Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YMW5

Protein Details
Accession A0A316YMW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-353DDGYRRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRRDRRDGRDYRDRSDRRRSRSPGPRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-353RDRDRDRDRDRDRDRDRRDRRDGRDYRDRSDRRRSRSPGPRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRKAEVQRALLEKLMGPEAMGLSTKQLHFTDEKVCRNFLCGTCPHDLFSNTKVDLGPCPRSHTARLKEEFNASVSGGEKYPTFEAEYEDNIRGFMADIDRKIAANKRRIDQTPEETAKFTNLMRDIADVEAALNSAMAEVERLGEQGQIEESLAELQKAEALKGEKQDRERELQALSDSAGASGHQKLRVCDVCGAYLSILDSDRRLADHFGGRMHLGYLRLREIITEFDERRRRGEDPRQAIAAGIGWRPGQGQNGSNGAGLAPPPVAMNGGGHGYGARGPPPMDSGYGGRYGGGAPAPVDDGYRRDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRRDRRDGRDYRDRSDRRRSRSPGPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.2
4 0.15
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.1
10 0.11
11 0.16
12 0.16
13 0.19
14 0.19
15 0.22
16 0.23
17 0.26
18 0.33
19 0.36
20 0.44
21 0.43
22 0.45
23 0.41
24 0.43
25 0.46
26 0.38
27 0.36
28 0.31
29 0.33
30 0.37
31 0.37
32 0.35
33 0.32
34 0.33
35 0.3
36 0.3
37 0.31
38 0.26
39 0.27
40 0.26
41 0.24
42 0.29
43 0.32
44 0.36
45 0.31
46 0.38
47 0.4
48 0.43
49 0.49
50 0.52
51 0.55
52 0.56
53 0.59
54 0.56
55 0.54
56 0.54
57 0.49
58 0.4
59 0.33
60 0.24
61 0.21
62 0.19
63 0.17
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.15
73 0.16
74 0.2
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.14
81 0.13
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.19
90 0.24
91 0.27
92 0.33
93 0.37
94 0.39
95 0.46
96 0.48
97 0.53
98 0.52
99 0.51
100 0.52
101 0.51
102 0.48
103 0.42
104 0.39
105 0.33
106 0.28
107 0.23
108 0.18
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.1
150 0.12
151 0.17
152 0.21
153 0.23
154 0.26
155 0.31
156 0.31
157 0.34
158 0.33
159 0.3
160 0.26
161 0.23
162 0.2
163 0.15
164 0.13
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.2
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.21
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.18
216 0.18
217 0.25
218 0.32
219 0.32
220 0.34
221 0.36
222 0.35
223 0.39
224 0.48
225 0.5
226 0.5
227 0.52
228 0.5
229 0.47
230 0.44
231 0.35
232 0.27
233 0.19
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.16
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.19
247 0.18
248 0.14
249 0.12
250 0.1
251 0.08
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.17
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.14
292 0.19
293 0.26
294 0.27
295 0.32
296 0.4
297 0.49
298 0.58
299 0.65
300 0.69
301 0.72
302 0.78
303 0.83
304 0.83
305 0.83
306 0.8
307 0.8
308 0.79
309 0.79
310 0.81
311 0.81
312 0.83
313 0.83
314 0.86
315 0.86
316 0.89
317 0.89
318 0.87
319 0.88
320 0.86
321 0.84
322 0.85
323 0.79
324 0.75
325 0.76
326 0.76
327 0.73
328 0.76
329 0.76
330 0.74
331 0.79
332 0.79
333 0.79