Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YRJ9

Protein Details
Accession A0A316YRJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-181QLQHQQQKRQHLVREQRPKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
662-676RRREKEELQKRRIGG
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, mito 5, cyto 4.5, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MDGQFRPPAGRPYPGAQPQQSPGYPYASPGAPFPWSTPGGGGGGGPRPPPSTAASTPYTPASSFAQTTRGQNRASPQTPSQDQPVLPHLHPAYSGRGRPPLALGRRPPGVAAIPRRQVLAQQALASGGSSPDPKASARLYPSSYQKTRQQQATQQQRQQLLQLQHQQQKRQHLVREQRPKKVLDGREDLYLDTLGPTNRLLLSLKSGLPSHVTWALTRLINASYNHLDHLFLDALPGLVDALLSFPRKLVSAVRGEEPERWEPSYWEQEERDWDGMGRAAWEDEYDGEEDDEEEEGQTPRTKALPAARFSPSSIQSHARLLQNAISAMLILRNTALLEKNERTIVHHGRAINSLVCDLLSLPNVFPRDQGIDSAFKEIEGIDELRVYALDLLETTRHKLHIRKRATIAFDVHGIPTSAPDYAEAGKLASNDLEAAGDAGASVEDRAKAARRAGAGVADSILNLLVYHLHATNDRSILMGALRCLSALASEERHESFFVEVDVPTADGSSSISSPGILRKCLTLLPLTSDSPLLEAALDCLYQIVNIGNNVLRIGVSRYTDDVEDASANSAAVVGAPKPLGVGTGRRERILSQGDASSSSSSPDLGSSQAHGSRLNAGAGDARGVIRLLARNLIYNRVVWDRTHQLSLHPLLHSGIPGAVGARRREKEELQKRRIGGDLERAKLRRLQRNEWDEVKDMAEPDRLRAWMKLIYEAKDGGEVTQMDFWSTYRDQFAPYSELGGPPLQPAAEVIRTVSAVFPGAVAMVVPPSRFIIKGVETKDRSHLRKHECRWHGCLAPDVESRSLLISHIKAHCIIAPSGKCNWWHCTYSLPKDVPEEKAGDFLFRHALTHLPEDDEVVKKKEAEVQAKAREEAAKVFQDESKRVLLHPVALDSQQGGGGKARILAGPEGLKKRLRNDLPELESSIKKRAAILPRGTVDSPDILVFSVTRTPMDPETGKPTGISNTSCLILRSLARTTATIIHRAGLRERRVEPDAGSGGVRRFHPDERFGLPLPSDGGFAVAGVADVEVDGVGSGGGGGGGGGGGAGDNGGIGPAEGWMLTAASRLMDALIDVEDEMMAVSSENDILCPIINDILAEIKRNPVESIVTEWAPDEEGHEEGKGYEASPLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.57
3 0.52
4 0.53
5 0.53
6 0.56
7 0.53
8 0.48
9 0.42
10 0.38
11 0.34
12 0.32
13 0.31
14 0.25
15 0.25
16 0.22
17 0.23
18 0.21
19 0.21
20 0.21
21 0.23
22 0.23
23 0.23
24 0.22
25 0.21
26 0.2
27 0.19
28 0.17
29 0.14
30 0.17
31 0.18
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.21
36 0.23
37 0.25
38 0.28
39 0.29
40 0.33
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.35
45 0.32
46 0.25
47 0.25
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.23
52 0.27
53 0.28
54 0.36
55 0.4
56 0.41
57 0.39
58 0.41
59 0.47
60 0.51
61 0.52
62 0.49
63 0.47
64 0.5
65 0.53
66 0.52
67 0.5
68 0.45
69 0.43
70 0.41
71 0.44
72 0.4
73 0.36
74 0.41
75 0.36
76 0.31
77 0.33
78 0.31
79 0.33
80 0.34
81 0.38
82 0.35
83 0.41
84 0.41
85 0.4
86 0.43
87 0.44
88 0.45
89 0.49
90 0.5
91 0.49
92 0.51
93 0.51
94 0.45
95 0.39
96 0.37
97 0.37
98 0.4
99 0.43
100 0.45
101 0.46
102 0.47
103 0.43
104 0.41
105 0.4
106 0.39
107 0.33
108 0.28
109 0.28
110 0.27
111 0.27
112 0.23
113 0.16
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.17
122 0.19
123 0.23
124 0.27
125 0.31
126 0.34
127 0.38
128 0.46
129 0.51
130 0.53
131 0.53
132 0.58
133 0.62
134 0.66
135 0.69
136 0.68
137 0.68
138 0.74
139 0.79
140 0.8
141 0.76
142 0.74
143 0.7
144 0.64
145 0.59
146 0.56
147 0.49
148 0.48
149 0.51
150 0.54
151 0.57
152 0.6
153 0.64
154 0.62
155 0.67
156 0.69
157 0.66
158 0.65
159 0.67
160 0.73
161 0.76
162 0.82
163 0.78
164 0.78
165 0.76
166 0.71
167 0.69
168 0.68
169 0.64
170 0.61
171 0.61
172 0.53
173 0.53
174 0.51
175 0.43
176 0.35
177 0.29
178 0.2
179 0.15
180 0.15
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.16
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.2
195 0.22
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.2
202 0.23
203 0.2
204 0.2
205 0.18
206 0.15
207 0.19
208 0.2
209 0.23
210 0.23
211 0.23
212 0.24
213 0.23
214 0.21
215 0.17
216 0.2
217 0.15
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.05
229 0.07
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.12
236 0.15
237 0.18
238 0.23
239 0.25
240 0.28
241 0.3
242 0.31
243 0.33
244 0.34
245 0.34
246 0.3
247 0.3
248 0.28
249 0.27
250 0.32
251 0.38
252 0.35
253 0.35
254 0.33
255 0.33
256 0.37
257 0.38
258 0.33
259 0.24
260 0.23
261 0.19
262 0.19
263 0.17
264 0.13
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.17
290 0.26
291 0.31
292 0.31
293 0.35
294 0.36
295 0.36
296 0.37
297 0.38
298 0.32
299 0.28
300 0.29
301 0.28
302 0.27
303 0.3
304 0.33
305 0.3
306 0.28
307 0.26
308 0.26
309 0.23
310 0.22
311 0.18
312 0.13
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.07
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.1
323 0.1
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.21
328 0.21
329 0.23
330 0.29
331 0.32
332 0.3
333 0.32
334 0.32
335 0.31
336 0.33
337 0.31
338 0.24
339 0.19
340 0.16
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.15
356 0.17
357 0.16
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.19
362 0.15
363 0.15
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.08
380 0.08
381 0.11
382 0.11
383 0.14
384 0.17
385 0.24
386 0.32
387 0.4
388 0.45
389 0.49
390 0.53
391 0.56
392 0.56
393 0.53
394 0.47
395 0.38
396 0.34
397 0.29
398 0.24
399 0.19
400 0.15
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.06
433 0.08
434 0.11
435 0.12
436 0.15
437 0.15
438 0.16
439 0.16
440 0.16
441 0.14
442 0.12
443 0.11
444 0.08
445 0.07
446 0.06
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.07
457 0.09
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.11
502 0.12
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.11
510 0.1
511 0.13
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.11
519 0.07
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.08
569 0.12
570 0.2
571 0.21
572 0.22
573 0.22
574 0.22
575 0.26
576 0.27
577 0.23
578 0.16
579 0.16
580 0.16
581 0.17
582 0.17
583 0.13
584 0.1
585 0.1
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.09
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.13
601 0.12
602 0.1
603 0.08
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.07
614 0.07
615 0.09
616 0.09
617 0.13
618 0.13
619 0.17
620 0.16
621 0.15
622 0.17
623 0.17
624 0.18
625 0.15
626 0.19
627 0.21
628 0.22
629 0.24
630 0.21
631 0.2
632 0.23
633 0.26
634 0.24
635 0.18
636 0.17
637 0.16
638 0.16
639 0.15
640 0.11
641 0.08
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.07
646 0.1
647 0.13
648 0.19
649 0.2
650 0.23
651 0.26
652 0.31
653 0.4
654 0.47
655 0.55
656 0.55
657 0.58
658 0.56
659 0.54
660 0.52
661 0.43
662 0.35
663 0.34
664 0.33
665 0.32
666 0.35
667 0.34
668 0.33
669 0.36
670 0.41
671 0.4
672 0.41
673 0.46
674 0.51
675 0.57
676 0.61
677 0.6
678 0.55
679 0.48
680 0.42
681 0.36
682 0.27
683 0.21
684 0.17
685 0.18
686 0.16
687 0.15
688 0.17
689 0.17
690 0.17
691 0.17
692 0.18
693 0.17
694 0.17
695 0.23
696 0.23
697 0.24
698 0.25
699 0.25
700 0.22
701 0.2
702 0.2
703 0.12
704 0.12
705 0.1
706 0.1
707 0.12
708 0.11
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.13
713 0.13
714 0.14
715 0.14
716 0.15
717 0.16
718 0.17
719 0.19
720 0.17
721 0.16
722 0.18
723 0.16
724 0.16
725 0.15
726 0.15
727 0.13
728 0.1
729 0.11
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.09
734 0.09
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.1
740 0.09
741 0.06
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.05
746 0.05
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.06
754 0.07
755 0.08
756 0.08
757 0.09
758 0.12
759 0.15
760 0.21
761 0.24
762 0.32
763 0.33
764 0.35
765 0.42
766 0.46
767 0.45
768 0.47
769 0.53
770 0.54
771 0.61
772 0.67
773 0.69
774 0.7
775 0.72
776 0.7
777 0.67
778 0.6
779 0.52
780 0.5
781 0.41
782 0.37
783 0.34
784 0.3
785 0.25
786 0.22
787 0.21
788 0.16
789 0.15
790 0.11
791 0.12
792 0.11
793 0.16
794 0.17
795 0.18
796 0.18
797 0.19
798 0.2
799 0.2
800 0.19
801 0.2
802 0.21
803 0.22
804 0.25
805 0.27
806 0.28
807 0.29
808 0.34
809 0.32
810 0.32
811 0.3
812 0.35
813 0.4
814 0.43
815 0.48
816 0.43
817 0.4
818 0.44
819 0.46
820 0.41
821 0.37
822 0.32
823 0.25
824 0.28
825 0.27
826 0.23
827 0.2
828 0.18
829 0.19
830 0.17
831 0.17
832 0.13
833 0.16
834 0.16
835 0.2
836 0.19
837 0.17
838 0.17
839 0.18
840 0.2
841 0.22
842 0.23
843 0.22
844 0.22
845 0.21
846 0.22
847 0.27
848 0.31
849 0.33
850 0.37
851 0.42
852 0.48
853 0.5
854 0.5
855 0.45
856 0.4
857 0.35
858 0.31
859 0.28
860 0.23
861 0.22
862 0.24
863 0.24
864 0.26
865 0.27
866 0.27
867 0.26
868 0.24
869 0.23
870 0.26
871 0.24
872 0.24
873 0.23
874 0.23
875 0.2
876 0.2
877 0.2
878 0.15
879 0.15
880 0.12
881 0.12
882 0.1
883 0.1
884 0.11
885 0.11
886 0.12
887 0.12
888 0.11
889 0.13
890 0.12
891 0.13
892 0.17
893 0.22
894 0.25
895 0.28
896 0.32
897 0.34
898 0.38
899 0.46
900 0.46
901 0.47
902 0.52
903 0.57
904 0.56
905 0.55
906 0.54
907 0.48
908 0.47
909 0.42
910 0.4
911 0.33
912 0.29
913 0.29
914 0.34
915 0.39
916 0.44
917 0.46
918 0.47
919 0.47
920 0.5
921 0.48
922 0.41
923 0.34
924 0.26
925 0.22
926 0.16
927 0.14
928 0.1
929 0.1
930 0.09
931 0.09
932 0.11
933 0.11
934 0.11
935 0.12
936 0.15
937 0.17
938 0.22
939 0.22
940 0.22
941 0.29
942 0.3
943 0.29
944 0.26
945 0.26
946 0.25
947 0.27
948 0.25
949 0.2
950 0.2
951 0.21
952 0.21
953 0.2
954 0.17
955 0.17
956 0.17
957 0.18
958 0.19
959 0.2
960 0.21
961 0.21
962 0.22
963 0.27
964 0.27
965 0.28
966 0.26
967 0.26
968 0.28
969 0.29
970 0.35
971 0.36
972 0.38
973 0.4
974 0.42
975 0.46
976 0.46
977 0.46
978 0.4
979 0.37
980 0.34
981 0.28
982 0.27
983 0.23
984 0.22
985 0.24
986 0.24
987 0.22
988 0.25
989 0.3
990 0.35
991 0.37
992 0.39
993 0.39
994 0.43
995 0.39
996 0.38
997 0.32
998 0.28
999 0.25
1000 0.22
1001 0.18
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.1
1005 0.1
1006 0.08
1007 0.06
1008 0.05
1009 0.05
1010 0.05
1011 0.03
1012 0.03
1013 0.03
1014 0.03
1015 0.03
1016 0.03
1017 0.03
1018 0.03
1019 0.03
1020 0.03
1021 0.02
1022 0.02
1023 0.02
1024 0.02
1025 0.02
1026 0.02
1027 0.02
1028 0.02
1029 0.02
1030 0.02
1031 0.02
1032 0.02
1033 0.02
1034 0.02
1035 0.02
1036 0.03
1037 0.03
1038 0.03
1039 0.03
1040 0.03
1041 0.04
1042 0.04
1043 0.04
1044 0.05
1045 0.05
1046 0.05
1047 0.06
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.06
1051 0.06
1052 0.06
1053 0.06
1054 0.06
1055 0.06
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.06
1060 0.06
1061 0.06
1062 0.06
1063 0.05
1064 0.04
1065 0.04
1066 0.05
1067 0.05
1068 0.07
1069 0.07
1070 0.07
1071 0.07
1072 0.08
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.09
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.09
1079 0.09
1080 0.16
1081 0.16
1082 0.18
1083 0.18
1084 0.23
1085 0.25
1086 0.27
1087 0.27
1088 0.22
1089 0.25
1090 0.24
1091 0.29
1092 0.28
1093 0.26
1094 0.25
1095 0.25
1096 0.23
1097 0.21
1098 0.19
1099 0.15
1100 0.12
1101 0.14
1102 0.14
1103 0.14
1104 0.14
1105 0.12
1106 0.15
1107 0.13
1108 0.12