Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YRI9

Protein Details
Accession A0A316YRI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-101RNAADSSKSSRAKRRRKVIGASAQETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-92SRAKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002343  Hud_Sxl_RNA  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPTRRRPSKAGPELTSRQESNTASVTQHRTAAHHTASAAVAAPPSHPPPPRSRQSSPLATTAAGRLHPSDEVPSQRNAADSSKSSRAKRRRKVIGASAQETPPFADEKQHDAGSGSHAAPSRPPATLVKNDPITFATGKTRSASLHGKSNNSTNTTTTMTHLDFNTDDPRDAEGSDTSLTATTPTSTSTSAPEVRPSGTVAAAAASTAAAAAAAGTVATAAADSVEIPRAPAAMRRSKSTIISSSRPVKKATGTFNTAASTIATNTKAAAVQTAPPAGPKRREAAQRQRSPSIQRSKTTSTSASSVYSDGTRLSRSVSFEEAKTRTGKTTTTTEQKSAEQEKEGELRASPSATTFTNNHDGRTGAVDSLVHTEDDTASALGAKGLLPILAQQHLASANIIAQLRALGSAYPPAPLGFSYNPYDHVAPYMHDPSSNLATNIYVNGLPSHTSDDDLLRLGSCFGPVKSHKAIINMDTGLCKGYGFIMYDRPEDAELALTQLPQHGLTTSWAKESFSTKLRRMADNSSTNVYLSNLPLDFNATQLEQLFAPHHVVSLRILLDNEGKSRGVGFVRLRDRDTAQECIDRLHGKILPGRSSSIQVRFADSEGQKRLKQTAKNAGPDVGYGTTIDSIFGASSLQQQQQQQQQQQASSSQQQQQQQLLIQLQSAGYSPSAWTGFATPQSTFYSPQFGTPALAGSAQGLPSLASPSLRSFSGSPHFQTFYDPLNPPVSNQLNYQGTPQLYYNSPLSSLASSPLSSFVPAGLSPEVPRFSDRRGSTGPGSAASRSPAAGPAAVLQATSTSNKRNSTTPTFLPPELQQQHAKQLLEQQLLHGQPIDQGQFEAFMRATPFESGYVMGNNNSIAGNGGGGGGRGGGCAEAGAGGSGAASGSSAAMDYVQQMSMVMAGLDANSAADWQASTAQQLQQLELIRQLYGNGGIGQDGSAVGLATEQARQPQPRSGQAGPALGLQVDASIQATSSLAVQPNQPSLLRFRVGQSSIDDNLRTRSPVPKTNSSTPGAGGSQMQGSPRASPNCVTGESPDKSAEQYVNGDQDDDQQQQDNSQSQAGDSSFVSATATVTTDGGGEDDSREMTTATTSSGEASVSFALSPSTSLKAIPLPLKQGANLIGQHGEHANIKQVNSIPASIEDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.69
3 0.59
4 0.51
5 0.48
6 0.44
7 0.39
8 0.37
9 0.32
10 0.28
11 0.34
12 0.38
13 0.34
14 0.37
15 0.35
16 0.34
17 0.38
18 0.43
19 0.37
20 0.33
21 0.31
22 0.29
23 0.28
24 0.25
25 0.21
26 0.14
27 0.13
28 0.11
29 0.13
30 0.15
31 0.18
32 0.24
33 0.28
34 0.32
35 0.41
36 0.5
37 0.59
38 0.63
39 0.65
40 0.66
41 0.7
42 0.75
43 0.69
44 0.64
45 0.56
46 0.48
47 0.44
48 0.39
49 0.33
50 0.25
51 0.23
52 0.2
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.21
57 0.24
58 0.3
59 0.31
60 0.32
61 0.32
62 0.32
63 0.32
64 0.3
65 0.28
66 0.27
67 0.28
68 0.32
69 0.39
70 0.45
71 0.5
72 0.58
73 0.65
74 0.71
75 0.77
76 0.82
77 0.83
78 0.85
79 0.87
80 0.87
81 0.87
82 0.84
83 0.77
84 0.71
85 0.62
86 0.54
87 0.45
88 0.35
89 0.26
90 0.2
91 0.17
92 0.21
93 0.21
94 0.27
95 0.31
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.29
100 0.26
101 0.27
102 0.21
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.22
107 0.27
108 0.25
109 0.21
110 0.24
111 0.26
112 0.31
113 0.38
114 0.42
115 0.44
116 0.47
117 0.47
118 0.46
119 0.42
120 0.4
121 0.33
122 0.29
123 0.29
124 0.25
125 0.26
126 0.27
127 0.27
128 0.24
129 0.29
130 0.34
131 0.3
132 0.37
133 0.4
134 0.43
135 0.43
136 0.49
137 0.49
138 0.45
139 0.44
140 0.36
141 0.36
142 0.34
143 0.33
144 0.28
145 0.27
146 0.24
147 0.26
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.23
152 0.27
153 0.24
154 0.23
155 0.21
156 0.23
157 0.21
158 0.21
159 0.2
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.2
177 0.24
178 0.24
179 0.27
180 0.27
181 0.27
182 0.27
183 0.25
184 0.22
185 0.17
186 0.16
187 0.12
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.06
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.14
219 0.2
220 0.27
221 0.29
222 0.34
223 0.38
224 0.41
225 0.44
226 0.43
227 0.44
228 0.41
229 0.43
230 0.45
231 0.51
232 0.55
233 0.53
234 0.5
235 0.46
236 0.46
237 0.48
238 0.49
239 0.46
240 0.45
241 0.44
242 0.43
243 0.41
244 0.35
245 0.29
246 0.22
247 0.16
248 0.12
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.17
263 0.22
264 0.26
265 0.3
266 0.3
267 0.32
268 0.37
269 0.46
270 0.52
271 0.58
272 0.63
273 0.68
274 0.71
275 0.72
276 0.7
277 0.69
278 0.68
279 0.67
280 0.63
281 0.57
282 0.58
283 0.58
284 0.57
285 0.54
286 0.47
287 0.39
288 0.35
289 0.33
290 0.28
291 0.23
292 0.2
293 0.17
294 0.15
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.22
305 0.23
306 0.23
307 0.29
308 0.28
309 0.28
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.24
314 0.24
315 0.21
316 0.26
317 0.3
318 0.36
319 0.37
320 0.37
321 0.38
322 0.39
323 0.42
324 0.41
325 0.36
326 0.3
327 0.28
328 0.29
329 0.29
330 0.28
331 0.22
332 0.17
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.13
341 0.13
342 0.17
343 0.26
344 0.26
345 0.26
346 0.25
347 0.25
348 0.22
349 0.25
350 0.21
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.13
356 0.13
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.06
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.04
394 0.04
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.12
403 0.1
404 0.13
405 0.16
406 0.16
407 0.18
408 0.2
409 0.2
410 0.17
411 0.18
412 0.15
413 0.13
414 0.16
415 0.16
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.15
420 0.18
421 0.18
422 0.14
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.11
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.11
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.13
450 0.14
451 0.2
452 0.21
453 0.24
454 0.25
455 0.27
456 0.29
457 0.25
458 0.26
459 0.21
460 0.2
461 0.17
462 0.15
463 0.12
464 0.1
465 0.08
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.08
471 0.13
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.12
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.05
490 0.06
491 0.08
492 0.11
493 0.11
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.14
498 0.17
499 0.18
500 0.21
501 0.26
502 0.27
503 0.34
504 0.36
505 0.37
506 0.38
507 0.39
508 0.4
509 0.39
510 0.39
511 0.33
512 0.31
513 0.28
514 0.25
515 0.21
516 0.15
517 0.1
518 0.1
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.11
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.08
554 0.12
555 0.13
556 0.18
557 0.23
558 0.25
559 0.26
560 0.26
561 0.27
562 0.28
563 0.29
564 0.25
565 0.22
566 0.22
567 0.21
568 0.2
569 0.21
570 0.17
571 0.15
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.17
576 0.18
577 0.18
578 0.18
579 0.2
580 0.17
581 0.19
582 0.21
583 0.21
584 0.24
585 0.22
586 0.23
587 0.22
588 0.22
589 0.25
590 0.23
591 0.24
592 0.24
593 0.27
594 0.26
595 0.27
596 0.32
597 0.32
598 0.34
599 0.36
600 0.43
601 0.45
602 0.47
603 0.47
604 0.42
605 0.37
606 0.33
607 0.28
608 0.17
609 0.12
610 0.08
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.05
616 0.05
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.07
622 0.1
623 0.12
624 0.15
625 0.16
626 0.21
627 0.28
628 0.34
629 0.33
630 0.36
631 0.36
632 0.34
633 0.33
634 0.31
635 0.27
636 0.25
637 0.27
638 0.27
639 0.3
640 0.33
641 0.35
642 0.35
643 0.33
644 0.3
645 0.27
646 0.23
647 0.19
648 0.14
649 0.12
650 0.1
651 0.09
652 0.08
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.08
662 0.09
663 0.11
664 0.13
665 0.11
666 0.13
667 0.16
668 0.17
669 0.18
670 0.17
671 0.2
672 0.19
673 0.2
674 0.18
675 0.16
676 0.15
677 0.13
678 0.13
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.06
689 0.07
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.08
694 0.1
695 0.1
696 0.11
697 0.1
698 0.14
699 0.19
700 0.2
701 0.21
702 0.23
703 0.24
704 0.23
705 0.25
706 0.23
707 0.21
708 0.24
709 0.23
710 0.22
711 0.25
712 0.25
713 0.22
714 0.28
715 0.27
716 0.23
717 0.23
718 0.27
719 0.25
720 0.25
721 0.27
722 0.23
723 0.2
724 0.2
725 0.2
726 0.16
727 0.15
728 0.17
729 0.16
730 0.13
731 0.13
732 0.13
733 0.13
734 0.12
735 0.11
736 0.11
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.11
741 0.1
742 0.1
743 0.09
744 0.08
745 0.08
746 0.08
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.13
752 0.14
753 0.13
754 0.16
755 0.15
756 0.18
757 0.25
758 0.25
759 0.28
760 0.29
761 0.32
762 0.31
763 0.33
764 0.31
765 0.25
766 0.25
767 0.21
768 0.19
769 0.17
770 0.15
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.11
775 0.1
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.09
780 0.09
781 0.07
782 0.07
783 0.08
784 0.11
785 0.12
786 0.15
787 0.2
788 0.23
789 0.25
790 0.28
791 0.33
792 0.38
793 0.42
794 0.39
795 0.42
796 0.43
797 0.42
798 0.4
799 0.35
800 0.37
801 0.34
802 0.35
803 0.33
804 0.31
805 0.38
806 0.4
807 0.39
808 0.29
809 0.35
810 0.37
811 0.36
812 0.34
813 0.28
814 0.29
815 0.29
816 0.29
817 0.21
818 0.15
819 0.14
820 0.17
821 0.16
822 0.11
823 0.11
824 0.1
825 0.12
826 0.12
827 0.11
828 0.09
829 0.09
830 0.1
831 0.11
832 0.12
833 0.11
834 0.11
835 0.1
836 0.11
837 0.11
838 0.11
839 0.12
840 0.11
841 0.11
842 0.11
843 0.1
844 0.1
845 0.09
846 0.08
847 0.07
848 0.06
849 0.05
850 0.05
851 0.06
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.04
856 0.04
857 0.04
858 0.04
859 0.04
860 0.03
861 0.03
862 0.03
863 0.03
864 0.03
865 0.03
866 0.03
867 0.03
868 0.03
869 0.03
870 0.03
871 0.03
872 0.03
873 0.03
874 0.03
875 0.03
876 0.03
877 0.03
878 0.03
879 0.04
880 0.05
881 0.06
882 0.06
883 0.06
884 0.06
885 0.06
886 0.07
887 0.06
888 0.05
889 0.04
890 0.04
891 0.04
892 0.04
893 0.04
894 0.03
895 0.03
896 0.03
897 0.03
898 0.04
899 0.04
900 0.04
901 0.07
902 0.07
903 0.09
904 0.12
905 0.14
906 0.17
907 0.18
908 0.18
909 0.19
910 0.2
911 0.19
912 0.2
913 0.18
914 0.15
915 0.15
916 0.14
917 0.12
918 0.11
919 0.12
920 0.09
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.08
925 0.07
926 0.06
927 0.05
928 0.04
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.05
934 0.07
935 0.07
936 0.12
937 0.18
938 0.21
939 0.24
940 0.31
941 0.35
942 0.4
943 0.46
944 0.43
945 0.44
946 0.44
947 0.43
948 0.36
949 0.32
950 0.26
951 0.19
952 0.17
953 0.11
954 0.08
955 0.06
956 0.06
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.05
961 0.05
962 0.06
963 0.07
964 0.1
965 0.11
966 0.12
967 0.15
968 0.18
969 0.2
970 0.22
971 0.22
972 0.2
973 0.24
974 0.28
975 0.26
976 0.25
977 0.25
978 0.31
979 0.31
980 0.32
981 0.31
982 0.31
983 0.32
984 0.33
985 0.32
986 0.25
987 0.28
988 0.27
989 0.25
990 0.23
991 0.28
992 0.32
993 0.39
994 0.45
995 0.51
996 0.57
997 0.63
998 0.67
999 0.62
1000 0.56
1001 0.49
1002 0.45
1003 0.36
1004 0.29
1005 0.22
1006 0.17
1007 0.17
1008 0.17
1009 0.16
1010 0.16
1011 0.17
1012 0.2
1013 0.26
1014 0.28
1015 0.28
1016 0.29
1017 0.32
1018 0.32
1019 0.33
1020 0.3
1021 0.27
1022 0.32
1023 0.32
1024 0.32
1025 0.3
1026 0.27
1027 0.27
1028 0.29
1029 0.26
1030 0.21
1031 0.23
1032 0.24
1033 0.27
1034 0.26
1035 0.25
1036 0.22
1037 0.27
1038 0.28
1039 0.26
1040 0.24
1041 0.23
1042 0.23
1043 0.25
1044 0.28
1045 0.26
1046 0.23
1047 0.23
1048 0.21
1049 0.18
1050 0.22
1051 0.2
1052 0.18
1053 0.14
1054 0.16
1055 0.14
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.11
1059 0.11
1060 0.1
1061 0.11
1062 0.08
1063 0.09
1064 0.09
1065 0.08
1066 0.08
1067 0.08
1068 0.08
1069 0.07
1070 0.08
1071 0.09
1072 0.1
1073 0.1
1074 0.1
1075 0.1
1076 0.09
1077 0.1
1078 0.1
1079 0.1
1080 0.11
1081 0.11
1082 0.12
1083 0.12
1084 0.12
1085 0.1
1086 0.12
1087 0.11
1088 0.1
1089 0.1
1090 0.09
1091 0.09
1092 0.09
1093 0.11
1094 0.11
1095 0.13
1096 0.13
1097 0.14
1098 0.16
1099 0.18
1100 0.24
1101 0.28
1102 0.29
1103 0.32
1104 0.36
1105 0.38
1106 0.36
1107 0.36
1108 0.34
1109 0.33
1110 0.3
1111 0.27
1112 0.24
1113 0.23
1114 0.24
1115 0.22
1116 0.21
1117 0.19
1118 0.19
1119 0.25
1120 0.25
1121 0.26
1122 0.28
1123 0.3
1124 0.33
1125 0.32
1126 0.32
1127 0.26