FuNGI

A0A316YTN8

Protein Details

Accession

A0A316YTN8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-23	SSSSRKRTEHIERTRYPNPL	Hydrophilic
303-323	DEDRPKKGKAPKTRRAFRSRE	Basic
639-661	DEAVGARRSRRGPRPVRQTEEAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
306-320	RPKKGKAPKTRRAFR

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSSSSSRKRTEHIERTRYPNPLPLPPYPPKQLAINTPPSRYVDPRLFGQRLAASVPLPMVVDAEAGMPLDMTSFPACWYTDQELADADAQGRGGVFPILDRSQVQIDEEDAFLLSDLMSTSTTINGATAADGIDGTATPERGQPTWLKRTEYLAAAEKKARRSELASRHANVESIDASREAQLARIKVTFEAANQPLETLRHPTKGHLRAIDAFPLLPDTDTWATRVDVFRFGDAPGRHIDNRPAHDPRLQTAILRPHQDTLGQPLFSLFAIDAPEAEDIVEQEDEDMFGSGEEADDGDDDDEDRPKKGKAPKTRRAFRSREQQLAAEDAESRRAVDARIRGMKTDAEKQDVQAEVFETADSEERPIHMALLRDYETHDESMRKDQELIVSFLTGPSRIERDDASGAGPEAGEANNGVLPPLTAYEKSFQTKRGDAVHAGNVALYHPVSMRASLRVKRRRPIDPQPPEHWDAINLGKRSVSTYERIERLHERKLVDDLDLGLLPERIPLPEPIEEEAEETVGEEGVEGPAGAIDEVEKEDENVDDDEDSRATPSQKAQEPAEVGAEGADEDEEEEEEEEEEEEGEETVKKHKKSKAGSGSDSDDEDDEEGSDEGMDDDELEALRAEAGADAAEDEGADEAVGARRSRRGPRPVRQTEEAEKEDSLGAEARGNGADEMDVDEDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.74
3	0.78
4	0.8
5	0.76
6	0.67
7	0.65
8	0.59
9	0.57
10	0.56
11	0.53
12	0.55
13	0.56
14	0.61
15	0.59
16	0.58
17	0.51
18	0.52
19	0.51
20	0.51
21	0.52
22	0.56
23	0.54
24	0.53
25	0.54
26	0.53
27	0.53
28	0.48
29	0.48
30	0.44
31	0.43
32	0.47
33	0.52
34	0.5
35	0.45
36	0.46
37	0.4
38	0.34
39	0.32
40	0.27
41	0.18
42	0.18
43	0.18
44	0.13
45	0.12
46	0.1
47	0.09
48	0.08
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.06
53	0.06
54	0.06
55	0.05
56	0.05
57	0.06
58	0.05
59	0.07
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.11
64	0.12
65	0.13
66	0.18
67	0.21
68	0.24
69	0.24
70	0.24
71	0.23
72	0.24
73	0.23
74	0.18
75	0.14
76	0.1
77	0.1
78	0.09
79	0.09
80	0.07
81	0.07
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.11
86	0.12
87	0.13
88	0.14
89	0.16
90	0.18
91	0.19
92	0.19
93	0.15
94	0.16
95	0.16
96	0.15
97	0.13
98	0.1
99	0.1
100	0.08
101	0.08
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.06
107	0.06
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.04
123	0.06
124	0.07
125	0.08
126	0.08
127	0.11
128	0.14
129	0.14
130	0.17
131	0.23
132	0.29
133	0.38
134	0.41
135	0.43
136	0.42
137	0.46
138	0.47
139	0.42
140	0.38
141	0.37
142	0.36
143	0.35
144	0.39
145	0.39
146	0.41
147	0.42
148	0.4
149	0.34
150	0.36
151	0.43
152	0.47
153	0.52
154	0.52
155	0.5
156	0.52
157	0.49
158	0.45
159	0.36
160	0.27
161	0.2
162	0.15
163	0.14
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.1
169	0.13
170	0.16
171	0.16
172	0.17
173	0.18
174	0.18
175	0.17
176	0.19
177	0.16
178	0.14
179	0.2
180	0.19
181	0.2
182	0.19
183	0.19
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.18
188	0.19
189	0.23
190	0.24
191	0.28
192	0.37
193	0.42
194	0.46
195	0.41
196	0.41
197	0.4
198	0.41
199	0.39
200	0.3
201	0.23
202	0.18
203	0.17
204	0.14
205	0.1
206	0.08
207	0.11
208	0.12
209	0.13
210	0.14
211	0.14
212	0.14
213	0.17
214	0.19
215	0.16
216	0.19
217	0.2
218	0.2
219	0.19
220	0.19
221	0.23
222	0.2
223	0.21
224	0.18
225	0.21
226	0.22
227	0.23
228	0.3
229	0.29
230	0.33
231	0.37
232	0.38
233	0.37
234	0.39
235	0.39
236	0.33
237	0.32
238	0.28
239	0.23
240	0.24
241	0.31
242	0.3
243	0.32
244	0.31
245	0.27
246	0.28
247	0.28
248	0.24
249	0.23
250	0.23
251	0.19
252	0.19
253	0.17
254	0.18
255	0.16
256	0.16
257	0.08
258	0.05
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.05
267	0.04
268	0.06
269	0.06
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.03
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.05
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.12
295	0.18
296	0.26
297	0.34
298	0.42
299	0.52
300	0.6
301	0.7
302	0.78
303	0.8
304	0.81
305	0.79
306	0.74
307	0.75
308	0.7
309	0.65
310	0.58
311	0.51
312	0.43
313	0.38
314	0.31
315	0.21
316	0.17
317	0.11
318	0.12
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.1
325	0.13
326	0.17
327	0.23
328	0.23
329	0.23
330	0.24
331	0.25
332	0.25
333	0.29
334	0.26
335	0.24
336	0.24
337	0.24
338	0.26
339	0.25
340	0.22
341	0.14
342	0.13
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.12
360	0.13
361	0.12
362	0.12
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.12
368	0.14
369	0.21
370	0.21
371	0.19
372	0.19
373	0.19
374	0.22
375	0.22
376	0.22
377	0.15
378	0.14
379	0.14
380	0.14
381	0.13
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.13
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.09
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.11
414	0.15
415	0.18
416	0.2
417	0.23
418	0.26
419	0.28
420	0.3
421	0.31
422	0.31
423	0.3
424	0.31
425	0.29
426	0.25
427	0.23
428	0.2
429	0.15
430	0.13
431	0.11
432	0.08
433	0.06
434	0.05
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.1
439	0.15
440	0.21
441	0.26
442	0.36
443	0.44
444	0.5
445	0.55
446	0.61
447	0.63
448	0.66
449	0.71
450	0.72
451	0.73
452	0.74
453	0.72
454	0.72
455	0.67
456	0.59
457	0.49
458	0.38
459	0.31
460	0.31
461	0.31
462	0.25
463	0.23
464	0.22
465	0.22
466	0.23
467	0.24
468	0.2
469	0.18
470	0.24
471	0.29
472	0.32
473	0.32
474	0.35
475	0.4
476	0.41
477	0.44
478	0.43
479	0.38
480	0.37
481	0.4
482	0.36
483	0.28
484	0.24
485	0.18
486	0.16
487	0.15
488	0.13
489	0.1
490	0.09
491	0.08
492	0.09
493	0.08
494	0.07
495	0.09
496	0.1
497	0.13
498	0.16
499	0.17
500	0.18
501	0.19
502	0.19
503	0.19
504	0.17
505	0.14
506	0.11
507	0.1
508	0.08
509	0.06
510	0.05
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.03
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.03
521	0.03
522	0.05
523	0.05
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.1
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.12
539	0.13
540	0.15
541	0.19
542	0.26
543	0.3
544	0.34
545	0.35
546	0.37
547	0.38
548	0.36
549	0.33
550	0.25
551	0.2
552	0.16
553	0.14
554	0.08
555	0.07
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.07
573	0.08
574	0.08
575	0.18
576	0.24
577	0.27
578	0.35
579	0.41
580	0.5
581	0.56
582	0.66
583	0.68
584	0.7
585	0.71
586	0.68
587	0.67
588	0.6
589	0.53
590	0.43
591	0.33
592	0.25
593	0.21
594	0.16
595	0.11
596	0.1
597	0.09
598	0.08
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.07
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.04
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.04
626	0.04
627	0.05
628	0.09
629	0.13
630	0.13
631	0.15
632	0.22
633	0.29
634	0.39
635	0.47
636	0.54
637	0.62
638	0.71
639	0.8
640	0.84
641	0.85
642	0.82
643	0.8
644	0.78
645	0.76
646	0.69
647	0.61
648	0.51
649	0.44
650	0.39
651	0.32
652	0.24
653	0.18
654	0.15
655	0.15
656	0.15
657	0.15
658	0.14
659	0.15
660	0.14
661	0.12
662	0.11
663	0.09
664	0.12

A0A316YTN8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer