Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316YXD7

Protein Details
Accession A0A316YXD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
258-280DFYSVQKEMKHRQRERKEKATLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-122RSNRGRGAEARGGRGRGASGRGRGR
292-331PSPGRGGARGGARGGRGGERGAERGGRGRGAARGGRGGRP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, cyto 9.5, nucl 8, cyto_mito 7.832, mito 4.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNPFALLGDEDGPAPAGAAAAAPASAKQADAAPVKRNIPGAGGNNANNGTGRQQANARGANSAGRGGARSSRQTEAGAGAGGDEESPAQRDGRSNRGRGAEARGGRGRGASGRGRGRQFDRHSQTGREDSNKNLHQGWGGDDPKRELAVDENARADAAAEGGDSVKPSSDAPVSGEANGWDAPAEGGAKTGDAPSAPLAAVEEEKDNTKTLDEYLAEQAAKRAQIGAKKEARQADNIDASSLGKKVEHSRGEDFYSVQKEMKHRQRERKEKATLEIEQTFYTPPVRPSPGRGGARGGARGGRGGERGAERGGRGRGAARGGRGGRPTGPAVNLADQSAFPTLGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.16
5 0.13
6 0.11
7 0.07
8 0.06
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.04
13 0.05
14 0.04
15 0.05
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.08
20 0.1
21 0.15
22 0.21
23 0.25
24 0.29
25 0.34
26 0.35
27 0.37
28 0.37
29 0.32
30 0.29
31 0.31
32 0.29
33 0.29
34 0.31
35 0.3
36 0.31
37 0.31
38 0.28
39 0.23
40 0.2
41 0.17
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.22
46 0.27
47 0.33
48 0.36
49 0.35
50 0.29
51 0.29
52 0.29
53 0.27
54 0.22
55 0.16
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.18
60 0.19
61 0.23
62 0.26
63 0.27
64 0.28
65 0.28
66 0.28
67 0.24
68 0.21
69 0.16
70 0.12
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.14
83 0.18
84 0.29
85 0.35
86 0.35
87 0.39
88 0.42
89 0.43
90 0.4
91 0.43
92 0.4
93 0.35
94 0.39
95 0.37
96 0.34
97 0.32
98 0.3
99 0.24
100 0.19
101 0.22
102 0.2
103 0.24
104 0.29
105 0.35
106 0.36
107 0.4
108 0.42
109 0.46
110 0.48
111 0.52
112 0.52
113 0.53
114 0.53
115 0.52
116 0.51
117 0.48
118 0.46
119 0.41
120 0.36
121 0.32
122 0.38
123 0.38
124 0.36
125 0.31
126 0.28
127 0.24
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.23
135 0.23
136 0.22
137 0.19
138 0.12
139 0.12
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.07
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.09
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.17
217 0.21
218 0.28
219 0.33
220 0.36
221 0.41
222 0.44
223 0.44
224 0.42
225 0.41
226 0.38
227 0.35
228 0.32
229 0.28
230 0.22
231 0.22
232 0.2
233 0.17
234 0.12
235 0.09
236 0.11
237 0.17
238 0.24
239 0.27
240 0.31
241 0.34
242 0.37
243 0.39
244 0.38
245 0.33
246 0.3
247 0.3
248 0.26
249 0.24
250 0.25
251 0.28
252 0.37
253 0.46
254 0.51
255 0.57
256 0.67
257 0.76
258 0.84
259 0.87
260 0.87
261 0.86
262 0.79
263 0.77
264 0.72
265 0.65
266 0.6
267 0.54
268 0.46
269 0.38
270 0.34
271 0.28
272 0.23
273 0.22
274 0.18
275 0.18
276 0.22
277 0.28
278 0.28
279 0.34
280 0.42
281 0.49
282 0.49
283 0.48
284 0.46
285 0.45
286 0.47
287 0.42
288 0.35
289 0.28
290 0.25
291 0.26
292 0.23
293 0.21
294 0.19
295 0.18
296 0.21
297 0.21
298 0.22
299 0.23
300 0.23
301 0.22
302 0.26
303 0.28
304 0.25
305 0.24
306 0.24
307 0.25
308 0.29
309 0.31
310 0.28
311 0.33
312 0.35
313 0.39
314 0.4
315 0.39
316 0.35
317 0.36
318 0.37
319 0.33
320 0.31
321 0.3
322 0.3
323 0.31
324 0.3
325 0.27
326 0.24
327 0.2
328 0.21
329 0.2