Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YPK5

Protein Details
Accession A0A316YPK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-340VDEVRGPAGKKKKKKKNASDESSAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-238SKRKTAKSGGGASRNEKRARR
295-306RNGKGPGGGKGK
320-332RGPAGKKKKKKKN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, cyto 12, nucl 11, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MAPVCTASQINLLIYHYLKESGFHHSCFSLRHESRLDEEPLSKEAVIEPGQLVKVLQKGLLYLAVEAHVNPDGSEKPCSAAFSLVGPAHVCDGQPRPTPSKETTPVPRKLTPSPPPAEVSTRKEMSVQTQADRVGGGGESSRKSTSRASSMGAPSPGTLAKVNGLHPGTAEAGTGTGTGSTAAEEAVASTSTSSQLASSKTKLDADSPRETTPGPSSSKRKTAKSGGGASRNEKRARRDTTEEASGSARGINGRGSVPNAASGEEEDNAAAEGDEEEDDAPTPRSGSNGHGNGGRNGKGPGGGKGKTAAAAQASAVDEVRGPAGKKKKKKKNASDESSAANASPSAALKESKAAKAAEANRIPTLSAVAKSKEVADTDVFRFRGHSAEVFLSAWNPTVPGLLATGAGDATVRIWDLGSAIIAEADGVESAVDAAPPPAVCKHLPATHSKDVSALSWNPDGTLLASGSYDGILRLWTPQGDLHLVMSMHQGPIFGVRWNRKGNLILTGSADGTAIVWDLGSGKVRQQYSLHSDSVLDIDWMTGSMSDSQPGMGDDATFATCSADNSVNILRIGETKPVKTLRGHDDEVNAIRFDPTGSLLASVSDDMTARIWSMDAILASSSASGVASSLSDVKVSKRERSTPRPSARGGSADMDVDEESTTQATDATAAAASSSTSHIQAESQDAVNGSSSSSSLAASAAGSNRSELCRHVLKGHTKEIYAVAWAPKRSDGGPRLLATASFDATARIWNADNGSCLRVVDQHTDSVYSVCFSPDARFLVTGGMDHRLFVTSVADGSLVKAYAGTGGIFDVTWHVQRTSGQDDQVKSGSGAPMQEEEEEQKPQQSDQAPNQSQEEKRGSLSSSNKQHLALSQADRTLVVLDVSDLASS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.17
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.25
9 0.28
10 0.28
11 0.29
12 0.28
13 0.3
14 0.31
15 0.35
16 0.36
17 0.34
18 0.39
19 0.41
20 0.42
21 0.44
22 0.48
23 0.46
24 0.38
25 0.4
26 0.36
27 0.34
28 0.34
29 0.29
30 0.23
31 0.2
32 0.22
33 0.2
34 0.19
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.19
39 0.18
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.15
45 0.15
46 0.17
47 0.19
48 0.16
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.16
60 0.18
61 0.22
62 0.2
63 0.2
64 0.22
65 0.23
66 0.22
67 0.2
68 0.18
69 0.17
70 0.21
71 0.19
72 0.19
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.19
80 0.25
81 0.31
82 0.36
83 0.4
84 0.43
85 0.49
86 0.49
87 0.54
88 0.53
89 0.54
90 0.59
91 0.62
92 0.67
93 0.67
94 0.68
95 0.63
96 0.65
97 0.67
98 0.65
99 0.65
100 0.61
101 0.58
102 0.56
103 0.54
104 0.54
105 0.51
106 0.49
107 0.49
108 0.46
109 0.43
110 0.42
111 0.4
112 0.38
113 0.41
114 0.37
115 0.31
116 0.33
117 0.33
118 0.31
119 0.29
120 0.23
121 0.15
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.12
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.21
131 0.26
132 0.29
133 0.32
134 0.32
135 0.33
136 0.37
137 0.4
138 0.42
139 0.37
140 0.32
141 0.26
142 0.26
143 0.24
144 0.19
145 0.16
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.17
150 0.22
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.18
156 0.16
157 0.15
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.1
183 0.14
184 0.17
185 0.19
186 0.21
187 0.23
188 0.25
189 0.25
190 0.28
191 0.33
192 0.35
193 0.41
194 0.41
195 0.4
196 0.39
197 0.38
198 0.35
199 0.32
200 0.3
201 0.28
202 0.32
203 0.38
204 0.43
205 0.52
206 0.55
207 0.55
208 0.57
209 0.6
210 0.61
211 0.62
212 0.65
213 0.62
214 0.64
215 0.63
216 0.61
217 0.6
218 0.59
219 0.58
220 0.54
221 0.54
222 0.56
223 0.6
224 0.61
225 0.61
226 0.6
227 0.59
228 0.6
229 0.53
230 0.45
231 0.39
232 0.32
233 0.25
234 0.19
235 0.15
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.11
252 0.11
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.14
274 0.21
275 0.22
276 0.23
277 0.26
278 0.28
279 0.31
280 0.33
281 0.3
282 0.23
283 0.22
284 0.21
285 0.2
286 0.19
287 0.22
288 0.24
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.24
293 0.21
294 0.21
295 0.15
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.14
310 0.24
311 0.32
312 0.42
313 0.52
314 0.63
315 0.72
316 0.82
317 0.87
318 0.88
319 0.91
320 0.88
321 0.84
322 0.75
323 0.67
324 0.57
325 0.46
326 0.34
327 0.23
328 0.16
329 0.1
330 0.08
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.13
337 0.16
338 0.16
339 0.19
340 0.18
341 0.17
342 0.23
343 0.26
344 0.29
345 0.28
346 0.29
347 0.27
348 0.27
349 0.26
350 0.2
351 0.18
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.14
364 0.16
365 0.2
366 0.2
367 0.18
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.14
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.02
411 0.02
412 0.02
413 0.02
414 0.02
415 0.02
416 0.02
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.07
426 0.08
427 0.1
428 0.13
429 0.16
430 0.18
431 0.23
432 0.3
433 0.33
434 0.33
435 0.31
436 0.29
437 0.26
438 0.25
439 0.23
440 0.16
441 0.13
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.08
448 0.08
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.03
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.08
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.06
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.14
482 0.18
483 0.24
484 0.26
485 0.27
486 0.27
487 0.29
488 0.28
489 0.29
490 0.26
491 0.21
492 0.2
493 0.2
494 0.18
495 0.15
496 0.14
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.04
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.04
505 0.04
506 0.06
507 0.06
508 0.08
509 0.13
510 0.14
511 0.16
512 0.16
513 0.2
514 0.25
515 0.29
516 0.27
517 0.22
518 0.22
519 0.21
520 0.21
521 0.16
522 0.09
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.09
549 0.1
550 0.09
551 0.12
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.11
557 0.12
558 0.13
559 0.17
560 0.18
561 0.17
562 0.22
563 0.24
564 0.26
565 0.26
566 0.31
567 0.32
568 0.36
569 0.38
570 0.34
571 0.34
572 0.35
573 0.35
574 0.3
575 0.23
576 0.16
577 0.14
578 0.13
579 0.12
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.05
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.04
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.04
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.08
619 0.1
620 0.18
621 0.21
622 0.27
623 0.31
624 0.4
625 0.48
626 0.57
627 0.66
628 0.68
629 0.73
630 0.71
631 0.68
632 0.63
633 0.57
634 0.5
635 0.42
636 0.34
637 0.27
638 0.22
639 0.2
640 0.17
641 0.14
642 0.11
643 0.09
644 0.07
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.11
667 0.14
668 0.14
669 0.13
670 0.13
671 0.13
672 0.14
673 0.14
674 0.13
675 0.09
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.08
686 0.09
687 0.1
688 0.1
689 0.11
690 0.13
691 0.15
692 0.15
693 0.15
694 0.19
695 0.23
696 0.24
697 0.29
698 0.35
699 0.42
700 0.47
701 0.53
702 0.5
703 0.44
704 0.44
705 0.4
706 0.33
707 0.26
708 0.23
709 0.21
710 0.23
711 0.24
712 0.24
713 0.24
714 0.25
715 0.25
716 0.31
717 0.3
718 0.32
719 0.36
720 0.35
721 0.36
722 0.34
723 0.33
724 0.28
725 0.25
726 0.19
727 0.14
728 0.13
729 0.12
730 0.12
731 0.15
732 0.12
733 0.12
734 0.12
735 0.13
736 0.16
737 0.16
738 0.18
739 0.18
740 0.18
741 0.17
742 0.16
743 0.16
744 0.17
745 0.2
746 0.23
747 0.23
748 0.24
749 0.25
750 0.26
751 0.26
752 0.22
753 0.19
754 0.14
755 0.12
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.12
760 0.16
761 0.18
762 0.18
763 0.18
764 0.18
765 0.2
766 0.19
767 0.18
768 0.15
769 0.17
770 0.16
771 0.16
772 0.16
773 0.15
774 0.15
775 0.14
776 0.14
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.08
782 0.09
783 0.1
784 0.09
785 0.08
786 0.08
787 0.08
788 0.08
789 0.09
790 0.08
791 0.06
792 0.06
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.09
797 0.1
798 0.13
799 0.15
800 0.15
801 0.16
802 0.19
803 0.25
804 0.29
805 0.3
806 0.33
807 0.37
808 0.38
809 0.41
810 0.4
811 0.35
812 0.29
813 0.28
814 0.25
815 0.21
816 0.21
817 0.18
818 0.19
819 0.19
820 0.19
821 0.18
822 0.2
823 0.22
824 0.25
825 0.24
826 0.26
827 0.26
828 0.26
829 0.31
830 0.33
831 0.37
832 0.43
833 0.53
834 0.51
835 0.53
836 0.57
837 0.57
838 0.53
839 0.54
840 0.5
841 0.41
842 0.4
843 0.4
844 0.38
845 0.39
846 0.45
847 0.46
848 0.5
849 0.53
850 0.53
851 0.51
852 0.51
853 0.45
854 0.43
855 0.4
856 0.36
857 0.35
858 0.34
859 0.33
860 0.31
861 0.29
862 0.25
863 0.18
864 0.13
865 0.09
866 0.09
867 0.1