Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VWU4

Protein Details
Accession A0A316VWU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-73AQSDIRSHANKKRKNRDTHSAGRSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
547-587RAAKSARKAGNASAKARKEESKAARRHAQETKVAARKEAKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
Amino Acid Sequences MSSGRKLLRYDDLVEDSVGAFHSQSARNPRSVDFFRAGQQLWGSSAAAQSDIRSHANKKRKNRDTHSAGRSTRGVWNPAASAQAPHTATDGPDRSLELRQQQQQQQQQDSRHAHPEAPPPPPAQLNARSVVRDATSRHLSAAAKRSQSAASTHPVSAGFRFTAHAQALQASRVGEEEEHDEKEEEGEEHGPQQMEQQSVVASVPTLAAPASESPRDVIVQAAPSILSIPADEPSLPEWLLPWRDPEQRVEPGLDGWEPTPYRASESSHSDPDSGSEEADEDQSASRAPQTSGIAKPQTNSEEEEAEVAESLKSVPDRSDADPATNYVTRAEVTLPTSISGASLPGQSKSSAAEDLNVGKSPAAVVPAVQEAGLATHDDTRLEEDEVEESHQSMDADIRRTEEDEIEEEAEAMEEETEDWGEGYEWYNDEWERQMLGENAKPGVASAVMAMLAAGIGQESDEEAEDEDQAAHTTELDSDGRVIRSLTHDELWADEAMTSAFSAAVDQFKAMHSLGQNGLVISASDSPPPAANLTSSALWYDAPPPESRAAKSARKAGNASAKARKEESKAARRHAQETKVAARKEAKRLQAEQDARYAQAMEEMQAHRQIVAPLQPADNQPPAADSVSDSKMATPSSNAETLNSGPKRKIKGTIPPSAPLSGRPAWLAACATVSSTPNCVAGVECGGPKTSSTATATAQGGEQNLSARADASASGHAAPTSTAQGYDPELLQSLAHAWYYAGYYQGIAMAKHQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.25
4 0.21
5 0.18
6 0.12
7 0.08
8 0.09
9 0.15
10 0.17
11 0.23
12 0.33
13 0.36
14 0.4
15 0.43
16 0.43
17 0.46
18 0.48
19 0.48
20 0.42
21 0.41
22 0.41
23 0.44
24 0.42
25 0.36
26 0.33
27 0.28
28 0.25
29 0.24
30 0.2
31 0.15
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.14
38 0.17
39 0.2
40 0.23
41 0.3
42 0.37
43 0.47
44 0.55
45 0.63
46 0.71
47 0.77
48 0.83
49 0.85
50 0.87
51 0.86
52 0.88
53 0.85
54 0.83
55 0.75
56 0.69
57 0.62
58 0.54
59 0.53
60 0.48
61 0.43
62 0.35
63 0.36
64 0.33
65 0.32
66 0.32
67 0.24
68 0.21
69 0.19
70 0.24
71 0.22
72 0.21
73 0.22
74 0.19
75 0.2
76 0.26
77 0.26
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.26
83 0.31
84 0.3
85 0.36
86 0.41
87 0.49
88 0.55
89 0.61
90 0.65
91 0.68
92 0.69
93 0.68
94 0.65
95 0.66
96 0.64
97 0.59
98 0.59
99 0.53
100 0.46
101 0.46
102 0.51
103 0.47
104 0.45
105 0.44
106 0.38
107 0.4
108 0.39
109 0.36
110 0.33
111 0.34
112 0.34
113 0.36
114 0.37
115 0.34
116 0.33
117 0.33
118 0.27
119 0.25
120 0.23
121 0.25
122 0.28
123 0.27
124 0.27
125 0.29
126 0.3
127 0.33
128 0.39
129 0.38
130 0.35
131 0.35
132 0.37
133 0.34
134 0.34
135 0.3
136 0.25
137 0.25
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.22
144 0.21
145 0.15
146 0.13
147 0.15
148 0.14
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.15
153 0.19
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.09
162 0.09
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.1
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.13
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.21
230 0.27
231 0.29
232 0.33
233 0.34
234 0.35
235 0.36
236 0.33
237 0.28
238 0.23
239 0.23
240 0.18
241 0.14
242 0.1
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.13
248 0.16
249 0.17
250 0.2
251 0.19
252 0.27
253 0.3
254 0.3
255 0.31
256 0.28
257 0.26
258 0.25
259 0.24
260 0.17
261 0.13
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.09
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.11
276 0.13
277 0.17
278 0.19
279 0.23
280 0.25
281 0.24
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.13
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.09
303 0.12
304 0.14
305 0.2
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.2
310 0.21
311 0.19
312 0.17
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.09
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.06
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.1
429 0.09
430 0.06
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.12
471 0.15
472 0.16
473 0.15
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.17
478 0.13
479 0.1
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.04
486 0.04
487 0.03
488 0.04
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.09
497 0.11
498 0.1
499 0.13
500 0.13
501 0.15
502 0.15
503 0.12
504 0.12
505 0.1
506 0.09
507 0.07
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.1
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.14
529 0.14
530 0.17
531 0.21
532 0.23
533 0.23
534 0.25
535 0.29
536 0.34
537 0.38
538 0.44
539 0.44
540 0.45
541 0.46
542 0.47
543 0.5
544 0.49
545 0.51
546 0.5
547 0.49
548 0.48
549 0.5
550 0.48
551 0.43
552 0.47
553 0.51
554 0.52
555 0.55
556 0.59
557 0.63
558 0.62
559 0.65
560 0.63
561 0.58
562 0.54
563 0.54
564 0.56
565 0.56
566 0.53
567 0.5
568 0.51
569 0.52
570 0.56
571 0.57
572 0.55
573 0.54
574 0.58
575 0.6
576 0.61
577 0.6
578 0.51
579 0.51
580 0.44
581 0.38
582 0.35
583 0.29
584 0.19
585 0.19
586 0.17
587 0.12
588 0.17
589 0.17
590 0.18
591 0.21
592 0.21
593 0.17
594 0.19
595 0.18
596 0.16
597 0.19
598 0.21
599 0.2
600 0.21
601 0.24
602 0.24
603 0.28
604 0.28
605 0.24
606 0.2
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.16
611 0.13
612 0.16
613 0.17
614 0.19
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.19
619 0.18
620 0.14
621 0.16
622 0.19
623 0.21
624 0.2
625 0.19
626 0.21
627 0.22
628 0.3
629 0.31
630 0.3
631 0.32
632 0.38
633 0.44
634 0.45
635 0.51
636 0.48
637 0.55
638 0.6
639 0.65
640 0.62
641 0.6
642 0.59
643 0.54
644 0.48
645 0.39
646 0.38
647 0.31
648 0.28
649 0.25
650 0.23
651 0.2
652 0.21
653 0.2
654 0.14
655 0.13
656 0.11
657 0.12
658 0.14
659 0.15
660 0.15
661 0.16
662 0.17
663 0.16
664 0.16
665 0.15
666 0.13
667 0.13
668 0.15
669 0.15
670 0.14
671 0.15
672 0.16
673 0.16
674 0.15
675 0.17
676 0.15
677 0.17
678 0.19
679 0.21
680 0.21
681 0.26
682 0.27
683 0.23
684 0.23
685 0.21
686 0.19
687 0.17
688 0.16
689 0.13
690 0.14
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.12
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.12
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.12
704 0.12
705 0.12
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.15
711 0.18
712 0.2
713 0.18
714 0.15
715 0.16
716 0.16
717 0.15
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.09
724 0.1
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.11
730 0.11
731 0.15
732 0.15
733 0.13