FuNGI

A0A316YPE1

Protein Details

Accession

A0A316YPE1

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
395-423	VVLVKKSYPDTKKRRNRRVWKLKSMAKAE	Hydrophilic
475-494	EERNRQRREDKARWKAMRAQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
406-418	KKRRNRRVWKLKS
482-489	REDKARWK

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEYISPQAPQQGLVLCADCGTPITPNNANLCLSCLRSSVDITEGIPKQATVNFCRNCERYLNPPTSWVPAQLESRELLAICLKKLKGLNKVRLIDASFIWTEPHSKRLRVKLTVQKEVLTSTILQQIFEIEYVVQYGQCPDCTRMAAKNTWRAMLQVRQKVPHKRTFLYLEQVILKHNAQRDTVSIAEKKDGLDFYYSQRAHAVKMCEFLASVVPIRTQASTSIVSMDIHTSTQNNKFTYSVEIAPICKDELVALPKSMAKSLGNISQLLLCARVSNSLRLLDPTTLQTADVTAEKYWRDPFESLCAIPELIEFLVLDIEPSGTTSADGRWATADAQVSPLNASSFGEADAVYHTRTHLGALLQPGDTAMGYQLGSANFNSTAWDSIPEARRPDVVLVKKSYPDTKKRRNRRVWKLKSMAKAEGEVETEGKAAVGRRGGLDGQKVEKDYEMFLRELEEDEELRAGVNLYRDPAAEERNRQRREDKARWKAMRAQKQAEKAAAGQDVMDEDDGDALTDDGFTTDGESEMGDDDAPGVRLDELLEDMEEMNIEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.16
3	0.16
4	0.15
5	0.12
6	0.11
7	0.1
8	0.12
9	0.13
10	0.19
11	0.22
12	0.26
13	0.3
14	0.31
15	0.31
16	0.28
17	0.3
18	0.28
19	0.27
20	0.24
21	0.22
22	0.21
23	0.22
24	0.23
25	0.21
26	0.2
27	0.18
28	0.18
29	0.25
30	0.24
31	0.24
32	0.22
33	0.21
34	0.2
35	0.23
36	0.27
37	0.25
38	0.34
39	0.36
40	0.39
41	0.47
42	0.47
43	0.46
44	0.47
45	0.45
46	0.44
47	0.49
48	0.52
49	0.44
50	0.48
51	0.47
52	0.47
53	0.44
54	0.38
55	0.33
56	0.31
57	0.35
58	0.31
59	0.31
60	0.25
61	0.25
62	0.23
63	0.19
64	0.16
65	0.17
66	0.18
67	0.17
68	0.23
69	0.22
70	0.25
71	0.31
72	0.36
73	0.41
74	0.49
75	0.57
76	0.6
77	0.63
78	0.6
79	0.58
80	0.53
81	0.45
82	0.36
83	0.31
84	0.22
85	0.2
86	0.19
87	0.16
88	0.2
89	0.19
90	0.27
91	0.27
92	0.32
93	0.39
94	0.48
95	0.55
96	0.55
97	0.63
98	0.64
99	0.69
100	0.71
101	0.65
102	0.57
103	0.5
104	0.46
105	0.37
106	0.28
107	0.21
108	0.14
109	0.2
110	0.18
111	0.18
112	0.16
113	0.17
114	0.16
115	0.15
116	0.14
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.07
122	0.06
123	0.09
124	0.1
125	0.11
126	0.14
127	0.15
128	0.17
129	0.19
130	0.21
131	0.23
132	0.27
133	0.32
134	0.35
135	0.42
136	0.41
137	0.41
138	0.39
139	0.35
140	0.35
141	0.37
142	0.39
143	0.39
144	0.4
145	0.45
146	0.52
147	0.6
148	0.63
149	0.64
150	0.61
151	0.55
152	0.57
153	0.57
154	0.53
155	0.5
156	0.43
157	0.37
158	0.34
159	0.32
160	0.28
161	0.24
162	0.21
163	0.18
164	0.22
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.2
169	0.21
170	0.22
171	0.23
172	0.21
173	0.2
174	0.21
175	0.21
176	0.2
177	0.18
178	0.17
179	0.14
180	0.14
181	0.14
182	0.16
183	0.25
184	0.24
185	0.22
186	0.26
187	0.25
188	0.24
189	0.27
190	0.27
191	0.19
192	0.22
193	0.21
194	0.18
195	0.17
196	0.16
197	0.13
198	0.1
199	0.1
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.12
220	0.17
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.22
225	0.22
226	0.25
227	0.23
228	0.18
229	0.16
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.12
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.09
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.12
243	0.13
244	0.14
245	0.13
246	0.12
247	0.09
248	0.1
249	0.12
250	0.15
251	0.15
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.12
257	0.11
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.1
262	0.11
263	0.12
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.14
268	0.16
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.11
273	0.1
274	0.1
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.12
285	0.12
286	0.14
287	0.14
288	0.15
289	0.18
290	0.2
291	0.18
292	0.17
293	0.16
294	0.13
295	0.12
296	0.11
297	0.07
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.04
307	0.03
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.1
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.11
319	0.11
320	0.13
321	0.13
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.13
349	0.14
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.1
354	0.09
355	0.07
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.07
361	0.07
362	0.09
363	0.08
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.09
369	0.1
370	0.09
371	0.11
372	0.1
373	0.16
374	0.21
375	0.23
376	0.25
377	0.25
378	0.26
379	0.25
380	0.28
381	0.29
382	0.3
383	0.32
384	0.34
385	0.35
386	0.37
387	0.39
388	0.43
389	0.43
390	0.48
391	0.54
392	0.61
393	0.69
394	0.77
395	0.86
396	0.89
397	0.92
398	0.93
399	0.94
400	0.93
401	0.93
402	0.91
403	0.87
404	0.84
405	0.78
406	0.72
407	0.62
408	0.54
409	0.44
410	0.37
411	0.31
412	0.24
413	0.19
414	0.14
415	0.12
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.16
426	0.18
427	0.21
428	0.22
429	0.24
430	0.26
431	0.27
432	0.25
433	0.25
434	0.23
435	0.21
436	0.23
437	0.21
438	0.19
439	0.18
440	0.19
441	0.18
442	0.18
443	0.17
444	0.14
445	0.12
446	0.12
447	0.13
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.09
452	0.08
453	0.1
454	0.11
455	0.12
456	0.13
457	0.13
458	0.16
459	0.18
460	0.24
461	0.27
462	0.36
463	0.44
464	0.54
465	0.57
466	0.59
467	0.61
468	0.64
469	0.69
470	0.71
471	0.71
472	0.72
473	0.79
474	0.8
475	0.8
476	0.8
477	0.8
478	0.79
479	0.77
480	0.76
481	0.72
482	0.75
483	0.74
484	0.67
485	0.58
486	0.49
487	0.45
488	0.37
489	0.3
490	0.22
491	0.17
492	0.16
493	0.15
494	0.13
495	0.09
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.05
508	0.07
509	0.07
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.09
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.08
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1

A0A316YPE1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer