Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VW16

Protein Details
Accession A0A316VW16    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-325LIGKKERREEERRKREIRREAVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-22KRKPR
305-321GKKERREEERRKREIRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MDHQSAASGSASVSLFKKRKPRGAAGGGSSSASAIFPSTAGSKDRSNLTSLGSTIASAEKADGAQKEEEKEAEEEEEEEEGGSAVRRAARGRASGKSALLRPSTSRTDSAQHFDAARERKRLGPSLGALGAERGIGMKRSMDVGMDSDAAKIRTENQTSYGPEMMASLKAATPRAPISSGQTLDQVDDDGVAESAMEQGVGLYAEEEIPSAERIAELKEARRRAARNGNGSAAASGSGHDAAATDYISLADDAVKMKGGRSGRLQRDSDSDADADEQQDEMGPASSRTRGHTDLEMEEEEKFLIGKKERREEERRKREIRREAVSRTYAKEDVATQNGGKEDQLESDDEWEKAQLKRMGLGLGDENVERGKKKNGRPYQPAPIPQVTPLPKSGTTTSTLASRLLALEEMETSHRNVKEQANRGLQGLKEEEEESRGSVKEAHEKLQFFKTLEEFVIALAVLFEEKGEMLDWLERQGEDALVHRTQRAKRQTLQVLFNSLALFHGPPTASLDPDVSESSDQDVRPMDFETPAHVSGGDVLGASDQEAQQTLQEVQSSVENLLSDVHSSVFRYPCSIDQAEAQGARDDEDSVHGRFEKWRGEYTEEYNVAWGGLALADIWNFWSRMEMCAWDPFASSSESALPSTSASTEAKWKARRNVADLSEFAWHRNLSSFVERWTDEPVGGDEEAIATLLSSALLAKLVRLVQGGAMNVWDKRQTDSLLHIVDQMSFVLDWKGVQFQSFIGLIFEMCRRQIEVFQDATWSSVAPIPSPSAGAPLQSHLRSGDAPESARAQARRIVLEKLLDLLHNLHKWSRFALLQDKERNDACIAQVLGGCAWNWIRGGCEGHAAAAQVEDLVARILKEFRAGGALGADLTSRYTNHLKHIVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.28
3 0.34
4 0.44
5 0.49
6 0.59
7 0.64
8 0.71
9 0.72
10 0.77
11 0.77
12 0.72
13 0.68
14 0.59
15 0.51
16 0.42
17 0.32
18 0.23
19 0.16
20 0.11
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.08
25 0.1
26 0.12
27 0.15
28 0.18
29 0.2
30 0.24
31 0.3
32 0.3
33 0.31
34 0.3
35 0.31
36 0.3
37 0.28
38 0.26
39 0.2
40 0.18
41 0.16
42 0.17
43 0.13
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.14
49 0.14
50 0.17
51 0.21
52 0.24
53 0.26
54 0.28
55 0.28
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.21
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.13
65 0.11
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.1
73 0.12
74 0.14
75 0.2
76 0.24
77 0.31
78 0.36
79 0.38
80 0.42
81 0.43
82 0.45
83 0.45
84 0.44
85 0.42
86 0.41
87 0.38
88 0.36
89 0.39
90 0.41
91 0.39
92 0.38
93 0.35
94 0.38
95 0.4
96 0.43
97 0.39
98 0.35
99 0.32
100 0.32
101 0.37
102 0.39
103 0.4
104 0.4
105 0.4
106 0.44
107 0.48
108 0.52
109 0.48
110 0.46
111 0.42
112 0.41
113 0.4
114 0.35
115 0.29
116 0.23
117 0.2
118 0.14
119 0.11
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.15
140 0.22
141 0.25
142 0.25
143 0.27
144 0.31
145 0.33
146 0.36
147 0.32
148 0.24
149 0.21
150 0.21
151 0.18
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.22
165 0.27
166 0.27
167 0.26
168 0.27
169 0.25
170 0.24
171 0.23
172 0.17
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.09
202 0.14
203 0.15
204 0.21
205 0.28
206 0.31
207 0.34
208 0.4
209 0.4
210 0.44
211 0.52
212 0.53
213 0.54
214 0.54
215 0.53
216 0.47
217 0.45
218 0.36
219 0.26
220 0.19
221 0.11
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.14
245 0.15
246 0.17
247 0.24
248 0.34
249 0.4
250 0.47
251 0.48
252 0.45
253 0.49
254 0.49
255 0.41
256 0.33
257 0.26
258 0.19
259 0.19
260 0.18
261 0.13
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.21
277 0.23
278 0.25
279 0.26
280 0.24
281 0.26
282 0.24
283 0.2
284 0.18
285 0.16
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.11
291 0.16
292 0.21
293 0.28
294 0.36
295 0.4
296 0.48
297 0.57
298 0.64
299 0.7
300 0.75
301 0.78
302 0.78
303 0.83
304 0.84
305 0.84
306 0.81
307 0.77
308 0.72
309 0.68
310 0.65
311 0.62
312 0.55
313 0.47
314 0.43
315 0.36
316 0.3
317 0.26
318 0.23
319 0.21
320 0.21
321 0.2
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.13
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.15
339 0.14
340 0.21
341 0.2
342 0.19
343 0.21
344 0.22
345 0.21
346 0.18
347 0.19
348 0.12
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.08
356 0.1
357 0.18
358 0.25
359 0.32
360 0.42
361 0.5
362 0.58
363 0.65
364 0.69
365 0.7
366 0.68
367 0.65
368 0.6
369 0.53
370 0.45
371 0.38
372 0.38
373 0.31
374 0.27
375 0.24
376 0.22
377 0.21
378 0.22
379 0.23
380 0.18
381 0.19
382 0.19
383 0.17
384 0.16
385 0.17
386 0.14
387 0.13
388 0.11
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.17
403 0.23
404 0.29
405 0.34
406 0.4
407 0.39
408 0.39
409 0.39
410 0.38
411 0.31
412 0.26
413 0.21
414 0.15
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.12
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.11
425 0.12
426 0.19
427 0.2
428 0.23
429 0.25
430 0.26
431 0.28
432 0.29
433 0.29
434 0.21
435 0.22
436 0.19
437 0.16
438 0.15
439 0.14
440 0.1
441 0.08
442 0.08
443 0.06
444 0.05
445 0.04
446 0.03
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.13
470 0.18
471 0.21
472 0.29
473 0.35
474 0.36
475 0.4
476 0.48
477 0.54
478 0.53
479 0.55
480 0.47
481 0.43
482 0.38
483 0.34
484 0.26
485 0.18
486 0.13
487 0.09
488 0.08
489 0.06
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.13
500 0.13
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.1
505 0.13
506 0.12
507 0.12
508 0.13
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.12
513 0.1
514 0.1
515 0.12
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.07
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.1
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.07
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.14
558 0.15
559 0.16
560 0.21
561 0.21
562 0.18
563 0.18
564 0.2
565 0.2
566 0.2
567 0.18
568 0.14
569 0.13
570 0.13
571 0.12
572 0.1
573 0.08
574 0.12
575 0.14
576 0.12
577 0.14
578 0.13
579 0.14
580 0.16
581 0.2
582 0.22
583 0.22
584 0.26
585 0.28
586 0.33
587 0.35
588 0.36
589 0.4
590 0.35
591 0.33
592 0.28
593 0.25
594 0.19
595 0.16
596 0.12
597 0.04
598 0.04
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.1
609 0.11
610 0.12
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.17
615 0.19
616 0.16
617 0.15
618 0.14
619 0.15
620 0.14
621 0.13
622 0.11
623 0.12
624 0.13
625 0.12
626 0.12
627 0.11
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.18
635 0.22
636 0.29
637 0.36
638 0.42
639 0.48
640 0.55
641 0.58
642 0.56
643 0.59
644 0.55
645 0.52
646 0.46
647 0.39
648 0.36
649 0.32
650 0.28
651 0.23
652 0.19
653 0.16
654 0.18
655 0.18
656 0.17
657 0.22
658 0.22
659 0.21
660 0.25
661 0.25
662 0.24
663 0.27
664 0.24
665 0.18
666 0.18
667 0.17
668 0.16
669 0.16
670 0.15
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.08
675 0.06
676 0.03
677 0.03
678 0.04
679 0.03
680 0.03
681 0.03
682 0.03
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.08
687 0.09
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.11
692 0.13
693 0.13
694 0.11
695 0.11
696 0.12
697 0.12
698 0.14
699 0.15
700 0.14
701 0.16
702 0.19
703 0.2
704 0.21
705 0.25
706 0.29
707 0.27
708 0.27
709 0.26
710 0.24
711 0.22
712 0.2
713 0.15
714 0.1
715 0.09
716 0.09
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.12
722 0.11
723 0.12
724 0.12
725 0.11
726 0.14
727 0.14
728 0.13
729 0.1
730 0.1
731 0.09
732 0.11
733 0.13
734 0.12
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.16
739 0.2
740 0.23
741 0.26
742 0.26
743 0.26
744 0.27
745 0.25
746 0.25
747 0.2
748 0.15
749 0.11
750 0.12
751 0.12
752 0.11
753 0.13
754 0.13
755 0.14
756 0.15
757 0.13
758 0.15
759 0.15
760 0.16
761 0.15
762 0.18
763 0.23
764 0.23
765 0.24
766 0.2
767 0.22
768 0.21
769 0.23
770 0.23
771 0.2
772 0.21
773 0.22
774 0.24
775 0.24
776 0.29
777 0.27
778 0.25
779 0.27
780 0.29
781 0.33
782 0.32
783 0.33
784 0.31
785 0.32
786 0.3
787 0.27
788 0.25
789 0.2
790 0.19
791 0.2
792 0.23
793 0.23
794 0.25
795 0.27
796 0.29
797 0.3
798 0.31
799 0.31
800 0.27
801 0.3
802 0.37
803 0.41
804 0.46
805 0.54
806 0.55
807 0.54
808 0.53
809 0.51
810 0.43
811 0.38
812 0.3
813 0.27
814 0.24
815 0.22
816 0.22
817 0.2
818 0.19
819 0.17
820 0.16
821 0.13
822 0.13
823 0.13
824 0.13
825 0.12
826 0.14
827 0.16
828 0.2
829 0.17
830 0.22
831 0.2
832 0.2
833 0.21
834 0.2
835 0.16
836 0.13
837 0.12
838 0.07
839 0.07
840 0.06
841 0.05
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.08
846 0.11
847 0.11
848 0.15
849 0.15
850 0.14
851 0.17
852 0.17
853 0.15
854 0.14
855 0.14
856 0.11
857 0.11
858 0.1
859 0.07
860 0.09
861 0.1
862 0.1
863 0.15
864 0.22
865 0.24
866 0.31