FuNGI

A0A316VYW2

Protein Details

Accession

A0A316VYW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-41	VDENGKHRQSQRKVMRKSAPFT	Hydrophilic
256-276	AFSQAKYRKRKESKHMRIFTP	Hydrophilic
396-421	KPAGKPVNDRDRQRLRKRQGQHEEYQ	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 10, cysk 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MSNSEEALQSSAASSSVLHVDENGKHRQSQRKVMRKSAPFTTSERLTHIPSGKPVLLKLPSGHLKSVVLQAAAEGGVRGGDDLISLGKFGVFRGSEIVGLPFGHSFEIVGGDKGGPSRLNANGGVLGKRKAGDEEKDLLDQSEEDVRDGSAGPTFGTEPVEGGGAKGRQGKASKEAGLPTPGQLRVVIEAPGAEAIEETDATNELYADGDPDSAYAQTAQLLTTIDISALKDAGVDGKTIIQQATEGNINFAQKTAFSQAKYRKRKESKHMRIFTPLAPTPSIIAAHNAERSAEKMRGLREDSIAQMLSFANVAAGGRYLIVDGVGGALTGSVLERLGGEGRVLVIGDNESPPAFESLAQLNLEEEHLSILRSLHWAATEIGWEPQSEIDVHATHKPAGKPVNDRDRQRLRKRQGQHEEYQETRQELLDGDWDGLLAACPYETISVLQRLIPHLGGSASIAVHSPFVQPLIEASARLRYIPELINVLITEPCLREYQVLPGRTHPQMIQSSTAGYVLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.11
4	0.12
5	0.11
6	0.12
7	0.17
8	0.23
9	0.28
10	0.33
11	0.33
12	0.38
13	0.46
14	0.54
15	0.58
16	0.63
17	0.69
18	0.72
19	0.77
20	0.81
21	0.83
22	0.81
23	0.78
24	0.76
25	0.69
26	0.62
27	0.6
28	0.57
29	0.53
30	0.46
31	0.46
32	0.4
33	0.39
34	0.43
35	0.42
36	0.38
37	0.37
38	0.41
39	0.39
40	0.37
41	0.35
42	0.35
43	0.33
44	0.32
45	0.3
46	0.32
47	0.37
48	0.38
49	0.38
50	0.33
51	0.32
52	0.31
53	0.36
54	0.29
55	0.22
56	0.19
57	0.18
58	0.17
59	0.15
60	0.13
61	0.07
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.12
78	0.11
79	0.12
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.16
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.08
92	0.07
93	0.06
94	0.1
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.11
101	0.13
102	0.09
103	0.1
104	0.13
105	0.15
106	0.18
107	0.17
108	0.18
109	0.2
110	0.21
111	0.23
112	0.21
113	0.21
114	0.19
115	0.2
116	0.2
117	0.2
118	0.24
119	0.24
120	0.27
121	0.3
122	0.31
123	0.31
124	0.31
125	0.27
126	0.22
127	0.18
128	0.15
129	0.15
130	0.13
131	0.12
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.08
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.09
148	0.08
149	0.08
150	0.11
151	0.09
152	0.12
153	0.17
154	0.17
155	0.21
156	0.24
157	0.26
158	0.28
159	0.32
160	0.33
161	0.3
162	0.31
163	0.28
164	0.29
165	0.27
166	0.22
167	0.22
168	0.19
169	0.18
170	0.16
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.13
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.07
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.04
192	0.05
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.08
240	0.06
241	0.08
242	0.11
243	0.12
244	0.12
245	0.19
246	0.28
247	0.39
248	0.48
249	0.52
250	0.58
251	0.65
252	0.72
253	0.76
254	0.79
255	0.8
256	0.81
257	0.81
258	0.72
259	0.69
260	0.63
261	0.55
262	0.49
263	0.39
264	0.3
265	0.25
266	0.24
267	0.19
268	0.17
269	0.16
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.12
275	0.11
276	0.11
277	0.1
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.14
282	0.15
283	0.17
284	0.21
285	0.23
286	0.23
287	0.22
288	0.22
289	0.2
290	0.19
291	0.18
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.08
296	0.07
297	0.06
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.02
315	0.02
316	0.02
317	0.02
318	0.03
319	0.02
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.09
344	0.11
345	0.13
346	0.13
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.09
352	0.08
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.11
378	0.13
379	0.16
380	0.18
381	0.19
382	0.23
383	0.23
384	0.27
385	0.31
386	0.34
387	0.39
388	0.46
389	0.55
390	0.57
391	0.61
392	0.65
393	0.7
394	0.76
395	0.79
396	0.8
397	0.78
398	0.8
399	0.85
400	0.86
401	0.86
402	0.83
403	0.8
404	0.78
405	0.76
406	0.7
407	0.65
408	0.58
409	0.48
410	0.42
411	0.34
412	0.26
413	0.2
414	0.18
415	0.16
416	0.13
417	0.12
418	0.11
419	0.11
420	0.1
421	0.09
422	0.08
423	0.05
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.08
431	0.11
432	0.15
433	0.16
434	0.17
435	0.19
436	0.2
437	0.22
438	0.21
439	0.17
440	0.15
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.09
451	0.1
452	0.09
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.1
457	0.15
458	0.15
459	0.14
460	0.15
461	0.2
462	0.21
463	0.21
464	0.21
465	0.17
466	0.2
467	0.22
468	0.23
469	0.2
470	0.2
471	0.21
472	0.2
473	0.2
474	0.16
475	0.15
476	0.15
477	0.12
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.17
482	0.18
483	0.27
484	0.32
485	0.36
486	0.36
487	0.4
488	0.46
489	0.44
490	0.46
491	0.37
492	0.37
493	0.39
494	0.4
495	0.39
496	0.33
497	0.33
498	0.3

A0A316VYW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer