1
78	0.11
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.12
84	0.12
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.08
91	0.12
92	0.16
93	0.19
94	0.22
95	0.25
96	0.31
97	0.35
98	0.38
99	0.38
100	0.35
101	0.36
102	0.38
103	0.38
104	0.32
105	0.3
106	0.3
107	0.33
108	0.31
109	0.29
110	0.24
111	0.21
112	0.24
113	0.3
114	0.28
115	0.27
116	0.3
117	0.31
118	0.32
119	0.34
120	0.31
121	0.27
122	0.31
123	0.34
124	0.37
125	0.35
126	0.37
127	0.38
128	0.4
129	0.38
130	0.34
131	0.29
132	0.28
133	0.33
134	0.34
135	0.39
136	0.41
137	0.46
138	0.5
139	0.51
140	0.47
141	0.44
142	0.44
143	0.39
144	0.35
145	0.31
146	0.27
147	0.24
148	0.24
149	0.2
150	0.17
151	0.14
152	0.13
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.14
160	0.16
161	0.16
162	0.15
163	0.16
164	0.16
165	0.16
166	0.18
167	0.14
168	0.11
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.09
176	0.1
177	0.13
178	0.13
179	0.14
180	0.22
181	0.25
182	0.26
183	0.29
184	0.31
185	0.29
186	0.27
187	0.26
188	0.18
189	0.16
190	0.13
191	0.09
192	0.07
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.08
197	0.09
198	0.11
199	0.11
200	0.19
201	0.19
202	0.19
203	0.19
204	0.21
205	0.27
206	0.27
207	0.26
208	0.2
209	0.21
210	0.2
211	0.21
212	0.19
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.09
219	0.07
220	0.08
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.09
226	0.1
227	0.15
228	0.18
229	0.19
230	0.19
231	0.2
232	0.21
233	0.21
234	0.21
235	0.18
236	0.16
237	0.15
238	0.15
239	0.15
240	0.17
241	0.17
242	0.17
243	0.18
244	0.18
245	0.2
246	0.25
247	0.29
248	0.28
249	0.32
250	0.36
251	0.37
252	0.36
253	0.37
254	0.38
255	0.37
256	0.4
257	0.37
258	0.43
259	0.47
260	0.49
261	0.49
262	0.45
263	0.43
264	0.42
265	0.42
266	0.32
267	0.26
268	0.23
269	0.21
270	0.22
271	0.22
272	0.23
273	0.21
274	0.22
275	0.23
276	0.25
277	0.23
278	0.24
279	0.26
280	0.24
281	0.24
282	0.26
283	0.24
284	0.2
285	0.21
286	0.19
287	0.16
288	0.15
289	0.16
290	0.18
291	0.19
292	0.2
293	0.22
294	0.22
295	0.2
296	0.2
297	0.19
298	0.15
299	0.17
300	0.17
301	0.14
302	0.13
303	0.15
304	0.18
305	0.19
306	0.19
307	0.18
308	0.19
309	0.2
310	0.22
311	0.25
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.19
317	0.17
318	0.16
319	0.11
320	0.16
321	0.14
322	0.14
323	0.15
324	0.14
325	0.15
326	0.14
327	0.15
328	0.11
329	0.13
330	0.14
331	0.13
332	0.13
333	0.14
334	0.18
335	0.2
336	0.2
337	0.23
338	0.21
339	0.24
340	0.25
341	0.28
342	0.28
343	0.3
344	0.27
345	0.24
346	0.29
347	0.28
348	0.26
349	0.26
350	0.27
351	0.23
352	0.27
353	0.26
354	0.23
355	0.28
356	0.29
357	0.28
358	0.28
359	0.26
360	0.22
361	0.23
362	0.21
363	0.14
364	0.12
365	0.09
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.08
371	0.1
372	0.11
373	0.12
374	0.13
375	0.16
376	0.17
377	0.18
378	0.17
379	0.16
380	0.16
381	0.16
382	0.13
383	0.1
384	0.09
385	0.07
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.11
406	0.12
407	0.12
408	0.18
409	0.19
410	0.2
411	0.22
412	0.21
413	0.21
414	0.21
415	0.2
416	0.16
417	0.15
418	0.14
419	0.11
420	0.09
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.04
425	0.03
426	0.04
427	0.03
428	0.03
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.08
449	0.09
450	0.15
451	0.19
452	0.22
453	0.27
454	0.36
455	0.41
456	0.49
457	0.59
458	0.64
459	0.69
460	0.75
461	0.78
462	0.79
463	0.77
464	0.73
465	0.65
466	0.57
467	0.47
468	0.38
469	0.31
470	0.21
471	0.17
472	0.13
473	0.09
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.09
484	0.13
485	0.14
486	0.18
487	0.23
488	0.27
489	0.31
490	0.37
491	0.46
492	0.53
493	0.62
494	0.69
495	0.7
496	0.78
497	0.79
498	0.77
499	0.68
500	0.59
501	0.5
502	0.4
503	0.33
504	0.22
505	0.17
506	0.11
507	0.09
508	0.06
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.08
521	0.1
522	0.13
523	0.18
524	0.24
525	0.26
526	0.32
527	0.41
528	0.51
529	0.56
530	0.61
531	0.6
532	0.66
533	0.63
534	0.59
535	0.5
536	0.42
537	0.37
538	0.29
539	0.24
540	0.14
541	0.12
542	0.1
543	0.1
544	0.08
545	0.08
546	0.07
547	0.08
548	0.08
549	0.11
550	0.1
551	0.11
552	0.11
553	0.12
554	0.13
555	0.15
556	0.19
557	0.19
558	0.22
559	0.24
560	0.26
561	0.28
562	0.3
563	0.32
564	0.37
565	0.36
566	0.37
567	0.33
568	0.31
569	0.27
570	0.24
571	0.2
572	0.13
573	0.15
574	0.12
575	0.12
576	0.13
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.1
581	0.08
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.06
601	0.06
602	0.1
603	0.14
604	0.19
605	0.22
606	0.24
607	0.26
608	0.32
609	0.35
610	0.38
611	0.38
612	0.37
613	0.33
614	0.32
615	0.32
616	0.26
617	0.22
618	0.16
619	0.13
620	0.12
621	0.13
622	0.13
623	0.12
624	0.11
625	0.11
626	0.11
627	0.1
628	0.09
629	0.08
630	0.09
631	0.1
632	0.09
633	0.08
634	0.09
635	0.09
636	0.13
637	0.18
638	0.22
639	0.29
640	0.36
641	0.44
642	0.49
643	0.57
644	0.6
645	0.63
646	0.68
647	0.67
648	0.68
649	0.64
650	0.68
651	0.66
652	0.64
653	0.6
654	0.52
655	0.48
656	0.39
657	0.42
658	0.39
659	0.4
660	0.37
661	0.34
662	0.35
663	0.34
664	0.35
665	0.33
666	0.3
667	0.26
668	0.25
669	0.29
670	0.28
671	0.28
672	0.28
673	0.25
674	0.23
675	0.21
676	0.21
677	0.14
678	0.13
679	0.11
680	0.09
681	0.08
682	0.12
683	0.11
684	0.11
685	0.1
686	0.11
687	0.11
688	0.13
689	0.13
690	0.08
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.11
696	0.1
697	0.11
698	0.11
699	0.1
700	0.11
701	0.16
702	0.2
703	0.21
704	0.24
705	0.28
706	0.34
707	0.35
708	0.36
709	0.38
710	0.38
711	0.42
712	0.4
713	0.35
714	0.3
715	0.29
716	0.28
717	0.27
718	0.24
719	0.24
720	0.26
721	0.3
722	0.33
723	0.36
724	0.4
725	0.38
726	0.46
727	0.42
728	0.39
729	0.39
730	0.37
731	0.43
732	0.46
733	0.5
734	0.46
735	0.52
736	0.55
737	0.58
738	0.63
739	0.62
740	0.63
741	0.65
742	0.65
743	0.61
744	0.58
745	0.51
746	0.44
747	0.36
748	0.27
749	0.17
750	0.1
751	0.06
752	0.05
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.04
758	0.05
759	0.06
760	0.07
761	0.09
762	0.11
763	0.14
764	0.18
765	0.26
766	0.37
767	0.46
768	0.55
769	0.64
770	0.73
771	0.8
772	0.87
773	0.9
774	0.9
775	0.89
776	0.87
777	0.82
778	0.81
779	0.73
780	0.65
781	0.55
782	0.52
783	0.46
784	0.38
785	0.32
786	0.25
787	0.24
788	0.27
789	0.3
790	0.27
791	0.29
792	0.34
793	0.41
794	0.49
795	0.59
796	0.64
797	0.7
798	0.71
799	0.7
800	0.68
801	0.63
802	0.56
803	0.48
804	0.4
805	0.3
806	0.25
807	0.21
808	0.18
809	0.16
810	0.12
811	0.09
812	0.06
813	0.04
814	0.04
815	0.04
816	0.04
817	0.04
818	0.04
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.05
824	0.04
825	0.05
826	0.06
827	0.07
828	0.08
829	0.1
830	0.1
831	0.1
832	0.1
833	0.11
834	0.12
835	0.13
836	0.15
837	0.17
838	0.17
839	0.18
840	0.19
841	0.17
842	0.16
843	0.16
844	0.17
845	0.19
846	0.2
847	0.2
848	0.23
849	0.27
850	0.27
851	0.33
852	0.35
853	0.34
854	0.4
855	0.46
856	0.52
857	0.56
858	0.63
859	0.68
860	0.71
861	0.78
862	0.82
863	0.84
864	0.85
865	0.89
866	0.9
867	0.89
868	0.89
869	0.87
870	0.81
871	0.76
872	0.75
873	0.67
874	0.67
875	0.67
876	0.62
877	0.55
878	0.55
879	0.53
880	0.53
881	0.55
882	0.48
883	0.44
884	0.43
885	0.41
886	0.38
887	0.38
888	0.36
889	0.33
890	0.34
891	0.33
892	0.31
893	0.33
894	0.35
895	0.35
896	0.39
897	0.46
898	0.53
899	0.58
900	0.66
901	0.72
902	0.76
903	0.8
904	0.74
905	0.69
906	0.66
907	0.65
908	0.62
909	0.59
910	0.56
911	0.53
912	0.54
913	0.48
914	0.42
915	0.32
916	0.26
917	0.21
918	0.17
919	0.13
920	0.09
921	0.08
922	0.08
923	0.08
924	0.07
925	0.06
926	0.06
927	0.06
928	0.06
929	0.06
930	0.06
931	0.07
932	0.07
933	0.07
934	0.07
935	0.07
936	0.08
937	0.09
938	0.1
939	0.12
940	0.13
941	0.16
942	0.2
943	0.2
944	0.2
945	0.2
946	0.24
947	0.22
948	0.23
949	0.27
950	0.24
951	0.27
952	0.29
953	0.29
954	0.27
955	0.34
956	0.38
957	0.38
958	0.47
959	0.52
960	0.5
961	0.59
962	0.58
963	0.57
964	0.58
965	0.56
966	0.53
967	0.53
968	0.53
969	0.48
970	0.46
971	0.4
972	0.32
973	0.29
974	0.24
975	0.19
976	0.17
977	0.14
978	0.17
979	0.16
980	0.16
981	0.14
982	0.14
983	0.12
984	0.13
985	0.14
986	0.1
987	0.12
988	0.14
989	0.14
990	0.14
991	0.13
992	0.12
993	0.12
994	0.14
995	0.12
996	0.13
997	0.18
998	0.19
999	0.22
1000	0.22
1001	0.21
1002	0.19
1003	0.21
1004	0.2
1005	0.21
1006	0.21
1007	0.24
1008	0.3
1009	0.33
1010	0.34
1011	0.38
1012	0.43
1013	0.45
1014	0.48
1015	0.52
1016	0.55
1017	0.62
1018	0.7
1019	0.74
1020	0.71
1021	0.67
1022	0.66
1023	0.6
1024	0.56
1025	0.47
1026	0.37
1027	0.28
1028	0.25
1029	0.21
1030	0.18
1031	0.15
1032	0.13
1033	0.16
1034	0.18
1035	0.21
1036	0.23
1037	0.3
1038	0.32
1039	0.34
1040	0.38
1041	0.42
1042	0.43
1043	0.4
1044	0.38
1045	0.32
1046	0.36
1047	0.35
1048	0.28
1049	0.2
1050	0.18
1051	0.17
1052	0.18
1053	0.19
1054	0.14
1055	0.16
1056	0.2
1057	0.22
1058	0.26
1059	0.29
1060	0.31

A0A316VTH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer