Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

D6RMS5

Protein Details
Accession D6RMS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-516FIAQRRMLRKPTRTSRVKQKRPRSRTLTSVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-304RKRLFKVGKKM
491-509RMLRKPTRTSRVKQKRPRS
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.833, cyto 9.5, mito_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044059  Csn1/TTC4_wheel  
IPR000554  Ribosomal_S7e  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0051879  F:Hsp90 protein binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG cci:CC1G_14669  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01251  Ribosomal_S7e  
PF18972  Wheel  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00948  RIBOSOMAL_S7E  
PS50005  TPR  
CDD cd21377  CTWD_Cns1-like  
Amino Acid Sequences MDADLEKHIIEMARSQPAPVAGPRELSQEEIDAKLKALDDIPLFMKSLPDESSENPVLAALQDLAYEGTPDEIADNFKSRGNEYFKGKKYREAISFYTQGIEAKPTDPKIMTALLCNRAACNLELQNYGSVLRDCSSALNLDAHLSKAYYRSAQALLALDRLEEGLDCCDRKEAKEKVQREREERLRKEQEAKRALAMAFRERNLIDVPKPDGSSNPYEPRWDPEDPTNSTLVFPVFFLYPQYATSDVIPDFVEDTIFGAHLERMFPPAGTAPEWDKKGEYTVPSLVVYAMTRRKRLFKVGKKMTLKDVFKAAKPKEGEPKDGLEVKDGCLTFVVVPKGDAEKKWVDEFKRSRDQISTESSKRYNQKANLDQQKHTAVRRDQKGLSTANMSVTNKILRTANAPNTPPDEIETQVAQALIDLENNVPELKSELRVLQISAAREVDVRGGKKAIVIFVPVPQLKAFHKVQQRLTRELEKKFSDRHVVFIAQRRMLRKPTRTSRVKQKRPRSRTLTSVHEKILEDLVFPTEIVGKRTRVAVDGSKLLKVFLDSKDATSLEYKLDSFSSVYRRLTGKDVVFEFPVVHGDKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.27
4 0.27
5 0.3
6 0.28
7 0.29
8 0.23
9 0.26
10 0.27
11 0.3
12 0.3
13 0.29
14 0.27
15 0.25
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.16
26 0.15
27 0.18
28 0.19
29 0.18
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.15
34 0.17
35 0.16
36 0.17
37 0.19
38 0.2
39 0.28
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.21
44 0.18
45 0.16
46 0.15
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.1
61 0.12
62 0.16
63 0.16
64 0.19
65 0.21
66 0.22
67 0.29
68 0.33
69 0.37
70 0.42
71 0.51
72 0.55
73 0.64
74 0.64
75 0.63
76 0.61
77 0.63
78 0.61
79 0.58
80 0.55
81 0.51
82 0.53
83 0.46
84 0.42
85 0.35
86 0.29
87 0.24
88 0.21
89 0.16
90 0.15
91 0.19
92 0.2
93 0.23
94 0.22
95 0.22
96 0.22
97 0.24
98 0.23
99 0.24
100 0.29
101 0.3
102 0.31
103 0.31
104 0.28
105 0.26
106 0.27
107 0.22
108 0.21
109 0.19
110 0.2
111 0.21
112 0.22
113 0.21
114 0.2
115 0.2
116 0.16
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.15
157 0.16
158 0.19
159 0.27
160 0.3
161 0.38
162 0.47
163 0.54
164 0.6
165 0.69
166 0.73
167 0.69
168 0.72
169 0.72
170 0.74
171 0.71
172 0.71
173 0.68
174 0.66
175 0.71
176 0.66
177 0.66
178 0.61
179 0.58
180 0.49
181 0.45
182 0.41
183 0.34
184 0.32
185 0.3
186 0.27
187 0.26
188 0.27
189 0.23
190 0.24
191 0.23
192 0.24
193 0.18
194 0.18
195 0.2
196 0.21
197 0.22
198 0.2
199 0.2
200 0.21
201 0.25
202 0.27
203 0.3
204 0.28
205 0.3
206 0.31
207 0.34
208 0.35
209 0.31
210 0.28
211 0.29
212 0.34
213 0.34
214 0.35
215 0.32
216 0.27
217 0.25
218 0.24
219 0.17
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.13
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.17
266 0.18
267 0.15
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.16
278 0.17
279 0.21
280 0.22
281 0.27
282 0.29
283 0.39
284 0.46
285 0.48
286 0.57
287 0.62
288 0.69
289 0.68
290 0.67
291 0.65
292 0.63
293 0.54
294 0.45
295 0.44
296 0.37
297 0.35
298 0.42
299 0.35
300 0.33
301 0.34
302 0.36
303 0.39
304 0.39
305 0.41
306 0.35
307 0.36
308 0.33
309 0.35
310 0.32
311 0.25
312 0.23
313 0.2
314 0.23
315 0.2
316 0.17
317 0.13
318 0.14
319 0.11
320 0.14
321 0.14
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.14
326 0.15
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.19
331 0.22
332 0.26
333 0.24
334 0.32
335 0.37
336 0.4
337 0.47
338 0.46
339 0.44
340 0.43
341 0.44
342 0.38
343 0.4
344 0.4
345 0.33
346 0.36
347 0.36
348 0.39
349 0.42
350 0.44
351 0.45
352 0.44
353 0.5
354 0.54
355 0.62
356 0.66
357 0.65
358 0.6
359 0.56
360 0.57
361 0.51
362 0.45
363 0.44
364 0.4
365 0.45
366 0.49
367 0.51
368 0.45
369 0.45
370 0.47
371 0.41
372 0.35
373 0.29
374 0.25
375 0.22
376 0.24
377 0.23
378 0.19
379 0.19
380 0.2
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.13
385 0.18
386 0.23
387 0.29
388 0.32
389 0.33
390 0.33
391 0.35
392 0.35
393 0.31
394 0.27
395 0.21
396 0.17
397 0.18
398 0.16
399 0.13
400 0.13
401 0.13
402 0.1
403 0.08
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.12
418 0.12
419 0.15
420 0.16
421 0.16
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.16
428 0.16
429 0.16
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.18
434 0.19
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.18
439 0.14
440 0.16
441 0.15
442 0.17
443 0.23
444 0.21
445 0.21
446 0.19
447 0.22
448 0.2
449 0.26
450 0.26
451 0.27
452 0.35
453 0.41
454 0.5
455 0.56
456 0.6
457 0.59
458 0.63
459 0.65
460 0.63
461 0.62
462 0.6
463 0.56
464 0.56
465 0.54
466 0.53
467 0.54
468 0.47
469 0.46
470 0.43
471 0.42
472 0.42
473 0.47
474 0.48
475 0.43
476 0.46
477 0.46
478 0.47
479 0.53
480 0.57
481 0.56
482 0.6
483 0.66
484 0.73
485 0.78
486 0.81
487 0.83
488 0.85
489 0.88
490 0.88
491 0.88
492 0.89
493 0.89
494 0.92
495 0.89
496 0.83
497 0.82
498 0.77
499 0.77
500 0.73
501 0.69
502 0.6
503 0.56
504 0.5
505 0.43
506 0.41
507 0.31
508 0.24
509 0.2
510 0.2
511 0.16
512 0.15
513 0.14
514 0.15
515 0.16
516 0.19
517 0.22
518 0.22
519 0.23
520 0.27
521 0.28
522 0.24
523 0.27
524 0.3
525 0.31
526 0.37
527 0.37
528 0.36
529 0.35
530 0.33
531 0.29
532 0.25
533 0.25
534 0.2
535 0.26
536 0.24
537 0.26
538 0.3
539 0.29
540 0.28
541 0.26
542 0.25
543 0.2
544 0.21
545 0.2
546 0.17
547 0.18
548 0.17
549 0.16
550 0.2
551 0.25
552 0.28
553 0.29
554 0.32
555 0.34
556 0.35
557 0.39
558 0.42
559 0.38
560 0.39
561 0.41
562 0.39
563 0.38
564 0.36
565 0.31
566 0.25
567 0.27