Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YYZ6

Protein Details
Accession A0A316YYZ6    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-43SAGDVSEKRHKKDKHKSKDGRDKEERRRDKHARKEAKAAAABasic
333-360APELVESHRKRKKERRSEGPRRKDEASABasic
365-387SEGESSSHSKREKKRRKKAEGHSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-40KRHKKDKHKSKDGRDKEERRRDKHARKEAKA
340-356HRKRKKERRSEGPRRKD
372-386HSKREKKRRKKAEGH
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSSAGDVSEKRHKKDKHKSKDGRDKEERRRDKHARKEAKAAAAATASSSQGSESRNGGAVLGEAESAFRYVYPVMQVSAPPVLAHNPKRAVQELLDTLLMRYVPQLDGVLLAHRQITLTRSHACIDSNSAYASFPVGLTALVWAPRIGMRLEGQLKLSTPSHISLLVHGIFNASITAAHLPSTKSPTMTVEDEQYEWHNFEDGEEYAEPNEDGETGAEEANGDEEMMTGEKSTGYWRNRETGARLGEDTDGRVSFTVVGLTIANNLLSLYGSLLKAPFSVPAPSTASTSTEPARRVRFRFQEDDDDDDDDDDDEEEGGADAGRAPPNGRAVGAPELVESHRKRKKERRSEGPRRKDEASASEGESEGESSSHSKREKKRRKKAEGHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.8
3 0.8
4 0.85
5 0.91
6 0.92
7 0.95
8 0.94
9 0.93
10 0.93
11 0.92
12 0.92
13 0.93
14 0.91
15 0.86
16 0.87
17 0.88
18 0.87
19 0.88
20 0.88
21 0.87
22 0.82
23 0.86
24 0.82
25 0.78
26 0.71
27 0.61
28 0.52
29 0.42
30 0.36
31 0.27
32 0.22
33 0.15
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.12
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.14
46 0.13
47 0.11
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.22
71 0.26
72 0.31
73 0.33
74 0.37
75 0.4
76 0.41
77 0.39
78 0.32
79 0.33
80 0.28
81 0.26
82 0.23
83 0.2
84 0.17
85 0.16
86 0.15
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.14
106 0.16
107 0.18
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.21
113 0.19
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.15
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.1
152 0.13
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.04
161 0.03
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.18
175 0.19
176 0.18
177 0.15
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.13
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.08
220 0.15
221 0.17
222 0.22
223 0.23
224 0.27
225 0.29
226 0.31
227 0.31
228 0.3
229 0.31
230 0.28
231 0.26
232 0.24
233 0.23
234 0.22
235 0.19
236 0.14
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.14
269 0.18
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.2
274 0.19
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.24
279 0.28
280 0.36
281 0.4
282 0.43
283 0.5
284 0.56
285 0.58
286 0.62
287 0.61
288 0.63
289 0.59
290 0.59
291 0.52
292 0.45
293 0.38
294 0.32
295 0.27
296 0.18
297 0.15
298 0.1
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.05
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.14
313 0.18
314 0.19
315 0.19
316 0.16
317 0.19
318 0.22
319 0.22
320 0.19
321 0.16
322 0.17
323 0.18
324 0.26
325 0.26
326 0.32
327 0.37
328 0.44
329 0.54
330 0.62
331 0.72
332 0.75
333 0.82
334 0.83
335 0.88
336 0.94
337 0.95
338 0.95
339 0.93
340 0.88
341 0.8
342 0.74
343 0.68
344 0.62
345 0.57
346 0.49
347 0.42
348 0.37
349 0.34
350 0.3
351 0.25
352 0.19
353 0.14
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.15
358 0.22
359 0.27
360 0.36
361 0.46
362 0.57
363 0.67
364 0.75
365 0.83
366 0.88
367 0.93