FuNGI

D6RKQ4

Protein Details

Accession

D6RKQ4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
234-253	SEFTPKRKTKTKAQRKWGDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
202-220	KNRLRGRGGRRGGRGGGRS
239-245	KRKTKTK

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 10.333, nucl 5.5, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR011012 Longin-like_dom_sf IPR027417 P-loop_NTPase IPR007222 Sig_recog_particle_rcpt_asu_N IPR013822 Signal_recog_particl_SRP54_hlx IPR036225 SRP/SRP_N IPR000897 SRP54_GTPase_dom IPR042101 SRP54_N_sf
Gene Ontology	GO:0005785 C:signal recognition particle receptor complex GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	cci:CC1G_13946 -
Pfam	View protein in Pfam PF04086 SRP-alpha_N PF00448 SRP54 PF02881 SRP54_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00300 SRP54
CDD	cd14826 SR_alpha_SRX cd17876 SRalpha_C

Amino Acid Sequences

MLDHCSISHKGGIVLWSRSFTPDAAQLASSSASPVNSLIREALIEGRTAEEKYEKDGYAVRWTFVNDLELIFVVAYQRILQLTYVDDLLSAIKTLFIKYFEPFIAAFVASLHAINTARAAAVQTTSWDFSKAFEGWDNIFDKVLRGFEEKAALERKSRLRAPVRPVEDLSTPPSDDQGTEPTVTADTSQDEQQIARNVQALKNRLRGRGGRRGGRGGGRSDAGSGRDSVPHSDSEFTPKRKTKTKAQRKWGDEVPTESDMASLDFSIDKPEDSEVGSHDLQSLVDQASLGTRTRDGMYEVKDWEFSTNDKDTDNAIANVLRPIEHKAASTSALGSLFARLTGSKVLTEADLKPVLEGMKQHLMKKNVAMDIAEKVCEGVGETLVGKKIGSFQTVTAAVRVALSNSLTRILTPKTSTDLLLSIKNKRASALPSGQQRMPYSITFVGVNGVGKSTNLSKVCFWLIQNGLRVLIAACDTFRSGAVEQLRVHVRNLGMLGVNGAGDSKGRVELFERGYGKDAAGIAKEAILYAKDNDFDVVLIDTAGRMQDNEPLMRALAKLVAVNNPDKIIFVGEALVGNEAVDQLTKFDRALRDFSSASGAGKGRGIDGMLVTKWDTVDDKVGAALSMTYVTGQPIIFVGCGQTYTDLRQLRVANVVGAILDN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.28
3	0.27
4	0.27
5	0.29
6	0.28
7	0.24
8	0.21
9	0.22
10	0.23
11	0.23
12	0.22
13	0.2
14	0.2
15	0.2
16	0.17
17	0.13
18	0.12
19	0.11
20	0.11
21	0.12
22	0.15
23	0.15
24	0.16
25	0.15
26	0.14
27	0.14
28	0.15
29	0.19
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.16
34	0.18
35	0.18
36	0.19
37	0.18
38	0.18
39	0.23
40	0.28
41	0.25
42	0.26
43	0.3
44	0.31
45	0.37
46	0.37
47	0.32
48	0.29
49	0.3
50	0.3
51	0.26
52	0.25
53	0.15
54	0.14
55	0.14
56	0.13
57	0.12
58	0.09
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.08
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.11
70	0.12
71	0.12
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.06
79	0.08
80	0.09
81	0.11
82	0.12
83	0.14
84	0.16
85	0.17
86	0.2
87	0.18
88	0.19
89	0.18
90	0.17
91	0.16
92	0.14
93	0.13
94	0.1
95	0.1
96	0.09
97	0.09
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.09
107	0.07
108	0.08
109	0.08
110	0.1
111	0.12
112	0.14
113	0.14
114	0.15
115	0.14
116	0.14
117	0.19
118	0.17
119	0.16
120	0.17
121	0.19
122	0.19
123	0.23
124	0.24
125	0.2
126	0.2
127	0.18
128	0.17
129	0.16
130	0.16
131	0.14
132	0.15
133	0.16
134	0.17
135	0.22
136	0.21
137	0.24
138	0.27
139	0.26
140	0.26
141	0.31
142	0.35
143	0.38
144	0.41
145	0.45
146	0.49
147	0.55
148	0.6
149	0.63
150	0.61
151	0.58
152	0.56
153	0.5
154	0.44
155	0.38
156	0.34
157	0.27
158	0.23
159	0.2
160	0.2
161	0.17
162	0.16
163	0.15
164	0.15
165	0.15
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.13
171	0.12
172	0.09
173	0.09
174	0.11
175	0.12
176	0.13
177	0.13
178	0.13
179	0.16
180	0.2
181	0.19
182	0.18
183	0.21
184	0.21
185	0.24
186	0.3
187	0.31
188	0.31
189	0.4
190	0.43
191	0.41
192	0.45
193	0.49
194	0.51
195	0.56
196	0.58
197	0.56
198	0.56
199	0.57
200	0.55
201	0.53
202	0.48
203	0.4
204	0.35
205	0.29
206	0.25
207	0.23
208	0.21
209	0.17
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.15
214	0.16
215	0.16
216	0.16
217	0.16
218	0.16
219	0.17
220	0.16
221	0.23
222	0.29
223	0.3
224	0.37
225	0.41
226	0.45
227	0.52
228	0.57
229	0.59
230	0.63
231	0.71
232	0.72
233	0.78
234	0.82
235	0.77
236	0.78
237	0.73
238	0.68
239	0.58
240	0.52
241	0.46
242	0.37
243	0.33
244	0.27
245	0.21
246	0.15
247	0.13
248	0.1
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.08
262	0.12
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.11
283	0.13
284	0.16
285	0.18
286	0.2
287	0.19
288	0.19
289	0.19
290	0.17
291	0.15
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.15
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.15
300	0.16
301	0.11
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.08
308	0.07
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.13
315	0.14
316	0.13
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.06
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.1
335	0.09
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.17
346	0.19
347	0.23
348	0.27
349	0.3
350	0.3
351	0.32
352	0.32
353	0.25
354	0.24
355	0.21
356	0.17
357	0.17
358	0.17
359	0.14
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.1
375	0.11
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.15
380	0.17
381	0.17
382	0.13
383	0.12
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.11
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.15
400	0.17
401	0.18
402	0.18
403	0.16
404	0.17
405	0.16
406	0.2
407	0.22
408	0.23
409	0.28
410	0.31
411	0.3
412	0.29
413	0.3
414	0.27
415	0.31
416	0.32
417	0.32
418	0.36
419	0.39
420	0.4
421	0.4
422	0.38
423	0.34
424	0.31
425	0.26
426	0.23
427	0.2
428	0.19
429	0.16
430	0.15
431	0.13
432	0.11
433	0.11
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.06
438	0.08
439	0.09
440	0.15
441	0.15
442	0.17
443	0.17
444	0.2
445	0.22
446	0.22
447	0.21
448	0.21
449	0.23
450	0.25
451	0.27
452	0.25
453	0.23
454	0.21
455	0.21
456	0.15
457	0.12
458	0.09
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.1
466	0.09
467	0.14
468	0.16
469	0.19
470	0.19
471	0.24
472	0.29
473	0.26
474	0.27
475	0.25
476	0.23
477	0.21
478	0.21
479	0.17
480	0.13
481	0.12
482	0.12
483	0.08
484	0.08
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.11
495	0.17
496	0.2
497	0.26
498	0.27
499	0.25
500	0.28
501	0.28
502	0.26
503	0.22
504	0.2
505	0.15
506	0.14
507	0.14
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.09
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.1
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.12
521	0.11
522	0.1
523	0.09
524	0.07
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.12
534	0.15
535	0.16
536	0.17
537	0.17
538	0.17
539	0.17
540	0.17
541	0.12
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.12
546	0.17
547	0.19
548	0.21
549	0.21
550	0.21
551	0.2
552	0.19
553	0.18
554	0.15
555	0.12
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.05
569	0.07
570	0.09
571	0.1
572	0.11
573	0.15
574	0.21
575	0.24
576	0.28
577	0.29
578	0.32
579	0.31
580	0.32
581	0.32
582	0.27
583	0.25
584	0.25
585	0.23
586	0.19
587	0.21
588	0.2
589	0.16
590	0.16
591	0.15
592	0.11
593	0.12
594	0.14
595	0.13
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.13
600	0.14
601	0.15
602	0.14
603	0.18
604	0.18
605	0.17
606	0.17
607	0.17
608	0.15
609	0.13
610	0.11
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.1
618	0.09
619	0.09
620	0.09
621	0.1
622	0.1
623	0.09
624	0.1
625	0.09
626	0.1
627	0.1
628	0.13
629	0.14
630	0.17
631	0.25
632	0.26
633	0.27
634	0.33
635	0.34
636	0.33
637	0.37
638	0.34
639	0.27
640	0.24
641	0.23

D6RKQ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer