Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A316YIV3

Protein Details
Accession A0A316YIV3    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-54ASPLNKRRSLSPQDKRHDSKARDHydrophilic
66-95QEQLRRRAMMSKNRSKRSPRSSRSLSRSPSHydrophilic
131-154NRSPRDSDRARDRIRRRRGYDDDDBasic
178-199DDEYEGRRRRRSQRSDLPNDPYHydrophilic
239-260RDPYYDRRRHTRSPSPPPRRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-113RRRAMMSKNRSKRSPRSSRSLSRSPSRSPGPIGDKRRRGLSPRP
245-273RRRHTRSPSPPPRRGGGAGRGRGREESKP
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MYADREEAALINGRKGRRIDYSSSNVGSSGSASPLNKRRSLSPQDKRHDSKARDSAGAEDRERQLQEQLRRRAMMSKNRSKRSPRSSRSLSRSPSRSPGPIGDKRRRGLSPRPSRNTNGYATSSRDGHDDNRSPRDSDRARDRIRRRRGYDDDDDDRRSSRRSTHSVSRAGDSEEDVDDEYEGRRRRRSQRSDLPNDPYARRDADPYYDRHHPYYGRDPYHYDHYHRGGPPRYYDAYARDPYYDRRRHTRSPSPPPRRGGGAGRGRGREESKPRTPDPDDYELRSIFCSQLAARLGQRDLGEFFEDKLGEDTVRDVRIITDRVTGRSKGIGYVELSDEALVEQALGLSGSSLFGIPILIQRTEATRNRTESGSNLDGPARPNLDGGYSALDTGASRLQTAANSDARLYVGSLNFNLNEEDVKAVFAPFGDIENVDLHREPGTMKSKGFAFVQFATREGAEKAMQHMNGFDLAGRQIRVGRVNARGPVSVGGSGGGAASSGIDTSGSGAQTISSFDEGGGGGLSASGRVALMEKLARSTETGASSLPQRPVEQQRPASIPQAVSRAVLLKHMFNPEEETERDWDTELAADVKEECQTKYGPVEKIYVDKDSSGDIWLRFADLDGAKKGIAGLNGRFFGGQSITAEYVSEGIMNSVTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.38
4 0.39
5 0.45
6 0.45
7 0.49
8 0.55
9 0.56
10 0.55
11 0.51
12 0.42
13 0.36
14 0.3
15 0.24
16 0.18
17 0.14
18 0.16
19 0.17
20 0.26
21 0.34
22 0.4
23 0.42
24 0.43
25 0.47
26 0.53
27 0.62
28 0.65
29 0.67
30 0.71
31 0.76
32 0.84
33 0.83
34 0.83
35 0.83
36 0.77
37 0.77
38 0.75
39 0.7
40 0.63
41 0.58
42 0.55
43 0.53
44 0.53
45 0.44
46 0.41
47 0.39
48 0.41
49 0.42
50 0.36
51 0.36
52 0.38
53 0.47
54 0.51
55 0.57
56 0.58
57 0.58
58 0.58
59 0.59
60 0.6
61 0.61
62 0.62
63 0.64
64 0.68
65 0.74
66 0.81
67 0.81
68 0.83
69 0.83
70 0.84
71 0.8
72 0.8
73 0.82
74 0.84
75 0.83
76 0.82
77 0.78
78 0.76
79 0.75
80 0.7
81 0.67
82 0.62
83 0.58
84 0.52
85 0.53
86 0.53
87 0.56
88 0.61
89 0.63
90 0.66
91 0.65
92 0.68
93 0.65
94 0.62
95 0.64
96 0.65
97 0.66
98 0.69
99 0.74
100 0.73
101 0.74
102 0.74
103 0.69
104 0.62
105 0.55
106 0.49
107 0.44
108 0.44
109 0.42
110 0.36
111 0.31
112 0.29
113 0.26
114 0.26
115 0.32
116 0.35
117 0.38
118 0.45
119 0.46
120 0.46
121 0.45
122 0.51
123 0.46
124 0.46
125 0.5
126 0.52
127 0.58
128 0.66
129 0.75
130 0.75
131 0.82
132 0.84
133 0.8
134 0.8
135 0.81
136 0.79
137 0.77
138 0.75
139 0.71
140 0.66
141 0.63
142 0.55
143 0.49
144 0.42
145 0.36
146 0.31
147 0.31
148 0.34
149 0.38
150 0.43
151 0.51
152 0.57
153 0.61
154 0.6
155 0.55
156 0.49
157 0.43
158 0.37
159 0.28
160 0.23
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.13
169 0.18
170 0.21
171 0.28
172 0.36
173 0.46
174 0.57
175 0.65
176 0.7
177 0.75
178 0.82
179 0.85
180 0.83
181 0.79
182 0.74
183 0.68
184 0.59
185 0.5
186 0.42
187 0.37
188 0.31
189 0.28
190 0.23
191 0.27
192 0.29
193 0.3
194 0.32
195 0.36
196 0.38
197 0.36
198 0.38
199 0.33
200 0.35
201 0.42
202 0.45
203 0.41
204 0.41
205 0.42
206 0.42
207 0.49
208 0.46
209 0.39
210 0.37
211 0.38
212 0.42
213 0.41
214 0.45
215 0.42
216 0.41
217 0.4
218 0.4
219 0.39
220 0.34
221 0.34
222 0.32
223 0.33
224 0.33
225 0.31
226 0.28
227 0.27
228 0.33
229 0.41
230 0.43
231 0.4
232 0.47
233 0.53
234 0.58
235 0.65
236 0.68
237 0.68
238 0.73
239 0.8
240 0.81
241 0.81
242 0.76
243 0.7
244 0.63
245 0.56
246 0.49
247 0.47
248 0.45
249 0.44
250 0.45
251 0.44
252 0.42
253 0.41
254 0.4
255 0.37
256 0.38
257 0.4
258 0.43
259 0.47
260 0.48
261 0.51
262 0.51
263 0.5
264 0.48
265 0.47
266 0.42
267 0.39
268 0.41
269 0.35
270 0.33
271 0.27
272 0.22
273 0.14
274 0.12
275 0.11
276 0.08
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.15
308 0.16
309 0.19
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.2
314 0.19
315 0.15
316 0.15
317 0.13
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.1
322 0.1
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.03
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.17
350 0.2
351 0.23
352 0.25
353 0.28
354 0.29
355 0.3
356 0.28
357 0.24
358 0.26
359 0.24
360 0.21
361 0.19
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.2
366 0.15
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.15
428 0.21
429 0.22
430 0.21
431 0.23
432 0.23
433 0.25
434 0.26
435 0.2
436 0.18
437 0.18
438 0.22
439 0.21
440 0.21
441 0.2
442 0.18
443 0.18
444 0.15
445 0.15
446 0.11
447 0.12
448 0.15
449 0.18
450 0.18
451 0.17
452 0.17
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.1
457 0.07
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.14
464 0.17
465 0.19
466 0.23
467 0.26
468 0.3
469 0.33
470 0.32
471 0.3
472 0.28
473 0.26
474 0.23
475 0.18
476 0.14
477 0.11
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.05
482 0.04
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.05
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.1
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.05
507 0.04
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.03
514 0.04
515 0.05
516 0.05
517 0.08
518 0.1
519 0.11
520 0.13
521 0.13
522 0.14
523 0.14
524 0.17
525 0.18
526 0.18
527 0.18
528 0.16
529 0.17
530 0.21
531 0.25
532 0.26
533 0.24
534 0.24
535 0.31
536 0.41
537 0.47
538 0.51
539 0.51
540 0.52
541 0.55
542 0.55
543 0.52
544 0.45
545 0.39
546 0.34
547 0.34
548 0.29
549 0.25
550 0.23
551 0.23
552 0.2
553 0.24
554 0.22
555 0.22
556 0.25
557 0.3
558 0.3
559 0.27
560 0.32
561 0.29
562 0.32
563 0.3
564 0.29
565 0.26
566 0.28
567 0.27
568 0.23
569 0.2
570 0.16
571 0.16
572 0.14
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.12
578 0.15
579 0.16
580 0.15
581 0.16
582 0.17
583 0.2
584 0.26
585 0.32
586 0.32
587 0.33
588 0.36
589 0.35
590 0.41
591 0.41
592 0.37
593 0.31
594 0.28
595 0.26
596 0.25
597 0.24
598 0.2
599 0.21
600 0.18
601 0.18
602 0.18
603 0.18
604 0.15
605 0.15
606 0.18
607 0.17
608 0.21
609 0.21
610 0.22
611 0.21
612 0.21
613 0.21
614 0.18
615 0.19
616 0.2
617 0.23
618 0.28
619 0.29
620 0.29
621 0.28
622 0.26
623 0.24
624 0.21
625 0.18
626 0.14
627 0.17
628 0.18
629 0.18
630 0.18
631 0.15
632 0.14
633 0.13
634 0.11
635 0.07
636 0.07