Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YWD4

Protein Details
Accession A0A316YWD4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-75ADSPGLSKKAEKRKAKKAKKRAAAEAALNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-68SKKAEKRKAKKAKKRA
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 12, mito 5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18024  DEXHc_Mtr4-like  
cd13154  KOW_Mtr4  
cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDPDGLFDFLEPQQPTGAAAVPATGIGKASRSGTSTPAEGDVGSPSADSPGLSKKAEKRKAKKAKKRAAAEAALNGDEDSANGKENTPEQAEAGSSALVKKSESSNGVANGEDEGGATKPAKKRSRLEEVAAATASTTVTDEFTAEAVREVPVAEGAQEAEAKRAAAVQAEVSGTVAGTSTTTTNGTDPSSSKQGGAMQISHSVRHQVALPPGYPYVPLSSHVPPEKPARTWPFALDPFQRTAISSIERNESVLVSAHTSAGKTVVAEYAIAQCLRDGQRVVYTSPIKALSNQKYREMAADFGDVGLMTGDVTINPSASCLVMTTEILRSMLYRGSEIMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIILLPRKVRYVFLSATIPNAMQFAQWIAHTHSQPCHVVYTDFRPTPLQHYLFPTGGDGIHLVVDERGIFREDNFQKAMGALAEGRGEDPAAADSGRNKKGQTKKGGQKGPSDIYKIIKMIMLKNYNPVIVFAFSKKECEGLALQMSKLEFNTDDEKDMVSTVFNNAIGALSEEDRQLPQIEHILPLLRRGIGIHHGGLLPILKEVIEILFQEGLIKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTAVRKWDGKEFRNLSSGEFIQMSGRAGRRGLDDRGIVIMMFDEKLDPPAAKQMVKGEADRLNSAFHLGYNMVLNLMRVEGISPEYMLERCFYQFQSAASVPQLEGELEEATRLRDEAVVPDEENTNEYFGIRKQLDELNKDLREIISHPSYALPFLQPGRLVRIKHEDLDFGWGCVVSYQKRLPPRNKPAPSEVDQSQYIVDCLLECAKGSIVPSSKEVARGPPGAGAPAGLQPKAPGQEGEMVVVPVLLSTLDSIAGIRLILPKDLRTSEAREQVKGRLKEVFRRFPAKDGRGESSSSSSSSGKGIPLLDPIKDMKITDEGFKTLLGKIVLLEQKLAESPLSGSKRLKELYEAYKAKEDLNQEVERLKKQLSAAHSVMQLDELKCRKRVLRRLGFTTADDVVEKKGRVACEISTGDELLLTEMIFNGVFNDLSPEQCAALLSCFVFGEKSAQQIRLKEDLAAPLRVMQETARRIAKVSIESRMQINEDEYVAGFKVELMDAVMQWCKGAKFADICKLTDVFEGSVIRTFRRLQELIRQMTQAAKAIGNEELEDKFTKSMEKLERQGSIIFSPSLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.18
4 0.19
5 0.13
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.1
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.11
16 0.14
17 0.15
18 0.18
19 0.19
20 0.23
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.23
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.11
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.17
38 0.22
39 0.23
40 0.3
41 0.38
42 0.49
43 0.59
44 0.67
45 0.68
46 0.75
47 0.85
48 0.9
49 0.92
50 0.92
51 0.93
52 0.92
53 0.91
54 0.89
55 0.87
56 0.82
57 0.74
58 0.69
59 0.61
60 0.51
61 0.43
62 0.33
63 0.24
64 0.18
65 0.14
66 0.12
67 0.1
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.15
72 0.17
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.17
81 0.13
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.16
89 0.21
90 0.23
91 0.25
92 0.28
93 0.31
94 0.31
95 0.29
96 0.26
97 0.21
98 0.19
99 0.16
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.16
106 0.21
107 0.31
108 0.39
109 0.46
110 0.53
111 0.6
112 0.7
113 0.69
114 0.69
115 0.66
116 0.61
117 0.57
118 0.48
119 0.39
120 0.29
121 0.24
122 0.18
123 0.11
124 0.09
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.19
177 0.24
178 0.24
179 0.23
180 0.24
181 0.26
182 0.28
183 0.29
184 0.25
185 0.21
186 0.28
187 0.29
188 0.28
189 0.25
190 0.24
191 0.22
192 0.21
193 0.23
194 0.2
195 0.25
196 0.27
197 0.27
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.23
202 0.2
203 0.17
204 0.14
205 0.16
206 0.18
207 0.2
208 0.26
209 0.29
210 0.29
211 0.3
212 0.37
213 0.4
214 0.37
215 0.43
216 0.44
217 0.45
218 0.46
219 0.46
220 0.45
221 0.44
222 0.47
223 0.44
224 0.39
225 0.37
226 0.38
227 0.34
228 0.28
229 0.26
230 0.24
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.23
235 0.23
236 0.23
237 0.22
238 0.19
239 0.16
240 0.15
241 0.13
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.15
262 0.17
263 0.19
264 0.17
265 0.17
266 0.22
267 0.24
268 0.24
269 0.26
270 0.26
271 0.24
272 0.26
273 0.26
274 0.22
275 0.26
276 0.34
277 0.36
278 0.44
279 0.46
280 0.47
281 0.47
282 0.48
283 0.46
284 0.38
285 0.31
286 0.23
287 0.22
288 0.18
289 0.15
290 0.15
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.05
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.12
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.23
363 0.22
364 0.23
365 0.25
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.18
370 0.13
371 0.13
372 0.1
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.09
379 0.12
380 0.17
381 0.18
382 0.2
383 0.21
384 0.24
385 0.25
386 0.24
387 0.21
388 0.17
389 0.17
390 0.17
391 0.22
392 0.25
393 0.24
394 0.24
395 0.25
396 0.25
397 0.29
398 0.34
399 0.29
400 0.25
401 0.29
402 0.32
403 0.3
404 0.29
405 0.24
406 0.18
407 0.16
408 0.14
409 0.09
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.18
423 0.19
424 0.22
425 0.22
426 0.21
427 0.2
428 0.2
429 0.2
430 0.1
431 0.09
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.1
446 0.17
447 0.21
448 0.22
449 0.22
450 0.3
451 0.39
452 0.47
453 0.51
454 0.54
455 0.59
456 0.67
457 0.73
458 0.68
459 0.64
460 0.62
461 0.57
462 0.5
463 0.44
464 0.37
465 0.32
466 0.31
467 0.25
468 0.2
469 0.17
470 0.16
471 0.17
472 0.22
473 0.23
474 0.22
475 0.26
476 0.26
477 0.25
478 0.24
479 0.21
480 0.15
481 0.13
482 0.13
483 0.1
484 0.14
485 0.13
486 0.15
487 0.14
488 0.14
489 0.12
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.15
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.15
498 0.13
499 0.12
500 0.11
501 0.07
502 0.09
503 0.14
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.13
510 0.1
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.13
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.04
568 0.03
569 0.03
570 0.04
571 0.03
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.11
591 0.15
592 0.17
593 0.18
594 0.19
595 0.23
596 0.28
597 0.29
598 0.36
599 0.35
600 0.34
601 0.38
602 0.37
603 0.31
604 0.28
605 0.26
606 0.18
607 0.15
608 0.13
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.11
617 0.13
618 0.16
619 0.17
620 0.17
621 0.16
622 0.16
623 0.16
624 0.15
625 0.12
626 0.08
627 0.07
628 0.05
629 0.05
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.11
638 0.13
639 0.13
640 0.14
641 0.16
642 0.2
643 0.21
644 0.21
645 0.2
646 0.21
647 0.22
648 0.22
649 0.2
650 0.16
651 0.15
652 0.16
653 0.11
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.1
680 0.1
681 0.11
682 0.12
683 0.12
684 0.16
685 0.16
686 0.16
687 0.15
688 0.15
689 0.12
690 0.11
691 0.11
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.05
703 0.06
704 0.06
705 0.08
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.12
710 0.13
711 0.12
712 0.13
713 0.1
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.15
723 0.2
724 0.24
725 0.26
726 0.29
727 0.3
728 0.3
729 0.3
730 0.29
731 0.24
732 0.21
733 0.2
734 0.2
735 0.15
736 0.15
737 0.15
738 0.15
739 0.15
740 0.15
741 0.14
742 0.1
743 0.1
744 0.11
745 0.12
746 0.12
747 0.13
748 0.19
749 0.22
750 0.22
751 0.24
752 0.32
753 0.32
754 0.33
755 0.33
756 0.28
757 0.24
758 0.31
759 0.27
760 0.19
761 0.17
762 0.14
763 0.13
764 0.13
765 0.15
766 0.09
767 0.13
768 0.16
769 0.2
770 0.29
771 0.38
772 0.45
773 0.53
774 0.63
775 0.69
776 0.72
777 0.73
778 0.7
779 0.69
780 0.65
781 0.59
782 0.5
783 0.43
784 0.38
785 0.34
786 0.27
787 0.21
788 0.16
789 0.11
790 0.09
791 0.05
792 0.06
793 0.07
794 0.06
795 0.06
796 0.07
797 0.07
798 0.08
799 0.08
800 0.11
801 0.13
802 0.14
803 0.16
804 0.18
805 0.19
806 0.21
807 0.21
808 0.21
809 0.23
810 0.23
811 0.22
812 0.22
813 0.21
814 0.19
815 0.17
816 0.14
817 0.11
818 0.14
819 0.15
820 0.12
821 0.12
822 0.12
823 0.15
824 0.16
825 0.16
826 0.12
827 0.12
828 0.18
829 0.18
830 0.19
831 0.16
832 0.14
833 0.13
834 0.13
835 0.11
836 0.05
837 0.05
838 0.03
839 0.03
840 0.03
841 0.03
842 0.04
843 0.04
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.04
848 0.05
849 0.08
850 0.09
851 0.11
852 0.12
853 0.14
854 0.17
855 0.18
856 0.2
857 0.2
858 0.26
859 0.31
860 0.39
861 0.39
862 0.39
863 0.4
864 0.45
865 0.51
866 0.46
867 0.41
868 0.4
869 0.41
870 0.48
871 0.55
872 0.56
873 0.52
874 0.58
875 0.57
876 0.57
877 0.65
878 0.59
879 0.57
880 0.52
881 0.52
882 0.46
883 0.46
884 0.4
885 0.34
886 0.31
887 0.25
888 0.23
889 0.19
890 0.18
891 0.18
892 0.18
893 0.14
894 0.15
895 0.15
896 0.13
897 0.19
898 0.2
899 0.18
900 0.19
901 0.2
902 0.2
903 0.2
904 0.19
905 0.15
906 0.19
907 0.2
908 0.22
909 0.22
910 0.21
911 0.21
912 0.21
913 0.2
914 0.16
915 0.18
916 0.14
917 0.12
918 0.11
919 0.18
920 0.2
921 0.19
922 0.19
923 0.15
924 0.16
925 0.17
926 0.17
927 0.1
928 0.08
929 0.09
930 0.17
931 0.2
932 0.22
933 0.24
934 0.26
935 0.32
936 0.33
937 0.33
938 0.29
939 0.33
940 0.37
941 0.45
942 0.44
943 0.41
944 0.45
945 0.44
946 0.41
947 0.38
948 0.34
949 0.29
950 0.34
951 0.32
952 0.28
953 0.32
954 0.34
955 0.32
956 0.32
957 0.27
958 0.24
959 0.25
960 0.29
961 0.29
962 0.33
963 0.32
964 0.33
965 0.34
966 0.31
967 0.29
968 0.27
969 0.26
970 0.19
971 0.25
972 0.27
973 0.29
974 0.32
975 0.36
976 0.4
977 0.46
978 0.56
979 0.6
980 0.65
981 0.68
982 0.72
983 0.74
984 0.7
985 0.61
986 0.55
987 0.45
988 0.35
989 0.28
990 0.22
991 0.2
992 0.22
993 0.2
994 0.2
995 0.22
996 0.22
997 0.24
998 0.26
999 0.23
1000 0.26
1001 0.27
1002 0.26
1003 0.24
1004 0.24
1005 0.2
1006 0.18
1007 0.18
1008 0.11
1009 0.1
1010 0.07
1011 0.06
1012 0.05
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.12
1021 0.12
1022 0.13
1023 0.15
1024 0.15
1025 0.14
1026 0.14
1027 0.15
1028 0.1
1029 0.11
1030 0.12
1031 0.1
1032 0.1
1033 0.1
1034 0.1
1035 0.1
1036 0.09
1037 0.13
1038 0.13
1039 0.2
1040 0.22
1041 0.28
1042 0.32
1043 0.35
1044 0.41
1045 0.41
1046 0.4
1047 0.36
1048 0.35
1049 0.37
1050 0.37
1051 0.34
1052 0.29
1053 0.28
1054 0.28
1055 0.26
1056 0.24
1057 0.19
1058 0.23
1059 0.26
1060 0.31
1061 0.31
1062 0.3
1063 0.31
1064 0.34
1065 0.36
1066 0.37
1067 0.36
1068 0.37
1069 0.36
1070 0.37
1071 0.38
1072 0.37
1073 0.33
1074 0.27
1075 0.25
1076 0.21
1077 0.18
1078 0.17
1079 0.15
1080 0.14
1081 0.13
1082 0.11
1083 0.09
1084 0.08
1085 0.09
1086 0.08
1087 0.08
1088 0.08
1089 0.09
1090 0.09
1091 0.12
1092 0.13
1093 0.11
1094 0.12
1095 0.14
1096 0.13
1097 0.14
1098 0.15
1099 0.18
1100 0.22
1101 0.28
1102 0.37
1103 0.37
1104 0.38
1105 0.39
1106 0.39
1107 0.35
1108 0.31
1109 0.29
1110 0.2
1111 0.21
1112 0.21
1113 0.18
1114 0.23
1115 0.22
1116 0.21
1117 0.22
1118 0.25
1119 0.26
1120 0.33
1121 0.34
1122 0.33
1123 0.42
1124 0.5
1125 0.53
1126 0.53
1127 0.49
1128 0.42
1129 0.44
1130 0.43
1131 0.36
1132 0.29
1133 0.24
1134 0.22
1135 0.23
1136 0.24
1137 0.2
1138 0.19
1139 0.18
1140 0.16
1141 0.18
1142 0.19
1143 0.18
1144 0.17
1145 0.17
1146 0.2
1147 0.19
1148 0.27
1149 0.34
1150 0.4
1151 0.45
1152 0.5
1153 0.52
1154 0.51
1155 0.52
1156 0.46
1157 0.38
1158 0.33
1159 0.27