Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YRB6

Protein Details
Accession A0A316YRB6    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-346VNYINDKNKHFNKKIKRFYDSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-88KGKGKGKGK
145-163ANKAKKSAKQEAAIARKMA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPRRTRAAKAAQEEAKADESSRAVRRTGKEREREQEQEQEQEQALGQAEDERDGQRPDATAVESVEKAASNGSTGASAKGKGKGKGKAAPEEEGGADVIEEDGSSKSEQANALTMEERMEKMKQLRKKMAESSIANRKAVATEANKAKKSAKQEAAIARKMAKAEKVLDERDAKERGEDVERQRAMGYSIEENEAWEAKLAKKAITKDQGAIDPQSAAERTYRRQINQLKPDLTTYDKQRASALGASPLQSGSSSSAMTHTTTGPSKGQVVKKDDLYGGINNLAYGDHKPDDAALDRVTQHLNQESDFRSKRSRYRPDDADAEVNYINDKNKHFNKKIKRFYDSYTQEIRENFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.5
3 0.43
4 0.35
5 0.3
6 0.24
7 0.22
8 0.27
9 0.31
10 0.3
11 0.3
12 0.37
13 0.42
14 0.49
15 0.57
16 0.6
17 0.63
18 0.69
19 0.74
20 0.75
21 0.75
22 0.7
23 0.69
24 0.63
25 0.6
26 0.53
27 0.49
28 0.41
29 0.35
30 0.3
31 0.23
32 0.2
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.14
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.09
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.16
67 0.23
68 0.28
69 0.32
70 0.38
71 0.42
72 0.47
73 0.51
74 0.54
75 0.55
76 0.53
77 0.5
78 0.44
79 0.39
80 0.33
81 0.27
82 0.22
83 0.13
84 0.1
85 0.07
86 0.06
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.21
110 0.28
111 0.33
112 0.4
113 0.48
114 0.51
115 0.56
116 0.58
117 0.56
118 0.56
119 0.53
120 0.51
121 0.52
122 0.5
123 0.44
124 0.39
125 0.33
126 0.27
127 0.25
128 0.23
129 0.15
130 0.19
131 0.27
132 0.33
133 0.33
134 0.34
135 0.36
136 0.35
137 0.4
138 0.43
139 0.4
140 0.36
141 0.41
142 0.48
143 0.51
144 0.49
145 0.43
146 0.35
147 0.31
148 0.3
149 0.26
150 0.2
151 0.16
152 0.17
153 0.21
154 0.24
155 0.23
156 0.26
157 0.27
158 0.27
159 0.28
160 0.28
161 0.22
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.18
166 0.21
167 0.2
168 0.27
169 0.27
170 0.27
171 0.26
172 0.24
173 0.22
174 0.19
175 0.17
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.17
191 0.19
192 0.26
193 0.31
194 0.31
195 0.29
196 0.31
197 0.31
198 0.29
199 0.27
200 0.2
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.1
205 0.09
206 0.11
207 0.13
208 0.15
209 0.23
210 0.26
211 0.26
212 0.35
213 0.44
214 0.5
215 0.57
216 0.61
217 0.54
218 0.52
219 0.52
220 0.45
221 0.4
222 0.35
223 0.31
224 0.33
225 0.32
226 0.32
227 0.32
228 0.3
229 0.29
230 0.28
231 0.23
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.15
238 0.12
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.17
252 0.16
253 0.17
254 0.21
255 0.26
256 0.31
257 0.34
258 0.39
259 0.41
260 0.41
261 0.43
262 0.38
263 0.34
264 0.32
265 0.26
266 0.21
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.15
280 0.16
281 0.18
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.19
286 0.21
287 0.18
288 0.2
289 0.22
290 0.23
291 0.21
292 0.25
293 0.27
294 0.34
295 0.36
296 0.36
297 0.39
298 0.44
299 0.53
300 0.59
301 0.66
302 0.66
303 0.72
304 0.75
305 0.72
306 0.71
307 0.66
308 0.61
309 0.5
310 0.45
311 0.36
312 0.3
313 0.26
314 0.23
315 0.23
316 0.22
317 0.25
318 0.31
319 0.4
320 0.51
321 0.58
322 0.66
323 0.73
324 0.79
325 0.87
326 0.86
327 0.84
328 0.77
329 0.75
330 0.76
331 0.7
332 0.66
333 0.64
334 0.57
335 0.54
336 0.51
337 0.51
338 0.45
339 0.42
340 0.35