FuNGI

A0A316YXU5

Protein Details

Accession

A0A316YXU5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-55	VARPYGQRRGWKPREQDDFG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
214-235	WKFKKVPKGPPSPPPPVLRSPP

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSAAALSSLLPQPRHSMAVTVEEEPVVAPADERTTVARPYGQRRGWKPREQDDFGDGGAYPECHIAQYPLEMGRKKSSKSGSSLTLQVDGEGNVRYDAIVQQGRKEGQHYQSQFKDLVPLRERGDDKDTARDMDRPDAESVAETAERTRLALEKITQSKIKAAQPKNVATGGSGSSSYIRYTPGGQHGQEGGAGKQRIIKMSEQAEDPLEPSRWKFKKVPKGPPSPPPPVLRSPPRKITAQEQKEWMIPPCISNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDVHINDGFAQFSEALNLADRHAREEVRQRSLMQQKLAQKEKAAKEDHLRRLAQRAREERSGLAPAAGDDDEDEDDFDSRLGAAPAAARAGGGGGGSTANNIAAALAGYGSDSDSDAESDDDDDDDAARERDRLREERRREREREMRMSNMGTEQRAKMLAREQNRDISEKVALGLAKPTSSSDQVDTRLFNQEKLDATFGDEDSYNAFDKPLFSGSTAAAAIYKRPAGRASGAGGADDIYSAEGVQEAMENDRFGLGKSRAFEGAQYQEARDGPVQFEKDAADPFSINQFLDEAKRGTKRGGIDSGDAASSRKRAHAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.27
3	0.26
4	0.24
5	0.31
6	0.32
7	0.29
8	0.27
9	0.24
10	0.23
11	0.2
12	0.18
13	0.12
14	0.09
15	0.08
16	0.08
17	0.11
18	0.12
19	0.13
20	0.16
21	0.17
22	0.19
23	0.21
24	0.25
25	0.29
26	0.37
27	0.47
28	0.49
29	0.55
30	0.63
31	0.72
32	0.76
33	0.78
34	0.79
35	0.79
36	0.82
37	0.78
38	0.72
39	0.66
40	0.58
41	0.48
42	0.4
43	0.3
44	0.22
45	0.18
46	0.15
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.1
51	0.11
52	0.12
53	0.12
54	0.13
55	0.15
56	0.19
57	0.25
58	0.27
59	0.3
60	0.37
61	0.41
62	0.41
63	0.47
64	0.49
65	0.49
66	0.52
67	0.53
68	0.49
69	0.48
70	0.5
71	0.44
72	0.4
73	0.34
74	0.29
75	0.25
76	0.2
77	0.18
78	0.15
79	0.14
80	0.1
81	0.1
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.14
86	0.19
87	0.19
88	0.22
89	0.27
90	0.29
91	0.29
92	0.31
93	0.32
94	0.32
95	0.41
96	0.42
97	0.44
98	0.45
99	0.48
100	0.45
101	0.39
102	0.42
103	0.36
104	0.41
105	0.37
106	0.38
107	0.38
108	0.43
109	0.45
110	0.4
111	0.42
112	0.38
113	0.36
114	0.4
115	0.39
116	0.35
117	0.35
118	0.35
119	0.32
120	0.34
121	0.34
122	0.29
123	0.28
124	0.26
125	0.25
126	0.21
127	0.19
128	0.14
129	0.12
130	0.09
131	0.09
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.11
137	0.12
138	0.15
139	0.18
140	0.24
141	0.29
142	0.32
143	0.33
144	0.32
145	0.35
146	0.38
147	0.41
148	0.43
149	0.42
150	0.46
151	0.5
152	0.52
153	0.5
154	0.46
155	0.39
156	0.3
157	0.28
158	0.21
159	0.16
160	0.13
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.12
169	0.15
170	0.21
171	0.25
172	0.25
173	0.26
174	0.25
175	0.24
176	0.24
177	0.22
178	0.15
179	0.17
180	0.17
181	0.16
182	0.19
183	0.2
184	0.21
185	0.22
186	0.23
187	0.22
188	0.25
189	0.27
190	0.23
191	0.23
192	0.22
193	0.2
194	0.19
195	0.16
196	0.14
197	0.13
198	0.14
199	0.23
200	0.24
201	0.29
202	0.35
203	0.42
204	0.52
205	0.61
206	0.7
207	0.69
208	0.77
209	0.77
210	0.79
211	0.77
212	0.72
213	0.68
214	0.61
215	0.56
216	0.51
217	0.53
218	0.54
219	0.56
220	0.55
221	0.57
222	0.56
223	0.54
224	0.51
225	0.54
226	0.55
227	0.51
228	0.49
229	0.45
230	0.43
231	0.43
232	0.42
233	0.34
234	0.26
235	0.2
236	0.18
237	0.17
238	0.24
239	0.23
240	0.29
241	0.35
242	0.41
243	0.46
244	0.46
245	0.46
246	0.39
247	0.41
248	0.38
249	0.4
250	0.34
251	0.34
252	0.35
253	0.32
254	0.32
255	0.31
256	0.27
257	0.18
258	0.18
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.15
263	0.13
264	0.15
265	0.14
266	0.14
267	0.12
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.07
273	0.07
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.12
286	0.12
287	0.13
288	0.22
289	0.27
290	0.29
291	0.3
292	0.29
293	0.35
294	0.42
295	0.42
296	0.35
297	0.35
298	0.37
299	0.43
300	0.47
301	0.39
302	0.35
303	0.39
304	0.41
305	0.43
306	0.39
307	0.34
308	0.38
309	0.46
310	0.51
311	0.49
312	0.46
313	0.4
314	0.47
315	0.49
316	0.47
317	0.45
318	0.45
319	0.44
320	0.46
321	0.46
322	0.38
323	0.36
324	0.32
325	0.24
326	0.18
327	0.13
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.07
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.04
364	0.04
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.09
393	0.1
394	0.15
395	0.21
396	0.28
397	0.37
398	0.46
399	0.55
400	0.64
401	0.73
402	0.77
403	0.76
404	0.78
405	0.77
406	0.76
407	0.76
408	0.69
409	0.63
410	0.58
411	0.54
412	0.45
413	0.41
414	0.34
415	0.27
416	0.26
417	0.22
418	0.21
419	0.22
420	0.21
421	0.18
422	0.24
423	0.28
424	0.32
425	0.37
426	0.38
427	0.42
428	0.44
429	0.45
430	0.38
431	0.34
432	0.29
433	0.23
434	0.21
435	0.16
436	0.15
437	0.12
438	0.15
439	0.13
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.14
444	0.16
445	0.18
446	0.18
447	0.21
448	0.24
449	0.26
450	0.25
451	0.24
452	0.32
453	0.3
454	0.29
455	0.27
456	0.27
457	0.28
458	0.29
459	0.28
460	0.19
461	0.21
462	0.21
463	0.19
464	0.18
465	0.15
466	0.13
467	0.13
468	0.15
469	0.13
470	0.11
471	0.11
472	0.1
473	0.11
474	0.13
475	0.14
476	0.13
477	0.13
478	0.15
479	0.14
480	0.16
481	0.15
482	0.13
483	0.12
484	0.12
485	0.13
486	0.14
487	0.17
488	0.15
489	0.17
490	0.19
491	0.2
492	0.23
493	0.24
494	0.24
495	0.25
496	0.25
497	0.23
498	0.21
499	0.18
500	0.15
501	0.12
502	0.1
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.1
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.13
517	0.13
518	0.12
519	0.19
520	0.19
521	0.21
522	0.23
523	0.26
524	0.26
525	0.27
526	0.27
527	0.26
528	0.28
529	0.3
530	0.29
531	0.27
532	0.29
533	0.29
534	0.31
535	0.28
536	0.24
537	0.22
538	0.28
539	0.29
540	0.26
541	0.27
542	0.25
543	0.24
544	0.25
545	0.23
546	0.18
547	0.17
548	0.18
549	0.22
550	0.22
551	0.19
552	0.17
553	0.16
554	0.16
555	0.2
556	0.22
557	0.19
558	0.25
559	0.3
560	0.31
561	0.33
562	0.36
563	0.37
564	0.4
565	0.44
566	0.41
567	0.39
568	0.39
569	0.38
570	0.34
571	0.3
572	0.25
573	0.21
574	0.23
575	0.22

A0A316YXU5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer