Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316W5L6

Protein Details
Accession A0A316W5L6    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-333DDSRRESETKGKRRRSRRSLSQSPSSHydrophilic
501-554AQSAQQKQRERERERERERERERDSEDSLRSGSSKKSRRKKRAKDRVDDWFDRPBasic
589-613SDASAGKEQRRQRRRGEPEFGRFARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
317-325KGKRRRSRR
446-459RDKRARGPPSRPGR
509-545RERERERERERERERDSEDSLRSGSSKKSRRKKRAKD
596-603EQRRQRRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MRQDDLFVLDTAPSPSISAQQHLPSTHANPTSDSGSSSFLSASTRSNGLLLPGHVTYEQAGPSQHPLSKPRADLARDSAPGPASAPSPPKDSSRAHAGSDPSTSLGAQGSPSKDPSNNAQREGEGEEEEEEDAELGDYAELELDADDSLNQSRWTRYYEDAKEQQVSNLLECNVCGQTGHLGKRCPHSQCLACGALDDHTTRECPHGVVCFRCGQTGHRISDCPKPRSTGRWQAECIRCGSSSHQDKGCPTLWRVYHWNTNAEWKRFRRNEALRIQKERQRLRRGFQDEDEDDSETSEAESDMKLDSDDSRRESETKGKRRRSRRSLSQSPSSDWDPAEIWCYNCASRGSHWGDDCPERYNARGDPSAYSHFMSLAGPFGSMFASQAPLAQSTARTNEHIRFGESTNHAFDFDLGDGASIRLAQDPSRRAASIVDQLIDSGRAIGRDKRARGPPSRPGRVGGGENAQGSSHSSSMPTRRRAERYQDATDAPHNARLQQREAQSAQQKQRERERERERERERERDSEDSLRSGSSKKSRRKKRAKDRVDDWFDRPSTATTSRKHAAARNSSSLSDRISGPTGRKNKSSTSDASAGKEQRRQRRRGEPEFGRFARADGAEHSRPASTFRPQFHGDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.18
4 0.19
5 0.21
6 0.24
7 0.28
8 0.32
9 0.31
10 0.34
11 0.32
12 0.34
13 0.38
14 0.38
15 0.34
16 0.33
17 0.35
18 0.35
19 0.31
20 0.29
21 0.23
22 0.22
23 0.21
24 0.19
25 0.16
26 0.14
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.2
50 0.23
51 0.25
52 0.27
53 0.31
54 0.37
55 0.42
56 0.42
57 0.43
58 0.46
59 0.46
60 0.46
61 0.48
62 0.48
63 0.43
64 0.42
65 0.39
66 0.32
67 0.29
68 0.26
69 0.2
70 0.14
71 0.17
72 0.22
73 0.21
74 0.25
75 0.27
76 0.3
77 0.34
78 0.36
79 0.36
80 0.41
81 0.41
82 0.39
83 0.41
84 0.41
85 0.37
86 0.36
87 0.32
88 0.23
89 0.21
90 0.18
91 0.15
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.14
96 0.16
97 0.17
98 0.2
99 0.23
100 0.24
101 0.26
102 0.33
103 0.4
104 0.41
105 0.42
106 0.41
107 0.39
108 0.39
109 0.39
110 0.32
111 0.22
112 0.19
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.12
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.11
139 0.13
140 0.15
141 0.18
142 0.21
143 0.25
144 0.33
145 0.37
146 0.44
147 0.47
148 0.48
149 0.48
150 0.45
151 0.41
152 0.38
153 0.34
154 0.26
155 0.23
156 0.21
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.08
164 0.14
165 0.19
166 0.24
167 0.25
168 0.29
169 0.32
170 0.39
171 0.44
172 0.42
173 0.4
174 0.41
175 0.41
176 0.4
177 0.42
178 0.37
179 0.3
180 0.27
181 0.25
182 0.19
183 0.18
184 0.15
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.18
194 0.2
195 0.21
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.22
202 0.29
203 0.33
204 0.34
205 0.31
206 0.32
207 0.33
208 0.42
209 0.48
210 0.42
211 0.37
212 0.39
213 0.4
214 0.45
215 0.51
216 0.52
217 0.5
218 0.51
219 0.53
220 0.58
221 0.6
222 0.54
223 0.48
224 0.39
225 0.33
226 0.29
227 0.3
228 0.3
229 0.31
230 0.34
231 0.34
232 0.34
233 0.34
234 0.37
235 0.38
236 0.31
237 0.26
238 0.28
239 0.26
240 0.28
241 0.33
242 0.32
243 0.35
244 0.34
245 0.36
246 0.3
247 0.4
248 0.42
249 0.41
250 0.45
251 0.41
252 0.5
253 0.5
254 0.53
255 0.53
256 0.54
257 0.58
258 0.6
259 0.68
260 0.63
261 0.67
262 0.67
263 0.62
264 0.64
265 0.64
266 0.64
267 0.64
268 0.62
269 0.59
270 0.64
271 0.65
272 0.59
273 0.53
274 0.51
275 0.41
276 0.41
277 0.38
278 0.29
279 0.23
280 0.2
281 0.18
282 0.11
283 0.1
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.16
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.27
302 0.33
303 0.42
304 0.49
305 0.57
306 0.64
307 0.73
308 0.82
309 0.83
310 0.83
311 0.83
312 0.84
313 0.84
314 0.82
315 0.8
316 0.71
317 0.63
318 0.57
319 0.47
320 0.39
321 0.29
322 0.24
323 0.16
324 0.14
325 0.15
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.13
332 0.14
333 0.12
334 0.12
335 0.2
336 0.23
337 0.25
338 0.25
339 0.24
340 0.26
341 0.27
342 0.27
343 0.22
344 0.2
345 0.18
346 0.19
347 0.21
348 0.2
349 0.2
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.22
354 0.23
355 0.22
356 0.21
357 0.17
358 0.15
359 0.15
360 0.13
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.14
381 0.14
382 0.16
383 0.18
384 0.21
385 0.26
386 0.25
387 0.25
388 0.24
389 0.24
390 0.28
391 0.27
392 0.26
393 0.23
394 0.23
395 0.21
396 0.19
397 0.18
398 0.13
399 0.11
400 0.09
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.04
407 0.04
408 0.06
409 0.07
410 0.09
411 0.15
412 0.17
413 0.2
414 0.22
415 0.22
416 0.21
417 0.21
418 0.23
419 0.23
420 0.22
421 0.2
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.16
426 0.13
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.1
431 0.14
432 0.22
433 0.29
434 0.32
435 0.39
436 0.46
437 0.52
438 0.57
439 0.61
440 0.62
441 0.65
442 0.69
443 0.63
444 0.57
445 0.53
446 0.49
447 0.44
448 0.37
449 0.31
450 0.26
451 0.25
452 0.23
453 0.19
454 0.16
455 0.16
456 0.15
457 0.12
458 0.1
459 0.11
460 0.14
461 0.24
462 0.31
463 0.36
464 0.41
465 0.48
466 0.55
467 0.6
468 0.66
469 0.67
470 0.67
471 0.64
472 0.61
473 0.55
474 0.51
475 0.47
476 0.43
477 0.34
478 0.32
479 0.27
480 0.29
481 0.33
482 0.34
483 0.36
484 0.37
485 0.38
486 0.38
487 0.4
488 0.43
489 0.46
490 0.51
491 0.54
492 0.56
493 0.59
494 0.6
495 0.68
496 0.71
497 0.7
498 0.72
499 0.74
500 0.78
501 0.8
502 0.85
503 0.81
504 0.81
505 0.82
506 0.81
507 0.76
508 0.73
509 0.69
510 0.64
511 0.62
512 0.58
513 0.53
514 0.45
515 0.4
516 0.34
517 0.3
518 0.27
519 0.3
520 0.32
521 0.4
522 0.48
523 0.58
524 0.68
525 0.78
526 0.87
527 0.91
528 0.92
529 0.94
530 0.95
531 0.94
532 0.9
533 0.9
534 0.88
535 0.81
536 0.73
537 0.7
538 0.6
539 0.51
540 0.45
541 0.36
542 0.32
543 0.35
544 0.38
545 0.33
546 0.4
547 0.42
548 0.44
549 0.46
550 0.47
551 0.49
552 0.52
553 0.56
554 0.55
555 0.55
556 0.53
557 0.52
558 0.47
559 0.4
560 0.33
561 0.27
562 0.23
563 0.25
564 0.27
565 0.28
566 0.36
567 0.42
568 0.45
569 0.49
570 0.49
571 0.53
572 0.56
573 0.58
574 0.53
575 0.52
576 0.55
577 0.52
578 0.53
579 0.53
580 0.53
581 0.53
582 0.55
583 0.57
584 0.6
585 0.67
586 0.7
587 0.72
588 0.76
589 0.81
590 0.84
591 0.86
592 0.84
593 0.84
594 0.86
595 0.78
596 0.71
597 0.61
598 0.52
599 0.47
600 0.38
601 0.3
602 0.25
603 0.32
604 0.3
605 0.31
606 0.32
607 0.27
608 0.27
609 0.3
610 0.3
611 0.32
612 0.36
613 0.39
614 0.45