Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316W175

Protein Details
Accession A0A316W175    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-31AAPARETKRRPSRRTAESERKEREKABasic
39-59GDVQSRRKKRRLEELERGTRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-49RETKRRPSRRTAESERKEREKARAYRSDEGDVQSRRKKRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039723  Vps71/ZNHIT1  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MVSASAAPARETKRRPSRRTAESERKEREKARAYRSDEGDVQSRRKKRRLEELERGTRSGLDTSSIVLPSNSTYTGTLAGILAGRADARNLSDEELDLDFDGRAAGSELHSRSNATGSSAAGKTSRASSTKTGKHKLSAELQALLSTRKGFETRREEASQHPSWVASTANYDTAVAPPSRYPPSRSVPPLCSVCGYWGHQRCKRCDERLCSLSCTSTHDEARCERPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.74
4 0.79
5 0.8
6 0.85
7 0.85
8 0.85
9 0.84
10 0.87
11 0.85
12 0.82
13 0.79
14 0.74
15 0.73
16 0.72
17 0.7
18 0.7
19 0.7
20 0.7
21 0.71
22 0.71
23 0.66
24 0.58
25 0.53
26 0.51
27 0.46
28 0.47
29 0.47
30 0.52
31 0.55
32 0.6
33 0.65
34 0.64
35 0.71
36 0.74
37 0.76
38 0.79
39 0.81
40 0.83
41 0.78
42 0.71
43 0.6
44 0.5
45 0.41
46 0.32
47 0.21
48 0.13
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.04
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.12
114 0.14
115 0.19
116 0.27
117 0.34
118 0.4
119 0.44
120 0.43
121 0.47
122 0.47
123 0.45
124 0.43
125 0.41
126 0.35
127 0.31
128 0.3
129 0.26
130 0.24
131 0.2
132 0.15
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.12
137 0.13
138 0.21
139 0.28
140 0.31
141 0.37
142 0.39
143 0.39
144 0.42
145 0.48
146 0.41
147 0.35
148 0.32
149 0.25
150 0.23
151 0.23
152 0.18
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.16
166 0.22
167 0.24
168 0.27
169 0.31
170 0.38
171 0.45
172 0.51
173 0.53
174 0.5
175 0.55
176 0.53
177 0.48
178 0.42
179 0.35
180 0.3
181 0.29
182 0.29
183 0.32
184 0.38
185 0.46
186 0.49
187 0.56
188 0.6
189 0.65
190 0.7
191 0.7
192 0.71
193 0.69
194 0.74
195 0.74
196 0.71
197 0.65
198 0.58
199 0.52
200 0.43
201 0.42
202 0.38
203 0.37
204 0.39
205 0.37
206 0.4
207 0.42