FuNGI

A0A316VX40

Protein Details

Accession

A0A316VX40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
853-876	HEDEDGRMRRRRRRGLALIKGNIR	Basic
947-967	SGTVGRGERRVRRNILRRGQR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
860-867	MRRRRRRG
954-967	ERRVRRNILRRGQR

Subcellular Location(s)

extr 11, plas 9, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MLSLLLPLLPLLLPLLLPLRLPLLLLPPLHQQRKGGTGGDRQHESDAIKSSWVSWQVNGLASIRVLAGQATLAGAHLRRGITCDFFAPLQEATHHLLALPLPSEMSEREAMESQSVAIHALREGQGAGGASGHFDLLVLMEELDNGMRSIRDVCPTVAFEARRVGEESNPSSPISGLLIHQPQMISSSSSSSASGPSTLAPKRTATAAPPPQMRYPETWQRALQSFASSAQVYSSASMGSLDVEERGAAAAAAAAAAARREAIRVLIRGPRNVGKSTFARMLLNAIISRRASATATRDAGGADEALAAAGARVGGTVYWLDTDPGQPEFAPAGVLGLYAFDLCATPNAPEKSFGDSWSGVDLGQEAEVFVGPAWCVAPYARTVKSHFLGDTTPKDCPRMYCSMVEDLVRVYEEVRLAPDSWSGRGLRDEGSSNIAGAGAGAALDGTLIINTHGWTSGLGADLNNAVERMTLPSHILDLQPSDQPLARANPPHFSRAQEATTDSRARAEESRDDAQMPPVPQHDASFPTPYVGRPYLDETGATLASPPVVWPLEPAAGAFCATSSRSGSGWSGRREGKRGLSAAEKRSVGLMAHLYQRSRPFLLPAAAAAAASLDQSRLETEEELARASDAPLNFAHHHPSSPPRIIRRARPAWDFATSLLAKRPCEVRVEQGLQAGLHVLDFAAAASVPDQLKLAALNGALVAIVVVDLPPPPPPPPPMLEAGLSSHDEPDQPCPWVLPAREGKEEGRGVHRERPYELEGAQAQAAAAAPATEMWREALSKPLPRVSRCAYLGMAIVRSIDPLSGKLSLIHSLSPQEISLALHHPPPPPPPASPSPAAAATFSAGATKSLEGHEDEDGRMRRRRRRGLALIKGNIRLPIWASLDHQHVRAISLGTPTPFKHVAAAQAEGTRRAPRDLQEQEQQLDTLAGVRLQDVPYLQWDDAMRGSGTVGRGERRVRRNILRRGQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.1
3	0.09
4	0.09
5	0.1
6	0.11
7	0.11
8	0.12
9	0.11
10	0.14
11	0.18
12	0.18
13	0.2
14	0.28
15	0.37
16	0.42
17	0.43
18	0.41
19	0.41
20	0.47
21	0.48
22	0.43
23	0.39
24	0.43
25	0.48
26	0.52
27	0.51
28	0.47
29	0.45
30	0.44
31	0.4
32	0.35
33	0.33
34	0.27
35	0.25
36	0.24
37	0.23
38	0.25
39	0.3
40	0.28
41	0.23
42	0.27
43	0.28
44	0.3
45	0.3
46	0.25
47	0.2
48	0.18
49	0.18
50	0.13
51	0.11
52	0.1
53	0.08
54	0.07
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.05
59	0.05
60	0.08
61	0.08
62	0.1
63	0.13
64	0.13
65	0.14
66	0.17
67	0.2
68	0.21
69	0.22
70	0.22
71	0.21
72	0.2
73	0.21
74	0.2
75	0.17
76	0.15
77	0.15
78	0.17
79	0.19
80	0.19
81	0.18
82	0.16
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.14
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.11
91	0.11
92	0.14
93	0.15
94	0.14
95	0.17
96	0.19
97	0.19
98	0.19
99	0.18
100	0.14
101	0.13
102	0.12
103	0.11
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.12
108	0.12
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.1
115	0.08
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.1
137	0.12
138	0.16
139	0.18
140	0.19
141	0.21
142	0.23
143	0.25
144	0.27
145	0.25
146	0.23
147	0.27
148	0.27
149	0.26
150	0.26
151	0.25
152	0.23
153	0.29
154	0.31
155	0.29
156	0.29
157	0.27
158	0.26
159	0.25
160	0.21
161	0.16
162	0.13
163	0.11
164	0.15
165	0.18
166	0.18
167	0.19
168	0.18
169	0.17
170	0.18
171	0.18
172	0.14
173	0.12
174	0.14
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.14
179	0.15
180	0.13
181	0.14
182	0.11
183	0.11
184	0.17
185	0.19
186	0.21
187	0.22
188	0.22
189	0.22
190	0.25
191	0.25
192	0.22
193	0.31
194	0.35
195	0.4
196	0.43
197	0.45
198	0.46
199	0.48
200	0.47
201	0.42
202	0.42
203	0.46
204	0.46
205	0.47
206	0.45
207	0.45
208	0.45
209	0.42
210	0.36
211	0.28
212	0.24
213	0.21
214	0.22
215	0.18
216	0.16
217	0.13
218	0.13
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.09
250	0.12
251	0.13
252	0.17
253	0.23
254	0.26
255	0.27
256	0.31
257	0.32
258	0.33
259	0.34
260	0.32
261	0.3
262	0.3
263	0.33
264	0.32
265	0.29
266	0.26
267	0.23
268	0.24
269	0.2
270	0.19
271	0.16
272	0.13
273	0.14
274	0.14
275	0.14
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.14
280	0.18
281	0.21
282	0.22
283	0.22
284	0.21
285	0.2
286	0.2
287	0.17
288	0.12
289	0.07
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.02
298	0.02
299	0.02
300	0.02
301	0.02
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.09
314	0.1
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.05
332	0.06
333	0.12
334	0.14
335	0.15
336	0.17
337	0.18
338	0.24
339	0.24
340	0.24
341	0.21
342	0.2
343	0.2
344	0.19
345	0.18
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.08
366	0.12
367	0.14
368	0.16
369	0.19
370	0.23
371	0.25
372	0.25
373	0.23
374	0.2
375	0.2
376	0.22
377	0.24
378	0.22
379	0.23
380	0.22
381	0.24
382	0.24
383	0.24
384	0.24
385	0.25
386	0.26
387	0.25
388	0.26
389	0.26
390	0.27
391	0.25
392	0.2
393	0.14
394	0.12
395	0.1
396	0.08
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.12
406	0.11
407	0.12
408	0.14
409	0.13
410	0.13
411	0.13
412	0.14
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.12
417	0.15
418	0.14
419	0.13
420	0.11
421	0.1
422	0.08
423	0.07
424	0.06
425	0.02
426	0.02
427	0.02
428	0.02
429	0.02
430	0.02
431	0.02
432	0.02
433	0.02
434	0.02
435	0.02
436	0.03
437	0.03
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.08
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.11
472	0.12
473	0.13
474	0.16
475	0.17
476	0.22
477	0.23
478	0.25
479	0.25
480	0.24
481	0.26
482	0.25
483	0.25
484	0.19
485	0.2
486	0.2
487	0.23
488	0.22
489	0.18
490	0.17
491	0.16
492	0.17
493	0.17
494	0.17
495	0.17
496	0.21
497	0.23
498	0.22
499	0.22
500	0.21
501	0.21
502	0.21
503	0.18
504	0.15
505	0.14
506	0.15
507	0.14
508	0.14
509	0.13
510	0.14
511	0.16
512	0.16
513	0.15
514	0.15
515	0.15
516	0.15
517	0.18
518	0.15
519	0.14
520	0.13
521	0.17
522	0.17
523	0.17
524	0.17
525	0.13
526	0.13
527	0.12
528	0.11
529	0.07
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.06
543	0.06
544	0.07
545	0.06
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.08
553	0.1
554	0.11
555	0.16
556	0.22
557	0.23
558	0.27
559	0.32
560	0.34
561	0.36
562	0.38
563	0.36
564	0.35
565	0.33
566	0.3
567	0.33
568	0.36
569	0.36
570	0.37
571	0.32
572	0.28
573	0.28
574	0.27
575	0.18
576	0.15
577	0.13
578	0.11
579	0.16
580	0.17
581	0.17
582	0.19
583	0.22
584	0.23
585	0.23
586	0.22
587	0.19
588	0.21
589	0.22
590	0.19
591	0.16
592	0.15
593	0.12
594	0.12
595	0.09
596	0.06
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.06
605	0.07
606	0.07
607	0.08
608	0.1
609	0.11
610	0.11
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.11
616	0.08
617	0.1
618	0.1
619	0.14
620	0.16
621	0.16
622	0.2
623	0.18
624	0.19
625	0.19
626	0.25
627	0.27
628	0.31
629	0.35
630	0.36
631	0.44
632	0.49
633	0.54
634	0.59
635	0.6
636	0.59
637	0.58
638	0.57
639	0.51
640	0.49
641	0.41
642	0.31
643	0.31
644	0.25
645	0.23
646	0.24
647	0.24
648	0.22
649	0.23
650	0.26
651	0.2
652	0.25
653	0.25
654	0.26
655	0.31
656	0.34
657	0.33
658	0.31
659	0.31
660	0.26
661	0.24
662	0.19
663	0.11
664	0.07
665	0.06
666	0.04
667	0.03
668	0.04
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.03
673	0.04
674	0.07
675	0.07
676	0.07
677	0.08
678	0.07
679	0.08
680	0.08
681	0.08
682	0.07
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.05
688	0.05
689	0.04
690	0.02
691	0.02
692	0.02
693	0.02
694	0.03
695	0.03
696	0.04
697	0.06
698	0.08
699	0.09
700	0.12
701	0.15
702	0.18
703	0.21
704	0.23
705	0.25
706	0.25
707	0.25
708	0.23
709	0.22
710	0.21
711	0.2
712	0.17
713	0.14
714	0.13
715	0.14
716	0.14
717	0.18
718	0.17
719	0.18
720	0.17
721	0.17
722	0.19
723	0.23
724	0.22
725	0.25
726	0.3
727	0.33
728	0.36
729	0.38
730	0.36
731	0.38
732	0.39
733	0.33
734	0.33
735	0.34
736	0.35
737	0.41
738	0.44
739	0.39
740	0.39
741	0.42
742	0.39
743	0.36
744	0.32
745	0.29
746	0.25
747	0.25
748	0.22
749	0.17
750	0.14
751	0.11
752	0.11
753	0.06
754	0.05
755	0.04
756	0.04
757	0.05
758	0.06
759	0.05
760	0.06
761	0.07
762	0.08
763	0.1
764	0.11
765	0.18
766	0.21
767	0.26
768	0.29
769	0.35
770	0.39
771	0.4
772	0.46
773	0.44
774	0.47
775	0.43
776	0.43
777	0.36
778	0.32
779	0.33
780	0.27
781	0.23
782	0.15
783	0.15
784	0.12
785	0.12
786	0.11
787	0.1
788	0.09
789	0.09
790	0.12
791	0.12
792	0.12
793	0.13
794	0.15
795	0.17
796	0.17
797	0.17
798	0.16
799	0.17
800	0.18
801	0.17
802	0.15
803	0.12
804	0.12
805	0.12
806	0.13
807	0.13
808	0.13
809	0.17
810	0.2
811	0.22
812	0.24
813	0.27
814	0.3
815	0.31
816	0.32
817	0.35
818	0.38
819	0.41
820	0.4
821	0.38
822	0.36
823	0.35
824	0.33
825	0.26
826	0.21
827	0.16
828	0.14
829	0.12
830	0.11
831	0.09
832	0.09
833	0.1
834	0.1
835	0.11
836	0.11
837	0.13
838	0.14
839	0.15
840	0.18
841	0.18
842	0.18
843	0.25
844	0.29
845	0.33
846	0.39
847	0.45
848	0.51
849	0.6
850	0.7
851	0.71
852	0.77
853	0.82
854	0.86
855	0.88
856	0.89
857	0.85
858	0.79
859	0.73
860	0.64
861	0.55
862	0.44
863	0.35
864	0.27
865	0.26
866	0.23
867	0.22
868	0.24
869	0.26
870	0.33
871	0.33
872	0.32
873	0.29
874	0.27
875	0.26
876	0.26
877	0.23
878	0.18
879	0.19
880	0.21
881	0.21
882	0.24
883	0.23
884	0.27
885	0.27
886	0.25
887	0.25
888	0.24
889	0.3
890	0.3
891	0.31
892	0.28
893	0.31
894	0.32
895	0.31
896	0.32
897	0.3
898	0.28
899	0.3
900	0.32
901	0.32
902	0.4
903	0.45
904	0.48
905	0.51
906	0.54
907	0.52
908	0.5
909	0.45
910	0.36
911	0.29
912	0.22
913	0.17
914	0.12
915	0.11
916	0.1
917	0.11
918	0.14
919	0.14
920	0.16
921	0.14
922	0.15
923	0.19
924	0.23
925	0.21
926	0.22
927	0.22
928	0.23
929	0.23
930	0.24
931	0.19
932	0.15
933	0.17
934	0.16
935	0.17
936	0.19
937	0.21
938	0.22
939	0.28
940	0.36
941	0.45
942	0.5
943	0.57
944	0.62
945	0.69
946	0.76
947	0.81

A0A316VX40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer