Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YU28

Protein Details
Accession A0A316YU28    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-63TPPQTPSPTKRRAPANKRKRSASPAVKREAKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-78TKRRAPANKRKRSASPAVKREAKKEDEDAKADEKPKKAK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MAVAASSSTPRRSTRSSTTAATAAVKKEEPLTPPQTPSPTKRRAPANKRKRSASPAVKREAKKEDEDAKADEKPKKAKQTTTDKKLASLRASLASGPFPTHARPTAEEAQQVAEILTEAHGYKTMPFKQPPRGDDRFGGCGDVASVLDATVRTILSCNTSGKNSRNAHKSLCETFGKNNWQAILDASHADVARSIQCGGLHENKARTIQGVLRQTLERHGKLSLDHLHDANSTQVMEELVSFNGVGPKVASCVSAFCIGNDEMAVDTHVHRLCRKLGWVPDKATRDQTYYHLYERIPSKLKYPLHVLLIKHGKACAECSARGFATDRYASPDWEKEGMSVISGVKQEEWKEDDKAKFDVVKCPLRQAGLFSKSRAAGIKKESIKQENGSPVKKVGGSRVKKEEVEEEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.54
4 0.53
5 0.53
6 0.49
7 0.45
8 0.42
9 0.37
10 0.32
11 0.31
12 0.28
13 0.26
14 0.28
15 0.3
16 0.28
17 0.33
18 0.37
19 0.38
20 0.41
21 0.45
22 0.49
23 0.52
24 0.57
25 0.58
26 0.61
27 0.62
28 0.65
29 0.71
30 0.74
31 0.79
32 0.82
33 0.83
34 0.85
35 0.86
36 0.86
37 0.83
38 0.8
39 0.8
40 0.8
41 0.79
42 0.77
43 0.79
44 0.81
45 0.76
46 0.75
47 0.72
48 0.66
49 0.6
50 0.6
51 0.59
52 0.55
53 0.55
54 0.52
55 0.47
56 0.48
57 0.5
58 0.47
59 0.46
60 0.49
61 0.54
62 0.61
63 0.63
64 0.65
65 0.67
66 0.73
67 0.77
68 0.77
69 0.78
70 0.67
71 0.67
72 0.65
73 0.61
74 0.52
75 0.45
76 0.38
77 0.32
78 0.32
79 0.28
80 0.23
81 0.19
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.17
88 0.2
89 0.21
90 0.23
91 0.29
92 0.34
93 0.34
94 0.34
95 0.31
96 0.29
97 0.26
98 0.24
99 0.16
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.1
110 0.16
111 0.22
112 0.27
113 0.32
114 0.37
115 0.47
116 0.53
117 0.54
118 0.56
119 0.55
120 0.52
121 0.51
122 0.49
123 0.43
124 0.37
125 0.34
126 0.25
127 0.2
128 0.17
129 0.13
130 0.09
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.08
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.16
147 0.21
148 0.23
149 0.32
150 0.34
151 0.39
152 0.43
153 0.44
154 0.43
155 0.43
156 0.45
157 0.38
158 0.38
159 0.34
160 0.3
161 0.3
162 0.33
163 0.34
164 0.32
165 0.3
166 0.26
167 0.24
168 0.22
169 0.2
170 0.16
171 0.11
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.12
186 0.17
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.2
193 0.17
194 0.14
195 0.14
196 0.18
197 0.21
198 0.21
199 0.21
200 0.22
201 0.22
202 0.27
203 0.29
204 0.23
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.19
209 0.24
210 0.23
211 0.21
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.17
218 0.11
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.15
258 0.18
259 0.2
260 0.22
261 0.24
262 0.25
263 0.32
264 0.38
265 0.42
266 0.43
267 0.48
268 0.49
269 0.49
270 0.49
271 0.42
272 0.38
273 0.34
274 0.34
275 0.33
276 0.32
277 0.32
278 0.29
279 0.27
280 0.3
281 0.31
282 0.34
283 0.33
284 0.31
285 0.32
286 0.37
287 0.39
288 0.37
289 0.4
290 0.37
291 0.39
292 0.42
293 0.39
294 0.4
295 0.46
296 0.44
297 0.38
298 0.35
299 0.3
300 0.27
301 0.29
302 0.28
303 0.24
304 0.24
305 0.25
306 0.28
307 0.26
308 0.27
309 0.27
310 0.21
311 0.23
312 0.24
313 0.22
314 0.26
315 0.27
316 0.27
317 0.29
318 0.31
319 0.28
320 0.28
321 0.28
322 0.21
323 0.23
324 0.21
325 0.18
326 0.16
327 0.13
328 0.15
329 0.15
330 0.16
331 0.14
332 0.17
333 0.18
334 0.22
335 0.25
336 0.25
337 0.29
338 0.36
339 0.38
340 0.38
341 0.39
342 0.38
343 0.4
344 0.38
345 0.42
346 0.42
347 0.47
348 0.45
349 0.49
350 0.48
351 0.44
352 0.43
353 0.41
354 0.42
355 0.41
356 0.43
357 0.39
358 0.41
359 0.39
360 0.41
361 0.41
362 0.36
363 0.35
364 0.38
365 0.46
366 0.47
367 0.52
368 0.58
369 0.59
370 0.6
371 0.56
372 0.57
373 0.58
374 0.6
375 0.57
376 0.52
377 0.48
378 0.46
379 0.46
380 0.41
381 0.41
382 0.44
383 0.48
384 0.54
385 0.61
386 0.63
387 0.61
388 0.62