Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YLV0

Protein Details
Accession A0A316YLV0    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-39RSPSPPVASFVKKKKNKGRASAGAKIRERHydrophilic
347-366TTGARQKREHREKSPFKPAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-39KKKKNKGRASAGAKIRER
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MLDGDEDEDRRSPSPPVASFVKKKKNKGRASAGAKIRERASSPSEAVPGQSKQGADDEDDRSQGGDGQVNGIRRTAGIGSPSFRAIGSRGRGGASARPSLSSSSSSSRVGLSFGGGPEGEKGGDEGEAFQLRKSALARASQEARRTSAAGPPESLDQASIGSGAGSAYSPAALADLKAATPGRKGVAMDTDESPGGDDAYTAVSDPMVQVDESGESLARMKFGADFAEEGIPSEALVNAAKEKRRRAAQGKSDENTNGQEDFISLGGSSRGPHPESRLQREDDEWGSGEEEFADFTGATERVALSKRAIEEEKQKRRQEMRERVDELDEEDNSEDEWERAQMSRIDTTGARQKREHREKSPFKPAPIPLTAPLPTLTSTSARLAAQVKELETSAMSHEKVADDAVRGLEQLQHEEAENKVDIEQAGDKEAWFREFEEFILSVAAFLDDKAPRLEALEADWMGLLQERTRMTQRIRARDAEDELSLFFGVPSRSLLPGNSKLSEEEQSDNASEISRLPQEEGDASSPIRISRREKAAARGEKGYDLEASDFAAFAIARQDLERRLKQLFDDVKAAEFLDPAAEITRESDGRKALHPASLAARFMHWRKRYPDDYAGAWGGLALSGVWEFWARKQCCLWDIFRAFSNGQRGAEEEATLGPSSLDRFPWFIELTHYAEANYEGKPAGAIGGDEEVVQSIINNVVIPRALSLVEAGAFDPWDPRDNRGALELVEQLSYLIEKSSAPFQSLVSAFVARFKAHVDCLLQVTASSAPAIPAPGFHPLAPPARVSFCQRIAHLYGNLTRWNRLVGPAERPAFVDLVDQLVGRVLWSFVLETKEVGGVPIIMQILTSTPPNLLRPDVKTRLEGFVTNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.34
4 0.39
5 0.47
6 0.54
7 0.62
8 0.67
9 0.67
10 0.75
11 0.81
12 0.84
13 0.86
14 0.86
15 0.87
16 0.86
17 0.87
18 0.85
19 0.83
20 0.82
21 0.75
22 0.69
23 0.61
24 0.55
25 0.49
26 0.45
27 0.43
28 0.39
29 0.39
30 0.37
31 0.38
32 0.34
33 0.34
34 0.33
35 0.29
36 0.26
37 0.27
38 0.24
39 0.22
40 0.26
41 0.25
42 0.24
43 0.28
44 0.29
45 0.28
46 0.29
47 0.27
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.19
55 0.22
56 0.24
57 0.25
58 0.23
59 0.21
60 0.17
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.19
66 0.21
67 0.23
68 0.23
69 0.21
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.22
74 0.24
75 0.26
76 0.26
77 0.27
78 0.28
79 0.29
80 0.33
81 0.3
82 0.31
83 0.28
84 0.28
85 0.28
86 0.29
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.25
91 0.27
92 0.27
93 0.27
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.18
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.11
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.17
118 0.16
119 0.19
120 0.19
121 0.21
122 0.2
123 0.26
124 0.29
125 0.33
126 0.4
127 0.41
128 0.46
129 0.43
130 0.42
131 0.38
132 0.37
133 0.33
134 0.3
135 0.32
136 0.28
137 0.26
138 0.25
139 0.25
140 0.24
141 0.22
142 0.18
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.15
169 0.14
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.2
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.2
179 0.2
180 0.18
181 0.12
182 0.11
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.11
226 0.15
227 0.2
228 0.25
229 0.29
230 0.35
231 0.41
232 0.49
233 0.52
234 0.59
235 0.63
236 0.68
237 0.71
238 0.66
239 0.63
240 0.55
241 0.49
242 0.41
243 0.34
244 0.24
245 0.16
246 0.15
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.12
258 0.14
259 0.15
260 0.21
261 0.29
262 0.36
263 0.43
264 0.46
265 0.45
266 0.45
267 0.45
268 0.43
269 0.36
270 0.3
271 0.22
272 0.18
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.1
292 0.13
293 0.14
294 0.17
295 0.19
296 0.2
297 0.29
298 0.38
299 0.48
300 0.55
301 0.57
302 0.6
303 0.66
304 0.72
305 0.73
306 0.73
307 0.7
308 0.69
309 0.7
310 0.63
311 0.58
312 0.48
313 0.4
314 0.32
315 0.24
316 0.16
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.14
331 0.13
332 0.15
333 0.14
334 0.16
335 0.23
336 0.24
337 0.25
338 0.27
339 0.36
340 0.46
341 0.56
342 0.61
343 0.6
344 0.68
345 0.74
346 0.78
347 0.81
348 0.73
349 0.65
350 0.63
351 0.58
352 0.52
353 0.45
354 0.4
355 0.29
356 0.3
357 0.28
358 0.22
359 0.2
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.13
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.14
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.09
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.08
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.04
432 0.04
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.06
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.04
452 0.07
453 0.08
454 0.1
455 0.13
456 0.17
457 0.17
458 0.25
459 0.31
460 0.36
461 0.39
462 0.4
463 0.4
464 0.39
465 0.4
466 0.34
467 0.28
468 0.2
469 0.17
470 0.14
471 0.12
472 0.09
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.14
483 0.2
484 0.22
485 0.22
486 0.21
487 0.21
488 0.23
489 0.25
490 0.21
491 0.17
492 0.16
493 0.16
494 0.16
495 0.15
496 0.13
497 0.11
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.15
516 0.18
517 0.24
518 0.3
519 0.36
520 0.37
521 0.44
522 0.52
523 0.54
524 0.52
525 0.48
526 0.43
527 0.38
528 0.37
529 0.3
530 0.2
531 0.15
532 0.13
533 0.1
534 0.1
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.09
546 0.14
547 0.21
548 0.23
549 0.24
550 0.25
551 0.26
552 0.26
553 0.33
554 0.31
555 0.27
556 0.28
557 0.25
558 0.25
559 0.24
560 0.24
561 0.15
562 0.11
563 0.09
564 0.06
565 0.06
566 0.05
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.13
575 0.15
576 0.17
577 0.18
578 0.22
579 0.21
580 0.22
581 0.22
582 0.21
583 0.23
584 0.23
585 0.23
586 0.18
587 0.18
588 0.2
589 0.23
590 0.31
591 0.31
592 0.35
593 0.4
594 0.47
595 0.5
596 0.52
597 0.55
598 0.49
599 0.46
600 0.43
601 0.38
602 0.3
603 0.26
604 0.19
605 0.12
606 0.09
607 0.07
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.05
614 0.06
615 0.1
616 0.21
617 0.21
618 0.24
619 0.26
620 0.28
621 0.3
622 0.33
623 0.31
624 0.31
625 0.32
626 0.31
627 0.31
628 0.32
629 0.29
630 0.3
631 0.34
632 0.27
633 0.25
634 0.24
635 0.24
636 0.24
637 0.24
638 0.2
639 0.14
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.11
644 0.07
645 0.07
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.11
650 0.12
651 0.13
652 0.16
653 0.17
654 0.15
655 0.18
656 0.2
657 0.23
658 0.23
659 0.22
660 0.19
661 0.18
662 0.2
663 0.17
664 0.14
665 0.11
666 0.1
667 0.1
668 0.1
669 0.09
670 0.07
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.06
675 0.07
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.09
703 0.1
704 0.16
705 0.17
706 0.2
707 0.26
708 0.27
709 0.28
710 0.28
711 0.28
712 0.22
713 0.23
714 0.22
715 0.17
716 0.15
717 0.14
718 0.12
719 0.11
720 0.1
721 0.08
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.08
726 0.15
727 0.15
728 0.17
729 0.17
730 0.17
731 0.23
732 0.23
733 0.23
734 0.18
735 0.19
736 0.17
737 0.21
738 0.23
739 0.17
740 0.17
741 0.17
742 0.18
743 0.18
744 0.22
745 0.19
746 0.2
747 0.22
748 0.22
749 0.2
750 0.17
751 0.17
752 0.14
753 0.13
754 0.11
755 0.08
756 0.08
757 0.09
758 0.11
759 0.09
760 0.09
761 0.11
762 0.16
763 0.17
764 0.17
765 0.19
766 0.22
767 0.27
768 0.27
769 0.27
770 0.24
771 0.27
772 0.3
773 0.34
774 0.37
775 0.39
776 0.42
777 0.41
778 0.43
779 0.43
780 0.45
781 0.41
782 0.38
783 0.36
784 0.35
785 0.42
786 0.38
787 0.36
788 0.32
789 0.33
790 0.3
791 0.3
792 0.34
793 0.31
794 0.36
795 0.42
796 0.43
797 0.4
798 0.41
799 0.38
800 0.3
801 0.26
802 0.22
803 0.14
804 0.14
805 0.14
806 0.13
807 0.11
808 0.12
809 0.11
810 0.09
811 0.09
812 0.07
813 0.07
814 0.08
815 0.09
816 0.11
817 0.14
818 0.15
819 0.14
820 0.15
821 0.16
822 0.15
823 0.15
824 0.12
825 0.09
826 0.09
827 0.11
828 0.11
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.11
834 0.12
835 0.1
836 0.12
837 0.15
838 0.19
839 0.22
840 0.26
841 0.3
842 0.35
843 0.44
844 0.5
845 0.49
846 0.52
847 0.52
848 0.53
849 0.49