Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YCX4

Protein Details
Accession A0A316YCX4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-108EVDPWSGRERRKRSKGDRRTTEIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-101RERRKRSKGD
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 7.5, cyto_nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
Amino Acid Sequences MGSRLEILNAGRLRLDGRKPLEFRSLAIEVGSSSISSPSVLSRPDGCARVQQGLTSVHASVYGPREARSRGSTLHDRAILDVEVEVDPWSGRERRKRSKGDRRTTEIEAAIKATFEPVLHLHLFPRSEVSIFVTVEHQDGGVLPCAINTVTLALLDAGIPMSDYVLGVCAGMHLASNQTLIDLSALEEGSLPSLVIAYLARSRTVTLAQLETRIHADALPGLVKIAGDACAGVLLTEIDAAMRARTKKLAEAMGGKGPPYNVADISPDDSRSGIETS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.31
4 0.36
5 0.44
6 0.46
7 0.49
8 0.55
9 0.48
10 0.44
11 0.42
12 0.38
13 0.3
14 0.28
15 0.23
16 0.15
17 0.16
18 0.15
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.22
31 0.26
32 0.27
33 0.26
34 0.29
35 0.31
36 0.34
37 0.32
38 0.27
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.22
43 0.2
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.16
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.21
53 0.23
54 0.26
55 0.26
56 0.25
57 0.24
58 0.3
59 0.36
60 0.36
61 0.39
62 0.38
63 0.34
64 0.33
65 0.32
66 0.25
67 0.18
68 0.14
69 0.11
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.1
77 0.12
78 0.18
79 0.28
80 0.37
81 0.47
82 0.57
83 0.67
84 0.75
85 0.82
86 0.88
87 0.89
88 0.87
89 0.84
90 0.79
91 0.72
92 0.64
93 0.55
94 0.45
95 0.35
96 0.28
97 0.2
98 0.15
99 0.12
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.06
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.17
195 0.17
196 0.2
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.12
230 0.14
231 0.16
232 0.21
233 0.23
234 0.27
235 0.31
236 0.34
237 0.33
238 0.36
239 0.38
240 0.4
241 0.39
242 0.34
243 0.3
244 0.27
245 0.25
246 0.23
247 0.22
248 0.16
249 0.16
250 0.19
251 0.2
252 0.24
253 0.23
254 0.21
255 0.2
256 0.19
257 0.19