Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YIZ3

Protein Details
Accession A0A316YIZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
853-874EEEEREAPRRNRRRAACEVARAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
882-892RLRRGIKGRER
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014801  Mediator_Med5_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08689  Med5  
Amino Acid Sequences MADVTSFLDETEDVDALWTLIEVASGAIRHAVEHHLAPVSRLFTGVLSHVAISHQRLTKVSAQKSEAKEAASLALNTSIEAASKANAQEESLILRSIQTALRLSSQPQQETTAIEDPLQGSFQEKKKVAGGRSAMADALRLASASRPSWTSCCSLETIISGKIGGISGTSIPVDPEISNLLHLCVDQLTEMHIKVEAAKMLLGRRIKSKSADTTDDECRSTFYFEILYGATIACATIASTPPTLGGSEAYASVWRSALCGLVPEIIAALEANLEESTSTSARLSRALHALLVGASQVIEGCEVAIAQSEETKKRTGGDEDMEMMLDAFIGSDTPPRQAVRAALLRSLVELKLIEDGAWKSIPGAESVNEDWQLLSLSFQGEVYGTDQSLETLIEQRLSGGDDVQDLFDRIVSDYAAQEVFATTLLRLLEDWTDLEPLSRICRALTASPTALEVLLLYISPSQLLHPFATVLIRDDLAESGDEPSVLASILLFTQAIVQRGLLAGYQVEDLLGTEDHFLSTFTRSSSAVWSLSSLDASEQNLISRWVTALYDSDGISDELIRDSSPQFLLRMAPTLLSQSVHACISGVIDMDTLRGGLSYFLQDLLSFTLPGALRWLVSDIELITSSSLEGPFTPSKALSVRFDVLTTFILAESCPSTVLRLVSSDLQALLSRLALKNKASTDLSSSDNTQARLQQQWMTPELSSLKAKVESEVKTLPLQRTSLWIRAGPHQQGSHHQDLQQHHQQQQQQQRHPQSSSTPQSLLQPPPPPFDSMFGLYQGLLHATRVRGVASVVKRLVKAVDAQHPQGAPMPRPPPPPAAATMAIEKAAAGQGVDSERSMAMQGDTQAQNGGEEEEEREAPRRNRRRAACEVARAVEKLLALRLRRGIKGRERARALLATFLGAKEEGEEKGPVELVFAKALEQGRRVAVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.09
5 0.07
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.04
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.19
22 0.21
23 0.21
24 0.22
25 0.24
26 0.23
27 0.2
28 0.2
29 0.18
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.14
38 0.16
39 0.18
40 0.23
41 0.25
42 0.26
43 0.28
44 0.32
45 0.39
46 0.45
47 0.48
48 0.48
49 0.49
50 0.56
51 0.59
52 0.62
53 0.55
54 0.47
55 0.41
56 0.35
57 0.34
58 0.28
59 0.24
60 0.17
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.13
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.2
89 0.21
90 0.24
91 0.29
92 0.33
93 0.33
94 0.32
95 0.35
96 0.32
97 0.32
98 0.34
99 0.31
100 0.26
101 0.24
102 0.23
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.13
107 0.12
108 0.19
109 0.24
110 0.31
111 0.31
112 0.33
113 0.39
114 0.45
115 0.44
116 0.45
117 0.43
118 0.38
119 0.39
120 0.38
121 0.32
122 0.25
123 0.23
124 0.15
125 0.13
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.13
131 0.13
132 0.15
133 0.16
134 0.18
135 0.21
136 0.24
137 0.25
138 0.22
139 0.24
140 0.24
141 0.23
142 0.21
143 0.2
144 0.2
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.1
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.2
189 0.22
190 0.21
191 0.27
192 0.31
193 0.33
194 0.36
195 0.4
196 0.43
197 0.46
198 0.49
199 0.47
200 0.48
201 0.51
202 0.5
203 0.44
204 0.36
205 0.32
206 0.28
207 0.26
208 0.21
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.14
213 0.12
214 0.11
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.11
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.12
278 0.11
279 0.08
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.08
295 0.11
296 0.14
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.21
302 0.21
303 0.22
304 0.22
305 0.22
306 0.22
307 0.22
308 0.2
309 0.17
310 0.13
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.17
327 0.22
328 0.21
329 0.2
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.2
334 0.14
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.09
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.1
438 0.08
439 0.06
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.06
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.02
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.06
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.08
508 0.07
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.12
556 0.11
557 0.13
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.07
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.13
599 0.11
600 0.1
601 0.11
602 0.12
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.07
607 0.07
608 0.08
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.11
618 0.12
619 0.12
620 0.13
621 0.12
622 0.14
623 0.16
624 0.19
625 0.16
626 0.19
627 0.21
628 0.2
629 0.2
630 0.18
631 0.17
632 0.15
633 0.13
634 0.09
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.07
644 0.09
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.12
649 0.13
650 0.13
651 0.13
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.1
656 0.09
657 0.08
658 0.1
659 0.11
660 0.14
661 0.16
662 0.17
663 0.21
664 0.22
665 0.26
666 0.24
667 0.23
668 0.25
669 0.24
670 0.26
671 0.23
672 0.24
673 0.26
674 0.27
675 0.27
676 0.25
677 0.26
678 0.26
679 0.28
680 0.28
681 0.27
682 0.27
683 0.29
684 0.3
685 0.28
686 0.25
687 0.24
688 0.24
689 0.22
690 0.2
691 0.18
692 0.18
693 0.19
694 0.19
695 0.2
696 0.24
697 0.23
698 0.26
699 0.27
700 0.27
701 0.28
702 0.32
703 0.32
704 0.29
705 0.28
706 0.24
707 0.29
708 0.32
709 0.32
710 0.3
711 0.3
712 0.29
713 0.35
714 0.41
715 0.38
716 0.38
717 0.36
718 0.35
719 0.42
720 0.47
721 0.47
722 0.42
723 0.42
724 0.43
725 0.45
726 0.52
727 0.52
728 0.49
729 0.47
730 0.5
731 0.53
732 0.55
733 0.61
734 0.63
735 0.62
736 0.67
737 0.71
738 0.71
739 0.67
740 0.62
741 0.58
742 0.58
743 0.56
744 0.51
745 0.43
746 0.39
747 0.44
748 0.47
749 0.45
750 0.41
751 0.42
752 0.4
753 0.44
754 0.44
755 0.41
756 0.36
757 0.35
758 0.33
759 0.28
760 0.27
761 0.23
762 0.22
763 0.19
764 0.18
765 0.15
766 0.13
767 0.1
768 0.1
769 0.12
770 0.12
771 0.14
772 0.14
773 0.14
774 0.13
775 0.14
776 0.21
777 0.21
778 0.27
779 0.28
780 0.31
781 0.3
782 0.31
783 0.31
784 0.25
785 0.27
786 0.26
787 0.32
788 0.33
789 0.35
790 0.38
791 0.37
792 0.36
793 0.36
794 0.35
795 0.28
796 0.31
797 0.34
798 0.36
799 0.41
800 0.44
801 0.43
802 0.42
803 0.43
804 0.38
805 0.39
806 0.35
807 0.32
808 0.32
809 0.27
810 0.24
811 0.21
812 0.17
813 0.13
814 0.12
815 0.1
816 0.07
817 0.06
818 0.08
819 0.1
820 0.11
821 0.1
822 0.11
823 0.1
824 0.11
825 0.12
826 0.1
827 0.09
828 0.11
829 0.12
830 0.18
831 0.19
832 0.19
833 0.2
834 0.19
835 0.18
836 0.17
837 0.16
838 0.1
839 0.1
840 0.12
841 0.13
842 0.15
843 0.16
844 0.19
845 0.26
846 0.33
847 0.44
848 0.52
849 0.59
850 0.67
851 0.75
852 0.79
853 0.8
854 0.83
855 0.81
856 0.79
857 0.74
858 0.69
859 0.63
860 0.55
861 0.46
862 0.38
863 0.3
864 0.23
865 0.24
866 0.25
867 0.24
868 0.28
869 0.34
870 0.37
871 0.41
872 0.47
873 0.51
874 0.55
875 0.64
876 0.68
877 0.7
878 0.71
879 0.68
880 0.67
881 0.63
882 0.53
883 0.48
884 0.41
885 0.33
886 0.28
887 0.25
888 0.22
889 0.16
890 0.15
891 0.12
892 0.14
893 0.13
894 0.15
895 0.16
896 0.14
897 0.16
898 0.17
899 0.15
900 0.15
901 0.16
902 0.15
903 0.16
904 0.16
905 0.15
906 0.18
907 0.23
908 0.24
909 0.24
910 0.25