Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A8NRA5

Protein Details
Accession A8NRA5    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23QNPTSPSMRKRQRTLDMHSGNHydrophilic
60-82DEDKPKSDKKAGRRKIKIEFIQDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-96PKSDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAG
222-226KRRRR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033897  MADS_SRF-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cci:CC1G_07160  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00266  MADS_SRF_like  
Amino Acid Sequences MQQNPTSPSMRKRQRTLDMHSGNANPVDQHPPPQSGGPVPEDAFINDHDAADSAGEEDEDEDKPKSDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAGIMKKAYELSTLTGTQVLLLVVSETGLVYTFTTAKLQPLVTQPEGKNLIQACLNAPHGSLPSSMPVGPPIGRTSGPMIPPVPPPPSNLPGGLSIGSQNPGNLSKDDADDDHDDDAATHGGRPNAGDKRRRRASSTTGPPPGSAGSRGQTSPHSPNAAVPPPLNIPPGSQPGSQQHSSHQQSNAQSQIALGSPTSPQQQHTQVPASSTQYSSGSYGHHPGQQPAHHQQHDAGMYSGHMMSPGAYSYPPPGGPNAQGGPGQQQLGGLAAAAASHGHWGQAPQQPVGQSGHYGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.81
4 0.81
5 0.75
6 0.69
7 0.66
8 0.58
9 0.5
10 0.43
11 0.35
12 0.25
13 0.23
14 0.27
15 0.23
16 0.28
17 0.3
18 0.31
19 0.33
20 0.33
21 0.33
22 0.3
23 0.33
24 0.29
25 0.29
26 0.26
27 0.26
28 0.25
29 0.23
30 0.21
31 0.18
32 0.19
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.16
51 0.21
52 0.24
53 0.31
54 0.37
55 0.46
56 0.56
57 0.65
58 0.74
59 0.78
60 0.81
61 0.81
62 0.84
63 0.8
64 0.79
65 0.78
66 0.74
67 0.76
68 0.74
69 0.69
70 0.65
71 0.67
72 0.57
73 0.53
74 0.56
75 0.56
76 0.61
77 0.65
78 0.69
79 0.62
80 0.64
81 0.67
82 0.67
83 0.66
84 0.63
85 0.58
86 0.52
87 0.53
88 0.51
89 0.44
90 0.37
91 0.29
92 0.24
93 0.21
94 0.17
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.09
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.18
121 0.23
122 0.23
123 0.29
124 0.28
125 0.32
126 0.36
127 0.33
128 0.32
129 0.27
130 0.26
131 0.21
132 0.21
133 0.16
134 0.15
135 0.17
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.19
162 0.21
163 0.21
164 0.18
165 0.21
166 0.23
167 0.25
168 0.24
169 0.23
170 0.21
171 0.18
172 0.18
173 0.15
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.13
205 0.2
206 0.26
207 0.34
208 0.38
209 0.48
210 0.56
211 0.58
212 0.57
213 0.56
214 0.58
215 0.6
216 0.63
217 0.6
218 0.58
219 0.56
220 0.51
221 0.46
222 0.39
223 0.29
224 0.22
225 0.17
226 0.13
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.2
232 0.23
233 0.24
234 0.24
235 0.23
236 0.25
237 0.3
238 0.31
239 0.27
240 0.23
241 0.22
242 0.22
243 0.24
244 0.22
245 0.17
246 0.15
247 0.17
248 0.22
249 0.23
250 0.21
251 0.23
252 0.28
253 0.34
254 0.34
255 0.31
256 0.3
257 0.36
258 0.4
259 0.42
260 0.38
261 0.38
262 0.39
263 0.43
264 0.42
265 0.32
266 0.28
267 0.23
268 0.22
269 0.17
270 0.14
271 0.09
272 0.07
273 0.08
274 0.1
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.2
279 0.27
280 0.29
281 0.33
282 0.36
283 0.32
284 0.33
285 0.34
286 0.33
287 0.29
288 0.26
289 0.23
290 0.2
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.16
295 0.16
296 0.2
297 0.2
298 0.25
299 0.25
300 0.28
301 0.33
302 0.34
303 0.39
304 0.45
305 0.51
306 0.47
307 0.47
308 0.44
309 0.45
310 0.43
311 0.37
312 0.28
313 0.19
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.12
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.18
331 0.21
332 0.22
333 0.27
334 0.26
335 0.25
336 0.25
337 0.25
338 0.26
339 0.26
340 0.25
341 0.19
342 0.18
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.09
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.1
358 0.17
359 0.23
360 0.26
361 0.25
362 0.28
363 0.29
364 0.31
365 0.32
366 0.26
367 0.25