Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YV89

Protein Details
Accession A0A316YV89    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-87LTEEERLRRRQEREARRKEKEARARGARFBasic
445-464RSRSLSPDARRRARRDDRGDBasic
541-561GGGGRRRRRGRGGGGERRYQDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-84LRRRQEREARRKEKEARARG
454-459RRRARR
538-557GGGGGGGRRRRRGRGGGGER
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MAENGMLDYGEAEDEGRIQPTDAALGQEGATWDLNPHLAPQEVFASDDEDEEMEDDSELTEEERLRRRQEREARRKEKEARARGARFYALPVEESVRAGANRGVSPLNDDELEGGQEREGDLAPPEVPRPIGGILDLRYSVLHMAGPPITQCSTSRLFSYVTHFGAQPLGLEWVNDQACNVVFANADAARLAIEYLCPATAMNAAPLVPLPTPDDLQRAQDAKLEHDRGNQVPDEPDQMLLESLLISRKAHRFPAKLYTGPERDTAMDLRSYRHVQQKAEQEDANEEEEPSALPADVPEIYREMEREDRMRQRKRQRGLSVPTAKLKDFEKLESLRGTLWIRWCIESLDVKSSGAARQSKWYRDHGLDAGRDVVAKPLVVGAASERPELFPGARVRRSDEEGKRAAMDAELDDFGRQRQQRRDRLDPLDEVEEEVSGRMQWSRDRSRSLSPDARRRARRDDRGDGTSGSVRVRGRGAMRAPRTSGWGNDEDDDAFHYAFVERGEEPVGSQGDLGGRMMSDRLDNSYYGGGGGDRNGGGGGGGGGRRRRRGRGGGGERRYQDDYYGDREERSLKDRIQPDDRSLASRLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.16
28 0.18
29 0.17
30 0.19
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.14
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.09
48 0.11
49 0.17
50 0.26
51 0.31
52 0.38
53 0.46
54 0.5
55 0.58
56 0.67
57 0.72
58 0.75
59 0.81
60 0.84
61 0.83
62 0.88
63 0.87
64 0.87
65 0.86
66 0.84
67 0.83
68 0.83
69 0.8
70 0.74
71 0.68
72 0.6
73 0.5
74 0.43
75 0.38
76 0.29
77 0.26
78 0.23
79 0.22
80 0.2
81 0.2
82 0.18
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.15
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.16
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.21
146 0.26
147 0.26
148 0.24
149 0.24
150 0.23
151 0.22
152 0.21
153 0.19
154 0.14
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.15
202 0.14
203 0.16
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.2
208 0.2
209 0.21
210 0.27
211 0.28
212 0.25
213 0.28
214 0.31
215 0.29
216 0.31
217 0.27
218 0.21
219 0.19
220 0.19
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.08
228 0.08
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.1
235 0.15
236 0.17
237 0.23
238 0.29
239 0.3
240 0.32
241 0.4
242 0.4
243 0.38
244 0.39
245 0.4
246 0.36
247 0.36
248 0.34
249 0.26
250 0.23
251 0.22
252 0.21
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.19
259 0.21
260 0.28
261 0.31
262 0.29
263 0.35
264 0.42
265 0.42
266 0.42
267 0.38
268 0.31
269 0.29
270 0.29
271 0.24
272 0.16
273 0.12
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.07
278 0.06
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.2
295 0.29
296 0.38
297 0.46
298 0.53
299 0.6
300 0.67
301 0.72
302 0.75
303 0.72
304 0.72
305 0.7
306 0.71
307 0.68
308 0.62
309 0.59
310 0.52
311 0.46
312 0.39
313 0.34
314 0.28
315 0.23
316 0.21
317 0.22
318 0.21
319 0.23
320 0.22
321 0.22
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.16
326 0.17
327 0.19
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.17
332 0.18
333 0.19
334 0.18
335 0.18
336 0.17
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.18
342 0.18
343 0.16
344 0.24
345 0.29
346 0.35
347 0.37
348 0.41
349 0.4
350 0.39
351 0.41
352 0.36
353 0.36
354 0.3
355 0.28
356 0.24
357 0.19
358 0.18
359 0.15
360 0.13
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.1
370 0.11
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.12
377 0.13
378 0.2
379 0.26
380 0.3
381 0.31
382 0.35
383 0.37
384 0.42
385 0.46
386 0.44
387 0.44
388 0.43
389 0.43
390 0.38
391 0.35
392 0.3
393 0.21
394 0.17
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.15
403 0.18
404 0.24
405 0.33
406 0.43
407 0.52
408 0.6
409 0.68
410 0.69
411 0.72
412 0.7
413 0.62
414 0.55
415 0.49
416 0.41
417 0.33
418 0.25
419 0.19
420 0.14
421 0.12
422 0.09
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.08
427 0.13
428 0.21
429 0.3
430 0.34
431 0.4
432 0.43
433 0.49
434 0.54
435 0.58
436 0.58
437 0.58
438 0.63
439 0.67
440 0.73
441 0.73
442 0.74
443 0.76
444 0.78
445 0.8
446 0.79
447 0.78
448 0.75
449 0.71
450 0.67
451 0.57
452 0.5
453 0.42
454 0.35
455 0.27
456 0.25
457 0.21
458 0.21
459 0.21
460 0.22
461 0.21
462 0.26
463 0.32
464 0.37
465 0.42
466 0.43
467 0.45
468 0.42
469 0.45
470 0.4
471 0.37
472 0.33
473 0.31
474 0.3
475 0.28
476 0.28
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.16
481 0.13
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.09
489 0.11
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.15
494 0.16
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.13
509 0.15
510 0.15
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.14
515 0.14
516 0.1
517 0.09
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.09
529 0.13
530 0.2
531 0.26
532 0.35
533 0.41
534 0.48
535 0.54
536 0.62
537 0.68
538 0.73
539 0.78
540 0.8
541 0.81
542 0.81
543 0.74
544 0.7
545 0.64
546 0.53
547 0.45
548 0.4
549 0.37
550 0.35
551 0.4
552 0.36
553 0.33
554 0.34
555 0.37
556 0.36
557 0.37
558 0.37
559 0.34
560 0.42
561 0.48
562 0.54
563 0.57
564 0.57
565 0.58
566 0.6
567 0.57
568 0.52