Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YU19

Protein Details
Accession A0A316YU19    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-60SDYPPPQQQQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
411-431VTPALKRKRGRPKGSLKARTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-428KRKRGRPKGSLKA
455-464AKRGRGRPRK
496-498KKG
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSSHTPYQYSGSFSQHHPQSSWNQQQQQPSTSYHSWTSSDYPPPQQQQQQQQQQQQQQQQSQAHNLAQAQYHSQQQQPPPVQEGAAASRNAFRQNYQTSNQLQGRSAQDVQVAGVLQGLHWQGDSSSSSSTGSRDTYSTLGGQQQQQQQQQQQNHSTSNTNASDSALWEGGGAGSGSSNHRQQQPSYPSGVYSNQFRHLTPSPLTSSSAPHVFESQTPAASSTSHNGARAYYPAQYNGNNTDRRAEQMVPAQEQQKQQPFHQSYYQQPHQHQQQAAQQGSASSRLPADVMMVGGPMLGTPRQSGHAQPSSASSPEGESGAASSGRTAYPHANANSGGATVSPGDLALYQSQLSSSAAAATATSPAKSNAISNVTRTAKGYASKPITATAAATTTTTTGGAALMGGSETAAVTPALKRKRGRPKGSLKARTDGQPPSSNASAAPTAPHLDTSGAPAKRGRGRPRKVVDSIPKFDLPKHLLTSTGAPPTATGATSAKKKGRPSKASQASVVANGANGQGSSRPYNESAIEAASIQAAISQGAFANPHFFGQAPQHPHQALGPGYQTPPPRIVEKIVVKEVKVPVEKIVYRDRPPVASPAALKGVDAETKAKLLAKFDQLRTFGNGLESEEMQEDFDGLLQEAVKLVEGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.43
3 0.44
4 0.39
5 0.41
6 0.45
7 0.52
8 0.59
9 0.58
10 0.61
11 0.63
12 0.72
13 0.72
14 0.68
15 0.61
16 0.54
17 0.53
18 0.48
19 0.47
20 0.41
21 0.38
22 0.35
23 0.35
24 0.37
25 0.35
26 0.4
27 0.41
28 0.45
29 0.5
30 0.54
31 0.58
32 0.62
33 0.64
34 0.67
35 0.73
36 0.76
37 0.76
38 0.79
39 0.8
40 0.81
41 0.82
42 0.79
43 0.77
44 0.71
45 0.71
46 0.68
47 0.64
48 0.62
49 0.57
50 0.5
51 0.45
52 0.41
53 0.36
54 0.31
55 0.28
56 0.26
57 0.24
58 0.29
59 0.29
60 0.32
61 0.36
62 0.39
63 0.48
64 0.48
65 0.49
66 0.48
67 0.45
68 0.41
69 0.36
70 0.34
71 0.29
72 0.28
73 0.25
74 0.21
75 0.24
76 0.26
77 0.29
78 0.27
79 0.24
80 0.28
81 0.34
82 0.39
83 0.38
84 0.43
85 0.41
86 0.49
87 0.51
88 0.45
89 0.39
90 0.39
91 0.4
92 0.38
93 0.36
94 0.29
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.19
99 0.16
100 0.1
101 0.11
102 0.09
103 0.07
104 0.1
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.1
111 0.12
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.19
128 0.21
129 0.24
130 0.29
131 0.35
132 0.4
133 0.44
134 0.48
135 0.51
136 0.55
137 0.58
138 0.58
139 0.58
140 0.55
141 0.52
142 0.49
143 0.44
144 0.38
145 0.39
146 0.33
147 0.27
148 0.23
149 0.22
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.08
164 0.11
165 0.15
166 0.18
167 0.24
168 0.27
169 0.29
170 0.38
171 0.42
172 0.42
173 0.43
174 0.39
175 0.34
176 0.34
177 0.36
178 0.27
179 0.26
180 0.26
181 0.28
182 0.29
183 0.28
184 0.32
185 0.31
186 0.34
187 0.3
188 0.31
189 0.27
190 0.28
191 0.3
192 0.24
193 0.24
194 0.23
195 0.24
196 0.21
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.21
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.17
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.12
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.19
223 0.2
224 0.25
225 0.29
226 0.28
227 0.28
228 0.29
229 0.27
230 0.28
231 0.29
232 0.23
233 0.19
234 0.23
235 0.26
236 0.25
237 0.27
238 0.26
239 0.28
240 0.29
241 0.33
242 0.34
243 0.33
244 0.32
245 0.4
246 0.4
247 0.39
248 0.42
249 0.4
250 0.4
251 0.47
252 0.52
253 0.47
254 0.46
255 0.49
256 0.51
257 0.53
258 0.46
259 0.42
260 0.41
261 0.43
262 0.41
263 0.35
264 0.28
265 0.23
266 0.23
267 0.2
268 0.15
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.16
292 0.19
293 0.19
294 0.19
295 0.21
296 0.2
297 0.19
298 0.18
299 0.12
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.07
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.1
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.14
322 0.13
323 0.1
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.15
357 0.15
358 0.16
359 0.23
360 0.23
361 0.24
362 0.24
363 0.23
364 0.2
365 0.22
366 0.23
367 0.23
368 0.25
369 0.25
370 0.25
371 0.24
372 0.23
373 0.2
374 0.19
375 0.12
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.06
400 0.13
401 0.17
402 0.23
403 0.26
404 0.36
405 0.47
406 0.57
407 0.63
408 0.67
409 0.73
410 0.78
411 0.86
412 0.86
413 0.78
414 0.73
415 0.67
416 0.62
417 0.56
418 0.49
419 0.43
420 0.4
421 0.38
422 0.38
423 0.36
424 0.31
425 0.26
426 0.25
427 0.21
428 0.15
429 0.14
430 0.1
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.15
438 0.21
439 0.2
440 0.21
441 0.22
442 0.27
443 0.34
444 0.42
445 0.48
446 0.51
447 0.57
448 0.66
449 0.72
450 0.73
451 0.69
452 0.7
453 0.7
454 0.68
455 0.65
456 0.59
457 0.56
458 0.49
459 0.47
460 0.45
461 0.39
462 0.34
463 0.33
464 0.3
465 0.27
466 0.28
467 0.31
468 0.27
469 0.26
470 0.22
471 0.18
472 0.18
473 0.2
474 0.19
475 0.14
476 0.12
477 0.12
478 0.16
479 0.21
480 0.27
481 0.3
482 0.34
483 0.43
484 0.51
485 0.6
486 0.64
487 0.67
488 0.73
489 0.77
490 0.75
491 0.68
492 0.62
493 0.53
494 0.46
495 0.39
496 0.27
497 0.17
498 0.14
499 0.13
500 0.09
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.11
505 0.14
506 0.14
507 0.17
508 0.19
509 0.21
510 0.21
511 0.21
512 0.19
513 0.17
514 0.16
515 0.13
516 0.11
517 0.09
518 0.08
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.1
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.19
536 0.26
537 0.3
538 0.33
539 0.39
540 0.38
541 0.39
542 0.37
543 0.36
544 0.3
545 0.25
546 0.24
547 0.21
548 0.22
549 0.26
550 0.28
551 0.26
552 0.28
553 0.28
554 0.29
555 0.29
556 0.31
557 0.36
558 0.4
559 0.44
560 0.48
561 0.48
562 0.45
563 0.49
564 0.49
565 0.47
566 0.43
567 0.37
568 0.33
569 0.39
570 0.4
571 0.38
572 0.45
573 0.45
574 0.46
575 0.52
576 0.51
577 0.47
578 0.47
579 0.48
580 0.41
581 0.38
582 0.35
583 0.33
584 0.35
585 0.31
586 0.29
587 0.25
588 0.24
589 0.22
590 0.22
591 0.2
592 0.17
593 0.18
594 0.19
595 0.22
596 0.21
597 0.23
598 0.27
599 0.35
600 0.41
601 0.46
602 0.51
603 0.49
604 0.5
605 0.52
606 0.47
607 0.38
608 0.33
609 0.29
610 0.24
611 0.25
612 0.23
613 0.19
614 0.19
615 0.18
616 0.16
617 0.15
618 0.13
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.09
623 0.1
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.1