Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YUZ9

Protein Details
Accession A0A316YUZ9    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30VYNASRTTRQVLKRHRKEAPSLVLHydrophilic
378-399GGEKKAATKKKKKSKSASAAAAHydrophilic
412-439PSPAAQPTTKKKNKKKREKEEREAAEREBasic
459-483AASTGKKGKNKSKKKQKQEEEAAAAHydrophilic
508-529VTASGKKKSKKQQSATPNPPTQHydrophilic
748-769ALQQQQQQQQQQQHRHQQQPSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
379-393GEKKAATKKKKKSKS
421-438KKKNKKKREKEEREAAER
460-475ASTGKKGKNKSKKKQK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.333, mito 6.5, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATTASVYNASRTTRQVLKRHRKEAPSLVLHLFTNNFRFEKQNVTFSCDGPMKHLLGFIRDQKVPADLTDLFDEANVPFFEGCLIIEIHDHRPPSSSSASPLPASHLAKISKGSGSQQDGAKGRVGDRNNGDDDDDPSAGPSRSLSRSLGGNYGYFQRTGNRASGNADGSADGRASPNVYRVVLYPTPETLWSDLRQLNQGQGHRLWSDDEALEIESRILSLTSPPLCLTPDVQASRMANLTLSATALPSAYNPSSSASSGPPLPYHRHQQQAQTASTRKRGINSIEMEADEANRKKRDKIMRLMEYGGDRSAAIGRTKDGASAAAASAVAGTGGGFAPTFGRIAFIQRWKAAKDNEARRSVDGGGRLPDASAGAGDGGEKKAATKKKKKSKSASAAAAADDDEEEQVPPSPSPAAQPTTKKKNKKKREKEEREAAEREAQAAAAAAAAKVKEEQEAAAASTGKKGKNKSKKKQKQEEEAAAAAQQAQAAAAAAAAAAAAEANGDSSVTASGKKKSKKQQSATPNPPTQGNAAAAAAAAAAAAAGSASKSKTVKKKNSLASMTMSSSPVANSQSQQQQQQQQQQQQPQQMPDASNNSQLQQQLQQHLQQHMLQQQQQLHQQQQQGGMHSMGAGAGGLPNSMFPVGYPLQQQPGQQMSSPGLLGGGSPAMPFFGNNATGGTGGTTGNNGVFGAPPQQMTQQQLQQQQAIQRAMQQVQAHQAAQQQQAGQGQGQNFLMNGMQQHLQALAALQQQQQQQQQQQHRHQQQPSHDQQGQGGQGGQTNNDLPVGVGLANLPPNWGGLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.46
3 0.53
4 0.61
5 0.69
6 0.76
7 0.81
8 0.84
9 0.82
10 0.82
11 0.82
12 0.8
13 0.74
14 0.69
15 0.62
16 0.55
17 0.49
18 0.43
19 0.36
20 0.3
21 0.28
22 0.27
23 0.26
24 0.26
25 0.3
26 0.3
27 0.37
28 0.38
29 0.43
30 0.4
31 0.46
32 0.46
33 0.42
34 0.47
35 0.4
36 0.36
37 0.32
38 0.35
39 0.29
40 0.27
41 0.3
42 0.25
43 0.25
44 0.31
45 0.33
46 0.35
47 0.34
48 0.35
49 0.32
50 0.34
51 0.31
52 0.26
53 0.24
54 0.19
55 0.21
56 0.22
57 0.21
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.12
62 0.15
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.11
74 0.14
75 0.18
76 0.21
77 0.22
78 0.2
79 0.23
80 0.24
81 0.26
82 0.28
83 0.25
84 0.26
85 0.3
86 0.32
87 0.31
88 0.3
89 0.29
90 0.32
91 0.33
92 0.31
93 0.32
94 0.3
95 0.3
96 0.32
97 0.3
98 0.25
99 0.24
100 0.26
101 0.27
102 0.31
103 0.34
104 0.34
105 0.38
106 0.37
107 0.37
108 0.37
109 0.31
110 0.29
111 0.31
112 0.31
113 0.32
114 0.34
115 0.38
116 0.37
117 0.36
118 0.35
119 0.3
120 0.3
121 0.27
122 0.23
123 0.17
124 0.16
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.21
132 0.21
133 0.21
134 0.24
135 0.25
136 0.28
137 0.24
138 0.21
139 0.2
140 0.24
141 0.23
142 0.2
143 0.19
144 0.2
145 0.22
146 0.24
147 0.27
148 0.23
149 0.23
150 0.26
151 0.29
152 0.26
153 0.23
154 0.21
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.1
164 0.13
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.16
169 0.22
170 0.22
171 0.24
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.22
177 0.17
178 0.19
179 0.18
180 0.22
181 0.23
182 0.23
183 0.27
184 0.26
185 0.28
186 0.3
187 0.31
188 0.29
189 0.28
190 0.3
191 0.26
192 0.26
193 0.22
194 0.18
195 0.19
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.24
222 0.23
223 0.24
224 0.23
225 0.19
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.15
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.18
251 0.23
252 0.25
253 0.32
254 0.36
255 0.42
256 0.44
257 0.49
258 0.53
259 0.53
260 0.51
261 0.49
262 0.49
263 0.45
264 0.48
265 0.46
266 0.39
267 0.36
268 0.39
269 0.36
270 0.38
271 0.37
272 0.33
273 0.29
274 0.28
275 0.27
276 0.22
277 0.19
278 0.17
279 0.17
280 0.2
281 0.23
282 0.25
283 0.27
284 0.35
285 0.44
286 0.47
287 0.54
288 0.59
289 0.6
290 0.61
291 0.59
292 0.53
293 0.44
294 0.37
295 0.27
296 0.18
297 0.12
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.03
318 0.02
319 0.02
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.04
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.14
333 0.17
334 0.2
335 0.23
336 0.25
337 0.25
338 0.29
339 0.28
340 0.3
341 0.35
342 0.41
343 0.45
344 0.48
345 0.48
346 0.44
347 0.44
348 0.39
349 0.32
350 0.25
351 0.19
352 0.16
353 0.15
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.05
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.04
368 0.05
369 0.12
370 0.19
371 0.28
372 0.37
373 0.47
374 0.58
375 0.67
376 0.76
377 0.79
378 0.83
379 0.83
380 0.81
381 0.75
382 0.67
383 0.58
384 0.49
385 0.4
386 0.29
387 0.19
388 0.12
389 0.08
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.08
401 0.11
402 0.12
403 0.16
404 0.23
405 0.29
406 0.4
407 0.47
408 0.56
409 0.63
410 0.72
411 0.79
412 0.84
413 0.88
414 0.88
415 0.93
416 0.93
417 0.92
418 0.91
419 0.86
420 0.81
421 0.71
422 0.61
423 0.54
424 0.44
425 0.36
426 0.25
427 0.19
428 0.13
429 0.11
430 0.09
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.12
449 0.15
450 0.17
451 0.2
452 0.26
453 0.35
454 0.45
455 0.56
456 0.63
457 0.72
458 0.79
459 0.86
460 0.91
461 0.9
462 0.9
463 0.87
464 0.83
465 0.75
466 0.65
467 0.54
468 0.43
469 0.34
470 0.24
471 0.15
472 0.09
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.02
485 0.01
486 0.01
487 0.02
488 0.02
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.08
497 0.1
498 0.16
499 0.24
500 0.3
501 0.38
502 0.47
503 0.58
504 0.65
505 0.7
506 0.73
507 0.77
508 0.82
509 0.83
510 0.82
511 0.74
512 0.65
513 0.59
514 0.51
515 0.41
516 0.33
517 0.24
518 0.17
519 0.13
520 0.12
521 0.11
522 0.09
523 0.07
524 0.04
525 0.03
526 0.02
527 0.02
528 0.01
529 0.01
530 0.01
531 0.02
532 0.02
533 0.03
534 0.04
535 0.07
536 0.1
537 0.17
538 0.26
539 0.37
540 0.47
541 0.55
542 0.63
543 0.68
544 0.75
545 0.71
546 0.65
547 0.58
548 0.51
549 0.44
550 0.37
551 0.3
552 0.21
553 0.18
554 0.16
555 0.14
556 0.13
557 0.13
558 0.12
559 0.17
560 0.25
561 0.27
562 0.32
563 0.36
564 0.42
565 0.48
566 0.56
567 0.58
568 0.59
569 0.63
570 0.66
571 0.66
572 0.65
573 0.61
574 0.54
575 0.51
576 0.45
577 0.39
578 0.35
579 0.36
580 0.31
581 0.33
582 0.32
583 0.29
584 0.29
585 0.29
586 0.26
587 0.27
588 0.29
589 0.28
590 0.3
591 0.33
592 0.35
593 0.36
594 0.37
595 0.32
596 0.32
597 0.33
598 0.36
599 0.34
600 0.34
601 0.36
602 0.37
603 0.43
604 0.43
605 0.42
606 0.42
607 0.43
608 0.41
609 0.44
610 0.42
611 0.37
612 0.34
613 0.29
614 0.24
615 0.2
616 0.17
617 0.11
618 0.08
619 0.05
620 0.03
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.04
630 0.1
631 0.11
632 0.13
633 0.17
634 0.18
635 0.23
636 0.25
637 0.26
638 0.25
639 0.29
640 0.28
641 0.26
642 0.26
643 0.23
644 0.22
645 0.21
646 0.16
647 0.11
648 0.1
649 0.09
650 0.08
651 0.06
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.07
659 0.09
660 0.1
661 0.11
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.1
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.07
671 0.08
672 0.07
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.11
679 0.12
680 0.13
681 0.14
682 0.18
683 0.21
684 0.25
685 0.3
686 0.32
687 0.37
688 0.43
689 0.44
690 0.43
691 0.43
692 0.43
693 0.44
694 0.41
695 0.34
696 0.33
697 0.36
698 0.34
699 0.36
700 0.33
701 0.28
702 0.33
703 0.35
704 0.3
705 0.26
706 0.3
707 0.31
708 0.32
709 0.32
710 0.26
711 0.27
712 0.29
713 0.29
714 0.26
715 0.23
716 0.21
717 0.22
718 0.22
719 0.19
720 0.16
721 0.16
722 0.14
723 0.12
724 0.12
725 0.11
726 0.12
727 0.12
728 0.13
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.1
733 0.12
734 0.14
735 0.17
736 0.19
737 0.23
738 0.27
739 0.33
740 0.39
741 0.42
742 0.46
743 0.52
744 0.6
745 0.66
746 0.72
747 0.77
748 0.8
749 0.82
750 0.81
751 0.79
752 0.79
753 0.8
754 0.77
755 0.76
756 0.69
757 0.61
758 0.57
759 0.56
760 0.48
761 0.39
762 0.33
763 0.24
764 0.25
765 0.25
766 0.23
767 0.19
768 0.19
769 0.18
770 0.16
771 0.15
772 0.11
773 0.11
774 0.11
775 0.08
776 0.07
777 0.08
778 0.1
779 0.12
780 0.12
781 0.12
782 0.11