Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YS54

Protein Details
Accession A0A316YS54    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-170KPKAKASAAKRGKRKREQDSBasic
249-283MVAQDKKARGRPKKVKPEMEEKKPRGQPKKVKAEEBasic
288-310DETRPEESKPRGRPKKVKAEETEBasic
315-338GESEVKDKKGRGRPKKVKAEEAEABasic
361-385PSASSAGKKGRGRPKKEVREEAPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-166KGRSSKGKSKIKKDGSASPSKPKAKASAAKRGKRKR
194-209KSKARGRPPGSKNKAK
254-282KKARGRPKKVKPEMEEKKPRGQPKKVKAE
291-305RPEESKPRGRPKKVK
320-332KDKKGRGRPKKVK
367-402GKKGRGRPKKEVREEAPSSDGAEAPKKARGRPKKAA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MAYRLEYSKSGKAGCRGPKPCTGTKIVKGALRFGTVVDIQGHTSFFWRHWGCVTPTQIRNIRTTWGEDVGELDGFEDLTEEDQARVRAAVMEGCVAEEDIPESAKKNPDDEEEEGDEGELPDDKAKEVDIKGRSSKGKSKIKKDGSASPSKPKAKASAAKRGKRKREQDSDAEEPSPKGEDDDGEEEDVKPDVKSKARGRPPGSKNKAKTAGDEDKTATENGEKEAPHGQSRKVKVEKTEAEEDETNEMVAQDKKARGRPKKVKPEMEEKKPRGQPKKVKAEEQNEGDETRPEESKPRGRPKKVKAEETELENVGESEVKDKKGRGRPKKVKAEEAEAELDEPQVNAVEVKTEAEETQEAPSASSAGKKGRGRPKKEVREEAPSSDGAEAPKKARGRPKKAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.59
3 0.59
4 0.6
5 0.65
6 0.67
7 0.68
8 0.65
9 0.64
10 0.62
11 0.62
12 0.65
13 0.61
14 0.57
15 0.51
16 0.51
17 0.46
18 0.4
19 0.33
20 0.25
21 0.25
22 0.22
23 0.23
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.13
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.23
34 0.22
35 0.23
36 0.25
37 0.3
38 0.33
39 0.39
40 0.45
41 0.44
42 0.46
43 0.53
44 0.56
45 0.53
46 0.51
47 0.45
48 0.43
49 0.37
50 0.37
51 0.32
52 0.3
53 0.28
54 0.24
55 0.24
56 0.21
57 0.19
58 0.14
59 0.11
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.04
65 0.05
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.1
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.12
91 0.17
92 0.18
93 0.2
94 0.22
95 0.25
96 0.31
97 0.32
98 0.33
99 0.3
100 0.29
101 0.27
102 0.25
103 0.21
104 0.15
105 0.13
106 0.08
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.13
114 0.13
115 0.2
116 0.21
117 0.25
118 0.28
119 0.33
120 0.37
121 0.38
122 0.44
123 0.47
124 0.54
125 0.58
126 0.64
127 0.7
128 0.73
129 0.74
130 0.71
131 0.7
132 0.67
133 0.69
134 0.63
135 0.61
136 0.62
137 0.59
138 0.57
139 0.5
140 0.48
141 0.46
142 0.5
143 0.47
144 0.5
145 0.56
146 0.61
147 0.69
148 0.73
149 0.76
150 0.78
151 0.81
152 0.8
153 0.8
154 0.79
155 0.77
156 0.75
157 0.69
158 0.61
159 0.53
160 0.44
161 0.34
162 0.29
163 0.22
164 0.14
165 0.1
166 0.08
167 0.07
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.09
177 0.06
178 0.09
179 0.11
180 0.14
181 0.22
182 0.27
183 0.36
184 0.43
185 0.51
186 0.54
187 0.61
188 0.65
189 0.69
190 0.7
191 0.69
192 0.65
193 0.65
194 0.67
195 0.58
196 0.53
197 0.5
198 0.51
199 0.44
200 0.43
201 0.36
202 0.29
203 0.3
204 0.27
205 0.19
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.17
213 0.18
214 0.22
215 0.23
216 0.27
217 0.31
218 0.35
219 0.42
220 0.42
221 0.43
222 0.41
223 0.48
224 0.48
225 0.47
226 0.49
227 0.41
228 0.4
229 0.38
230 0.35
231 0.29
232 0.24
233 0.18
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.16
241 0.2
242 0.27
243 0.36
244 0.43
245 0.53
246 0.62
247 0.69
248 0.77
249 0.82
250 0.85
251 0.8
252 0.83
253 0.81
254 0.81
255 0.81
256 0.74
257 0.74
258 0.71
259 0.75
260 0.74
261 0.75
262 0.74
263 0.74
264 0.81
265 0.76
266 0.78
267 0.77
268 0.75
269 0.72
270 0.66
271 0.59
272 0.49
273 0.45
274 0.38
275 0.31
276 0.25
277 0.2
278 0.17
279 0.14
280 0.19
281 0.25
282 0.33
283 0.41
284 0.51
285 0.59
286 0.68
287 0.78
288 0.82
289 0.86
290 0.85
291 0.85
292 0.79
293 0.78
294 0.71
295 0.67
296 0.61
297 0.5
298 0.42
299 0.33
300 0.27
301 0.19
302 0.17
303 0.11
304 0.12
305 0.15
306 0.18
307 0.2
308 0.23
309 0.33
310 0.41
311 0.52
312 0.58
313 0.66
314 0.74
315 0.82
316 0.9
317 0.87
318 0.87
319 0.81
320 0.78
321 0.7
322 0.64
323 0.55
324 0.44
325 0.39
326 0.29
327 0.25
328 0.17
329 0.13
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.14
343 0.13
344 0.15
345 0.17
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.14
351 0.17
352 0.18
353 0.2
354 0.28
355 0.33
356 0.42
357 0.52
358 0.62
359 0.66
360 0.74
361 0.8
362 0.83
363 0.88
364 0.89
365 0.84
366 0.83
367 0.79
368 0.73
369 0.65
370 0.54
371 0.46
372 0.37
373 0.33
374 0.26
375 0.27
376 0.26
377 0.25
378 0.31
379 0.33
380 0.39
381 0.49
382 0.57