Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YQ68

Protein Details
Accession A0A316YQ68    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-82DRAQLEKERLERQRKRRREAGLSEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-75RQRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
Amino Acid Sequences MDGRGGKGKPIVLDDDDDDDGVVVGNATGGKVEEVVVAKAGDGSGGTSTSTLSALMGDRAQLEKERLERQRKRRREAGLSEGDDDEMASDSTKAKKAKYPTTPQVVATTQPSTSFPSSFTAPLSGKPGDFQLYWDGGVEKSYNRYCSQEPGRRFASFLLPTTPFNAAGLTHVIMTTYCEDLQWLATLFPKGPRGTAPEITMITHSPQGSGSSLVGVHSPLHPDLPNWVRLVIPRIKDGPSDYETQHMKFMFLFYPDRLRILILSGNLVDYDWDRIENTAFIHDFRRRESPTTEEEGLGVDLRKVLDSLKVPAGHHAQRMLNSYDFSQTKTEARLVISRPLAKATQGWNNIEEWGLGRLGKVVRETLDSAEKRKQSRSRGGVRLEAQGSSMGTYSARWLQQVHILASGVDPRKGALPLPAGKKADTTWAKAVGGNASDKWPPIKLLFPSERWVKDTAVEGAPGAGTFFGKKAQSVSRGFVDLAHQPVSKRGDIMMHHKSLLALLPDILREDGGSDHIDDEEIVGWIYMGSHNLTQAAWGNISSASASAPPQLTCQNWELGLVLPFRRRDLKADAKSDAAKIVTWKRPVEKYQDGDVPWDQFQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.28
4 0.25
5 0.22
6 0.17
7 0.14
8 0.11
9 0.09
10 0.05
11 0.04
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.09
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.08
29 0.06
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.18
50 0.21
51 0.26
52 0.34
53 0.42
54 0.52
55 0.6
56 0.68
57 0.77
58 0.82
59 0.85
60 0.85
61 0.84
62 0.83
63 0.8
64 0.79
65 0.77
66 0.7
67 0.64
68 0.56
69 0.47
70 0.37
71 0.29
72 0.2
73 0.12
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.1
78 0.14
79 0.2
80 0.22
81 0.24
82 0.31
83 0.39
84 0.48
85 0.55
86 0.61
87 0.64
88 0.7
89 0.69
90 0.64
91 0.61
92 0.52
93 0.44
94 0.38
95 0.31
96 0.22
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.21
102 0.19
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.21
108 0.19
109 0.2
110 0.24
111 0.22
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.13
124 0.15
125 0.14
126 0.1
127 0.16
128 0.19
129 0.21
130 0.22
131 0.26
132 0.26
133 0.34
134 0.43
135 0.45
136 0.46
137 0.49
138 0.51
139 0.48
140 0.47
141 0.4
142 0.38
143 0.32
144 0.3
145 0.28
146 0.26
147 0.26
148 0.28
149 0.28
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.19
180 0.23
181 0.27
182 0.28
183 0.27
184 0.25
185 0.25
186 0.25
187 0.24
188 0.19
189 0.15
190 0.16
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.09
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.16
211 0.18
212 0.2
213 0.18
214 0.19
215 0.17
216 0.18
217 0.24
218 0.22
219 0.21
220 0.21
221 0.23
222 0.24
223 0.24
224 0.25
225 0.24
226 0.22
227 0.23
228 0.21
229 0.24
230 0.25
231 0.25
232 0.26
233 0.21
234 0.19
235 0.16
236 0.17
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.13
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.13
269 0.16
270 0.17
271 0.19
272 0.25
273 0.24
274 0.27
275 0.28
276 0.29
277 0.29
278 0.33
279 0.32
280 0.26
281 0.24
282 0.21
283 0.19
284 0.15
285 0.11
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.19
299 0.23
300 0.22
301 0.22
302 0.23
303 0.21
304 0.21
305 0.24
306 0.23
307 0.19
308 0.17
309 0.17
310 0.19
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.15
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.14
319 0.15
320 0.18
321 0.18
322 0.22
323 0.23
324 0.23
325 0.22
326 0.23
327 0.22
328 0.18
329 0.2
330 0.18
331 0.23
332 0.24
333 0.25
334 0.24
335 0.24
336 0.24
337 0.21
338 0.17
339 0.11
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.13
353 0.21
354 0.21
355 0.24
356 0.29
357 0.33
358 0.33
359 0.41
360 0.45
361 0.45
362 0.54
363 0.59
364 0.62
365 0.65
366 0.65
367 0.63
368 0.59
369 0.55
370 0.46
371 0.37
372 0.29
373 0.22
374 0.19
375 0.14
376 0.11
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.18
387 0.21
388 0.19
389 0.17
390 0.16
391 0.15
392 0.15
393 0.2
394 0.16
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.13
402 0.18
403 0.23
404 0.28
405 0.33
406 0.32
407 0.32
408 0.32
409 0.29
410 0.33
411 0.3
412 0.3
413 0.27
414 0.29
415 0.29
416 0.29
417 0.3
418 0.22
419 0.21
420 0.18
421 0.16
422 0.16
423 0.16
424 0.16
425 0.16
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.19
430 0.19
431 0.27
432 0.31
433 0.32
434 0.37
435 0.41
436 0.41
437 0.39
438 0.39
439 0.31
440 0.28
441 0.29
442 0.27
443 0.21
444 0.2
445 0.17
446 0.15
447 0.14
448 0.12
449 0.09
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.15
458 0.2
459 0.26
460 0.29
461 0.32
462 0.3
463 0.32
464 0.31
465 0.28
466 0.26
467 0.22
468 0.22
469 0.22
470 0.21
471 0.19
472 0.26
473 0.29
474 0.27
475 0.24
476 0.22
477 0.24
478 0.26
479 0.34
480 0.35
481 0.33
482 0.32
483 0.32
484 0.31
485 0.27
486 0.26
487 0.2
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.14
493 0.13
494 0.1
495 0.08
496 0.09
497 0.08
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.08
516 0.09
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.11
521 0.14
522 0.15
523 0.13
524 0.13
525 0.13
526 0.12
527 0.13
528 0.12
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.12
534 0.14
535 0.14
536 0.17
537 0.21
538 0.22
539 0.25
540 0.27
541 0.25
542 0.24
543 0.24
544 0.22
545 0.2
546 0.22
547 0.21
548 0.22
549 0.25
550 0.27
551 0.3
552 0.36
553 0.35
554 0.37
555 0.44
556 0.51
557 0.54
558 0.59
559 0.57
560 0.55
561 0.56
562 0.52
563 0.45
564 0.35
565 0.28
566 0.29
567 0.36
568 0.39
569 0.42
570 0.47
571 0.51
572 0.58
573 0.62
574 0.64
575 0.64
576 0.62
577 0.63
578 0.63
579 0.57
580 0.55
581 0.52
582 0.47