Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YD33

Protein Details
Accession A0A316YD33    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-120EEEEERKKKQKAPPGPKVMGBasic
440-465VRSCTPPSSQKKRSIKPPRPHKVVSQHydrophilic
616-637KTTLCSRTSSVRCKREPQRTILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-117ASKERPRPTPLASIKKEKLRRAEEEEEERKKKQKAPPGPK
450-461KKRSIKPPRPHK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MKRQASAVPLRECDDERPQPPASRRSGPSWSIEKELRLGTERTTRSQGRKPHEEPDRGTKRDAPSCSTNVTSSEQKPASKERPRPTPLASIKKEKLRRAEEEEEERKKKQKAPPGPKVMGEKGQGDNDARESEKKVEDEDRIIYLEPSSLRRVTEEELKKEKEALEQFKRDKVELLRVKKEIANRAAGASGTTSSQGLFPTKARGLAECPFCFKALPRKPSKELINKLQYWIDQRNRAGKDLSATDTIEDVCLRHIGESEILPEGHKRGWPRELDERKLRKRLEGHLSIMQRRIEEPESSEWFIRAREERKRLGRAADDIGNQMRDLEDSQAGYYGEVGYEVMRGFLLKRFASRDDSPHWLGSPEVAAKRRPLDSSSKFIDKVLLPELICLVIREDHGGDMAMQEAEQIRRESIRYGHLVFPSRPVEGKSIDDHDSDDEVRSCTPPSSQKKRSIKPPRPHKVVSQKQSHNIRPIPLSQKRREVEDEEAPLLASSSQSMPTASSSSLSLSSSSSSSTLAPFSSWDPLSSTPQAISSSSQEPTPSLQAVLEFDASPRKRQRLESLPLSQDSSIAILSSRKQVGDATMNIAEASTTVCLVSDDDDDEAKGEPAQQRPAKTTLCSRTSSVRCKREPQRTILSHTLSQPSPSVVKHDQFRVTGSAGTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.42
4 0.45
5 0.46
6 0.51
7 0.56
8 0.58
9 0.56
10 0.56
11 0.58
12 0.6
13 0.63
14 0.59
15 0.59
16 0.58
17 0.54
18 0.52
19 0.5
20 0.46
21 0.42
22 0.41
23 0.37
24 0.33
25 0.31
26 0.3
27 0.36
28 0.37
29 0.38
30 0.44
31 0.47
32 0.51
33 0.57
34 0.62
35 0.62
36 0.69
37 0.68
38 0.7
39 0.73
40 0.73
41 0.71
42 0.73
43 0.73
44 0.66
45 0.65
46 0.63
47 0.61
48 0.61
49 0.59
50 0.54
51 0.51
52 0.51
53 0.52
54 0.47
55 0.4
56 0.36
57 0.37
58 0.38
59 0.33
60 0.39
61 0.38
62 0.38
63 0.41
64 0.47
65 0.53
66 0.55
67 0.63
68 0.62
69 0.69
70 0.72
71 0.73
72 0.69
73 0.69
74 0.69
75 0.7
76 0.67
77 0.67
78 0.68
79 0.73
80 0.76
81 0.72
82 0.72
83 0.69
84 0.7
85 0.69
86 0.7
87 0.68
88 0.7
89 0.72
90 0.72
91 0.69
92 0.66
93 0.65
94 0.63
95 0.64
96 0.62
97 0.63
98 0.65
99 0.71
100 0.78
101 0.81
102 0.78
103 0.75
104 0.73
105 0.67
106 0.61
107 0.53
108 0.46
109 0.39
110 0.38
111 0.36
112 0.31
113 0.28
114 0.25
115 0.24
116 0.22
117 0.21
118 0.22
119 0.24
120 0.27
121 0.26
122 0.27
123 0.29
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.27
128 0.24
129 0.24
130 0.2
131 0.16
132 0.16
133 0.14
134 0.15
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.3
142 0.34
143 0.38
144 0.44
145 0.46
146 0.46
147 0.45
148 0.43
149 0.41
150 0.42
151 0.43
152 0.44
153 0.5
154 0.52
155 0.55
156 0.56
157 0.48
158 0.46
159 0.4
160 0.42
161 0.42
162 0.47
163 0.48
164 0.47
165 0.49
166 0.47
167 0.49
168 0.47
169 0.42
170 0.39
171 0.33
172 0.33
173 0.31
174 0.28
175 0.23
176 0.15
177 0.12
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.21
193 0.26
194 0.31
195 0.27
196 0.3
197 0.28
198 0.28
199 0.27
200 0.27
201 0.31
202 0.34
203 0.42
204 0.47
205 0.53
206 0.56
207 0.63
208 0.69
209 0.68
210 0.66
211 0.66
212 0.66
213 0.6
214 0.58
215 0.53
216 0.46
217 0.41
218 0.43
219 0.39
220 0.37
221 0.39
222 0.45
223 0.44
224 0.44
225 0.4
226 0.32
227 0.3
228 0.26
229 0.26
230 0.2
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.1
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.13
255 0.16
256 0.22
257 0.24
258 0.28
259 0.37
260 0.42
261 0.47
262 0.54
263 0.6
264 0.61
265 0.67
266 0.63
267 0.58
268 0.57
269 0.58
270 0.56
271 0.51
272 0.48
273 0.46
274 0.48
275 0.45
276 0.44
277 0.37
278 0.29
279 0.25
280 0.25
281 0.21
282 0.18
283 0.18
284 0.19
285 0.22
286 0.23
287 0.22
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.2
294 0.27
295 0.32
296 0.38
297 0.44
298 0.48
299 0.47
300 0.45
301 0.42
302 0.37
303 0.34
304 0.31
305 0.25
306 0.22
307 0.21
308 0.18
309 0.16
310 0.13
311 0.1
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.07
334 0.11
335 0.1
336 0.12
337 0.14
338 0.17
339 0.22
340 0.23
341 0.25
342 0.25
343 0.3
344 0.31
345 0.29
346 0.27
347 0.21
348 0.19
349 0.16
350 0.13
351 0.11
352 0.13
353 0.14
354 0.15
355 0.17
356 0.2
357 0.21
358 0.21
359 0.21
360 0.27
361 0.29
362 0.33
363 0.35
364 0.35
365 0.34
366 0.33
367 0.33
368 0.24
369 0.23
370 0.19
371 0.18
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.12
376 0.11
377 0.09
378 0.08
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.11
399 0.13
400 0.14
401 0.17
402 0.18
403 0.21
404 0.24
405 0.26
406 0.3
407 0.28
408 0.31
409 0.28
410 0.26
411 0.24
412 0.22
413 0.22
414 0.19
415 0.21
416 0.19
417 0.21
418 0.22
419 0.21
420 0.2
421 0.19
422 0.19
423 0.17
424 0.16
425 0.13
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.12
430 0.11
431 0.14
432 0.22
433 0.31
434 0.4
435 0.47
436 0.57
437 0.66
438 0.72
439 0.8
440 0.82
441 0.82
442 0.82
443 0.86
444 0.86
445 0.84
446 0.8
447 0.78
448 0.78
449 0.78
450 0.76
451 0.75
452 0.7
453 0.71
454 0.77
455 0.72
456 0.69
457 0.62
458 0.57
459 0.49
460 0.5
461 0.51
462 0.52
463 0.56
464 0.53
465 0.59
466 0.57
467 0.6
468 0.58
469 0.52
470 0.49
471 0.46
472 0.44
473 0.35
474 0.34
475 0.29
476 0.24
477 0.2
478 0.14
479 0.08
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.1
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.11
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.17
512 0.19
513 0.24
514 0.25
515 0.24
516 0.19
517 0.21
518 0.22
519 0.2
520 0.2
521 0.18
522 0.2
523 0.19
524 0.2
525 0.19
526 0.19
527 0.2
528 0.21
529 0.18
530 0.15
531 0.15
532 0.15
533 0.16
534 0.16
535 0.15
536 0.11
537 0.12
538 0.2
539 0.21
540 0.29
541 0.34
542 0.39
543 0.42
544 0.48
545 0.57
546 0.57
547 0.64
548 0.65
549 0.65
550 0.63
551 0.6
552 0.57
553 0.47
554 0.38
555 0.3
556 0.22
557 0.14
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.12
562 0.18
563 0.19
564 0.18
565 0.19
566 0.2
567 0.24
568 0.27
569 0.27
570 0.25
571 0.24
572 0.24
573 0.23
574 0.22
575 0.17
576 0.11
577 0.11
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.09
585 0.09
586 0.1
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.13
592 0.11
593 0.1
594 0.14
595 0.18
596 0.22
597 0.32
598 0.36
599 0.38
600 0.42
601 0.48
602 0.46
603 0.45
604 0.5
605 0.5
606 0.5
607 0.5
608 0.48
609 0.52
610 0.58
611 0.64
612 0.65
613 0.66
614 0.67
615 0.74
616 0.81
617 0.82
618 0.81
619 0.78
620 0.79
621 0.74
622 0.76
623 0.74
624 0.69
625 0.62
626 0.6
627 0.58
628 0.48
629 0.44
630 0.38
631 0.33
632 0.31
633 0.28
634 0.31
635 0.32
636 0.38
637 0.42
638 0.47
639 0.49
640 0.47
641 0.49
642 0.45
643 0.4