Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

D6RJS7

Protein Details
Accession D6RJS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
630-654RPPTLISKEKQKQIRRNLKEYSRAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
361-369KSGSKAAKK
688-701KKELGEEKAKKETK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011400  EIF3B  
IPR034363  eIF3B_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG cci:CC1G_13660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12278  RRM_eIF3B  
Amino Acid Sequences MPAQNIDDIDYSDIEAKYQVHFDDSLDNTVVVDGLPVIDPSKQTKLLSKVVKEFSKRGVAVKADDIFLPWDQASGKSKGYAFIEFRNIDDANHAIAVLDRHPFDANHTFRVNKFTDIETLANFDERYEEPEDEEYAPREHLRSWLADPQGRDQYVTYRGDEVAIHWHGKPSQCEVAYKPEWKDFLYVAWSPLGTYIATLHRQGVRLWGGASWKPIQRFAHPMVKLIDFSPCENYLVTWSNEPIVVPEGAVQGPQYFSPDDEGNNLAVWDIKSGDLLRTFSTLNDGEAAPKKQMQWPTLKWSPDDKFVGRVTPGQMISVYELPSMGLHGKKSIKIDGVVDFEWCPQGDKDRDDAEKDAKAAKSGSKAAKKARENMLVYWTPEVANQPARVTLINFPTRAILRQKNLFNVTECKLYWQNQGDFLCVKVDRHTKTKKSIFCNLEIFRLREKDYPVEVVELKDTVLDFSWEPKGERFAIVSSSDPNLGNPGPGITIKTDVSFYQLDRAKNDFRLLRTLPNRTSNAIRWSPRGRHVVLATVGSSTKSELEFWDLDFTLDDTKKDSEWGSNIQLLGSADHYGVTDVEWDPSGRYLATSASAWTHTLENGFAIWDFRGQELTKQIQDRFKQFIWRPRPPTLISKEKQKQIRRNLKEYSRAFDEEDAAEESNVSAELIALRKRLVDEWNAWRTLRKKELGEEKAKKETKKSEVKEEIEVWIDEVIEQTEEVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.19
6 0.18
7 0.16
8 0.17
9 0.18
10 0.23
11 0.24
12 0.26
13 0.24
14 0.24
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.11
19 0.09
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.12
27 0.16
28 0.22
29 0.25
30 0.27
31 0.34
32 0.39
33 0.47
34 0.52
35 0.54
36 0.56
37 0.6
38 0.66
39 0.64
40 0.61
41 0.59
42 0.6
43 0.55
44 0.5
45 0.48
46 0.44
47 0.42
48 0.44
49 0.4
50 0.32
51 0.31
52 0.28
53 0.24
54 0.21
55 0.2
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.18
60 0.22
61 0.22
62 0.23
63 0.24
64 0.25
65 0.28
66 0.3
67 0.32
68 0.3
69 0.31
70 0.38
71 0.35
72 0.35
73 0.36
74 0.33
75 0.27
76 0.26
77 0.23
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.16
90 0.21
91 0.29
92 0.3
93 0.32
94 0.35
95 0.36
96 0.36
97 0.43
98 0.38
99 0.32
100 0.32
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.29
105 0.23
106 0.24
107 0.21
108 0.2
109 0.18
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.23
119 0.21
120 0.23
121 0.21
122 0.18
123 0.2
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.19
128 0.19
129 0.2
130 0.23
131 0.27
132 0.31
133 0.33
134 0.34
135 0.36
136 0.41
137 0.38
138 0.35
139 0.29
140 0.29
141 0.33
142 0.33
143 0.28
144 0.23
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.2
152 0.18
153 0.21
154 0.23
155 0.27
156 0.28
157 0.26
158 0.3
159 0.3
160 0.32
161 0.32
162 0.38
163 0.39
164 0.42
165 0.39
166 0.37
167 0.37
168 0.35
169 0.35
170 0.26
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.23
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.18
195 0.19
196 0.2
197 0.23
198 0.22
199 0.23
200 0.24
201 0.29
202 0.3
203 0.3
204 0.35
205 0.37
206 0.41
207 0.38
208 0.4
209 0.37
210 0.36
211 0.33
212 0.27
213 0.26
214 0.19
215 0.2
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.16
222 0.18
223 0.18
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.13
273 0.17
274 0.18
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.21
279 0.26
280 0.26
281 0.3
282 0.32
283 0.39
284 0.43
285 0.43
286 0.4
287 0.42
288 0.4
289 0.38
290 0.39
291 0.31
292 0.3
293 0.3
294 0.29
295 0.23
296 0.23
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.18
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.19
322 0.17
323 0.19
324 0.16
325 0.16
326 0.14
327 0.13
328 0.13
329 0.11
330 0.1
331 0.07
332 0.13
333 0.14
334 0.16
335 0.18
336 0.21
337 0.22
338 0.23
339 0.24
340 0.22
341 0.2
342 0.19
343 0.2
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.2
350 0.26
351 0.27
352 0.31
353 0.36
354 0.44
355 0.44
356 0.48
357 0.49
358 0.5
359 0.47
360 0.44
361 0.43
362 0.36
363 0.34
364 0.28
365 0.22
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.14
378 0.17
379 0.19
380 0.19
381 0.18
382 0.2
383 0.2
384 0.21
385 0.24
386 0.23
387 0.25
388 0.31
389 0.33
390 0.35
391 0.38
392 0.36
393 0.32
394 0.31
395 0.29
396 0.25
397 0.23
398 0.23
399 0.23
400 0.24
401 0.28
402 0.29
403 0.28
404 0.31
405 0.31
406 0.29
407 0.26
408 0.24
409 0.21
410 0.16
411 0.16
412 0.15
413 0.22
414 0.23
415 0.31
416 0.39
417 0.42
418 0.51
419 0.58
420 0.59
421 0.58
422 0.65
423 0.59
424 0.56
425 0.58
426 0.5
427 0.49
428 0.45
429 0.41
430 0.36
431 0.35
432 0.33
433 0.29
434 0.31
435 0.27
436 0.26
437 0.26
438 0.23
439 0.24
440 0.22
441 0.19
442 0.17
443 0.13
444 0.11
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.06
449 0.07
450 0.06
451 0.09
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.14
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.16
460 0.13
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.12
471 0.12
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.08
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.11
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.19
487 0.23
488 0.23
489 0.25
490 0.3
491 0.3
492 0.31
493 0.36
494 0.32
495 0.29
496 0.35
497 0.34
498 0.38
499 0.4
500 0.45
501 0.45
502 0.48
503 0.48
504 0.44
505 0.47
506 0.43
507 0.45
508 0.45
509 0.42
510 0.42
511 0.47
512 0.49
513 0.52
514 0.53
515 0.47
516 0.45
517 0.43
518 0.42
519 0.36
520 0.32
521 0.25
522 0.2
523 0.19
524 0.15
525 0.14
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.1
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.18
535 0.16
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.16
540 0.17
541 0.16
542 0.15
543 0.17
544 0.17
545 0.18
546 0.18
547 0.16
548 0.18
549 0.23
550 0.23
551 0.24
552 0.24
553 0.22
554 0.23
555 0.19
556 0.17
557 0.14
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.12
587 0.12
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.08
592 0.09
593 0.08
594 0.1
595 0.1
596 0.11
597 0.14
598 0.14
599 0.18
600 0.23
601 0.28
602 0.31
603 0.35
604 0.39
605 0.44
606 0.49
607 0.5
608 0.5
609 0.48
610 0.53
611 0.54
612 0.6
613 0.61
614 0.66
615 0.67
616 0.67
617 0.71
618 0.65
619 0.68
620 0.66
621 0.67
622 0.61
623 0.65
624 0.67
625 0.69
626 0.74
627 0.75
628 0.76
629 0.77
630 0.84
631 0.82
632 0.82
633 0.83
634 0.82
635 0.82
636 0.76
637 0.71
638 0.66
639 0.6
640 0.54
641 0.46
642 0.41
643 0.32
644 0.3
645 0.26
646 0.2
647 0.18
648 0.16
649 0.14
650 0.11
651 0.1
652 0.08
653 0.05
654 0.05
655 0.08
656 0.11
657 0.14
658 0.14
659 0.15
660 0.16
661 0.18
662 0.21
663 0.23
664 0.26
665 0.31
666 0.39
667 0.45
668 0.46
669 0.45
670 0.49
671 0.49
672 0.52
673 0.53
674 0.5
675 0.48
676 0.55
677 0.65
678 0.68
679 0.74
680 0.74
681 0.71
682 0.75
683 0.77
684 0.72
685 0.7
686 0.7
687 0.7
688 0.71
689 0.71
690 0.71
691 0.75
692 0.74
693 0.72
694 0.65
695 0.58
696 0.5
697 0.45
698 0.34
699 0.25
700 0.22
701 0.15
702 0.14
703 0.12
704 0.09
705 0.08