Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A316VWU4

Protein Details
Accession A0A316VWU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-73AQSDIRSHANKKRKNRDTHSAGRSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
547-587RAAKSARKAGNASAKARKEESKAARRHAQETKVAARKEAKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
Amino Acid Sequences MSSGRKLLRYDDLVEDSVGAFHSQSARNPRSVDFFRAGQQLWGSSAAAQSDIRSHANKKRKNRDTHSAGRSTRGVWNPAASAQAPHTATDGPDRSLELRQQQQQQQQQDSRHAHPEAPPPPPAQLNARSVVRDATSRHLSAAAKRSQSAASTHPVSAGFRFTAHAQALQASRVGEEEEHDEKEEEGEEHGPQQMEQQSVVASVPTLAAPASESPRDVIVQAAPSILSIPADEPSLPEWLLPWRDPEQRVEPGLDGWEPTPYRASESSHSDPDSGSEEADEDQSASRAPQTSGIAKPQTNSEEEEAEVAESLKSVPDRSDADPATNYVTRAEVTLPTSISGASLPGQSKSSAAEDLNVGKSPAAVVPAVQEAGLATHDDTRLEEDEVEESHQSMDADIRRTEEDEIEEEAEAMEEETEDWGEGYEWYNDEWERQMLGENAKPGVASAVMAMLAAGIGQESDEEAEDEDQAAHTTELDSDGRVIRSLTHDELWADEAMTSAFSAAVDQFKAMHSLGQNGLVISASDSPPPAANLTSSALWYDAPPPESRAAKSARKAGNASAKARKEESKAARRHAQETKVAARKEAKRLQAEQDARYAQAMEEMQAHRQIVAPLQPADNQPPAADSVSDSKMATPSSNAETLNSGPKRKIKGTIPPSAPLSGRPAWLAACATVSSTPNCVAGVECGGPKTSSTATATAQGGEQNLSARADASASGHAAPTSTAQGYDPELLQSLAHAWYYAGYYQGIAMAKHQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.25
4 0.21
5 0.18
6 0.12
7 0.08
8 0.09
9 0.15
10 0.17
11 0.23
12 0.33
13 0.36
14 0.4
15 0.43
16 0.43
17 0.46
18 0.48
19 0.48
20 0.42
21 0.41
22 0.41
23 0.44
24 0.42
25 0.36
26 0.33
27 0.28
28 0.25
29 0.24
30 0.2
31 0.15
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.14
38 0.17
39 0.2
40 0.23
41 0.3
42 0.37
43 0.47
44 0.55
45 0.63
46 0.71
47 0.77
48 0.83
49 0.85
50 0.87
51 0.86
52 0.88
53 0.85
54 0.83
55 0.75
56 0.69
57 0.62
58 0.54
59 0.53
60 0.48
61 0.43
62 0.35
63 0.36
64 0.33
65 0.32
66 0.32
67 0.24
68 0.21
69 0.19
70 0.24
71 0.22
72 0.21
73 0.22
74 0.19
75 0.2
76 0.26
77 0.26
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.26
83 0.31
84 0.3
85 0.36
86 0.41
87 0.49
88 0.55
89 0.61
90 0.65
91 0.68
92 0.69
93 0.68
94 0.65
95 0.66
96 0.64
97 0.59
98 0.59
99 0.53
100 0.46
101 0.46
102 0.51
103 0.47
104 0.45
105 0.44
106 0.38
107 0.4
108 0.39
109 0.36
110 0.33
111 0.34
112 0.34
113 0.36
114 0.37
115 0.34
116 0.33
117 0.33
118 0.27
119 0.25
120 0.23
121 0.25
122 0.28
123 0.27
124 0.27
125 0.29
126 0.3
127 0.33
128 0.39
129 0.38
130 0.35
131 0.35
132 0.37
133 0.34
134 0.34
135 0.3
136 0.25
137 0.25
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.22
144 0.21
145 0.15
146 0.13
147 0.15
148 0.14
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.15
153 0.19
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.09
162 0.09
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.1
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.13
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.21
230 0.27
231 0.29
232 0.33
233 0.34
234 0.35
235 0.36
236 0.33
237 0.28
238 0.23
239 0.23
240 0.18
241 0.14
242 0.1
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.13
248 0.16
249 0.17
250 0.2
251 0.19
252 0.27
253 0.3
254 0.3
255 0.31
256 0.28
257 0.26
258 0.25
259 0.24
260 0.17
261 0.13
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.09
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.11
276 0.13
277 0.17
278 0.19
279 0.23
280 0.25
281 0.24
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.13
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.09
303 0.12
304 0.14
305 0.2
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.2
310 0.21
311 0.19
312 0.17
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.09
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.06
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.1
429 0.09
430 0.06
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.12
471 0.15
472 0.16
473 0.15
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.17
478 0.13
479 0.1
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.04
486 0.04
487 0.03
488 0.04
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.09
497 0.11
498 0.1
499 0.13
500 0.13
501 0.15
502 0.15
503 0.12
504 0.12
505 0.1
506 0.09
507 0.07
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.1
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.14
529 0.14
530 0.17
531 0.21
532 0.23
533 0.23
534 0.25
535 0.29
536 0.34
537 0.38
538 0.44
539 0.44
540 0.45
541 0.46
542 0.47
543 0.5
544 0.49
545 0.51
546 0.5
547 0.49
548 0.48
549 0.5
550 0.48
551 0.43
552 0.47
553 0.51
554 0.52
555 0.55
556 0.59
557 0.63
558 0.62
559 0.65
560 0.63
561 0.58
562 0.54
563 0.54
564 0.56
565 0.56
566 0.53
567 0.5
568 0.51
569 0.52
570 0.56
571 0.57
572 0.55
573 0.54
574 0.58
575 0.6
576 0.61
577 0.6
578 0.51
579 0.51
580 0.44
581 0.38
582 0.35
583 0.29
584 0.19
585 0.19
586 0.17
587 0.12
588 0.17
589 0.17
590 0.18
591 0.21
592 0.21
593 0.17
594 0.19
595 0.18
596 0.16
597 0.19
598 0.21
599 0.2
600 0.21
601 0.24
602 0.24
603 0.28
604 0.28
605 0.24
606 0.2
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.16
611 0.13
612 0.16
613 0.17
614 0.19
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.19
619 0.18
620 0.14
621 0.16
622 0.19
623 0.21
624 0.2
625 0.19
626 0.21
627 0.22
628 0.3
629 0.31
630 0.3
631 0.32
632 0.38
633 0.44
634 0.45
635 0.51
636 0.48
637 0.55
638 0.6
639 0.65
640 0.62
641 0.6
642 0.59
643 0.54
644 0.48
645 0.39
646 0.38
647 0.31
648 0.28
649 0.25
650 0.23
651 0.2
652 0.21
653 0.2
654 0.14
655 0.13
656 0.11
657 0.12
658 0.14
659 0.15
660 0.15
661 0.16
662 0.17
663 0.16
664 0.16
665 0.15
666 0.13
667 0.13
668 0.15
669 0.15
670 0.14
671 0.15
672 0.16
673 0.16
674 0.15
675 0.17
676 0.15
677 0.17
678 0.19
679 0.21
680 0.21
681 0.26
682 0.27
683 0.23
684 0.23
685 0.21
686 0.19
687 0.17
688 0.16
689 0.13
690 0.14
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.12
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.12
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.12
704 0.12
705 0.12
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.15
711 0.18
712 0.2
713 0.18
714 0.15
715 0.16
716 0.16
717 0.15
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.09
724 0.1
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.11
730 0.11
731 0.15
732 0.15
733 0.13