Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316W8D8

Protein Details
Accession A0A316W8D8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-200TARGRGRGRGRARGRPFRARGRGRGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-198ARGRGRGRGRARGRPFRARGRGR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12306  RRM_II_PABPs  
Amino Acid Sequences MSDHSDDIDFITNPNQTAGAGGSGAEAGGSGGDLDDAAEIAAMQARVKEMEAEASRLRDLQSDPNYRPDRNLVNDPIGVGALDEEKEEIDARSVFVGNVDYGASPEEIQQHFAACGTINRVTILCDKFTGHPKGFAYVEFSEPSLVANAMVMNESLFRGRLLKVTAKRTNVPGMTARGRGRGRGRARGRPFRARGRGRGYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.05
13 0.04
14 0.03
15 0.03
16 0.03
17 0.03
18 0.03
19 0.03
20 0.03
21 0.03
22 0.03
23 0.03
24 0.03
25 0.03
26 0.03
27 0.03
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.07
37 0.14
38 0.14
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.19
45 0.15
46 0.16
47 0.21
48 0.28
49 0.33
50 0.34
51 0.43
52 0.46
53 0.44
54 0.44
55 0.4
56 0.37
57 0.36
58 0.4
59 0.33
60 0.31
61 0.31
62 0.29
63 0.25
64 0.19
65 0.14
66 0.09
67 0.06
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.14
113 0.16
114 0.18
115 0.26
116 0.3
117 0.25
118 0.28
119 0.28
120 0.3
121 0.29
122 0.26
123 0.25
124 0.2
125 0.21
126 0.18
127 0.18
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.1
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.16
149 0.24
150 0.3
151 0.39
152 0.45
153 0.48
154 0.51
155 0.52
156 0.56
157 0.48
158 0.45
159 0.4
160 0.4
161 0.39
162 0.42
163 0.4
164 0.41
165 0.41
166 0.45
167 0.47
168 0.5
169 0.53
170 0.57
171 0.64
172 0.66
173 0.75
174 0.79
175 0.8
176 0.81
177 0.82
178 0.82
179 0.85
180 0.82
181 0.81